RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496281.1

RTEL1-TNFRSF6B-204, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 2

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 5,314 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 NCOA1Q15788 1441 aa21.72■■□□□ 1.07
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RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
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RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 UQCRHP07919 91 aa21.7■■□□□ 1.06
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 NEK4P51957 841 aa21.7■■□□□ 1.06
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RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 VPS37DQ86XT2 251 aa21.69■■□□□ 1.06
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RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa21.67■■□□□ 1.06
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RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa21.66■■□□□ 1.06
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RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 FSD1Q9BTV5 496 aa21.65■■□□□ 1.06
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RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 RAD21O60216 631 aa21.64■■□□□ 1.05
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 HSP90B2PQ58FF3 399 aa21.64■■□□□ 1.05
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ERICH2A1L162 156 aa21.64■■□□□ 1.05
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RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 NESP48681 1621 aa21.54■■□□□ 1.04
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RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ESCO1Q5FWF5 840 aa21.54■■□□□ 1.04
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 FIBPO43427 364 aa21.53■■□□□ 1.04
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa21.53■■□□□ 1.04
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CLCN1P35523 988 aa21.53■■□□□ 1.04
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CCT4P50991 539 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 C20orf194Q5TEA3 1177 aa21.52■■□□□ 1.03
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ANKRD1Q15327 319 aa21.51■■□□□ 1.03
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 KRT85P78386 507 aa21.51■■□□□ 1.03
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 RUFY1Q96T51 708 aa21.51■■□□□ 1.03
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ERC1Q8IUD2 1116 aa21.5■■□□□ 1.03
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 LRRCC1Q9C099 1032 aa21.5■■□□□ 1.03
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