RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494420.1

HOXB-AS3-215, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 2

Gene HOXB-AS3, Length 431 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa27.55■■■□□ 2
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HOXB-AS3-215ENST00000494420 TONSLQ96HA7 1378 aa27.53■■■□□ 2
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HOXB-AS3-215ENST00000494420 PRDM11Q9NQV5 511 aa27.48■■□□□ 1.99
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PLCH1Q4KWH8 1693 aa27.46■■□□□ 1.99
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HOXB-AS3-215ENST00000494420 CHRNA2Q15822 529 aa27.41■■□□□ 1.98
HOXB-AS3-215ENST00000494420 NLRP13Q86W25 1043 aa27.41■■□□□ 1.98
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HOXB-AS3-215ENST00000494420 A0A0G2JS52 829 aa27.4■■□□□ 1.98
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
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HOXB-AS3-215ENST00000494420 CCDC125Q86Z20 511 aa27.35■■□□□ 1.97
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HOXB-AS3-215ENST00000494420 USP19O94966 1318 aa27.34■■□□□ 1.97
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa27.34■■□□□ 1.97
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa27.34■■□□□ 1.97
HOXB-AS3-215ENST00000494420 KRT27Q7Z3Y8 459 aa27.33■■□□□ 1.97
HOXB-AS3-215ENST00000494420 NRAPQ86VF7 1730 aa27.33■■□□□ 1.96
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HOXB-AS3-215ENST00000494420 SSH2Q76I76 1423 aa27.27■■□□□ 1.96
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HOXB-AS3-215ENST00000494420 NRKQ7Z2Y5 1582 aa27.26■■□□□ 1.95
HOXB-AS3-215ENST00000494420 USP35Q9P2H5 1018 aa27.25■■□□□ 1.95
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HOXB-AS3-215ENST00000494420 TTC21AQ8NDW8 1320 aa27.22■■□□□ 1.95
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HOXB-AS3-215ENST00000494420 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP27.22■■□□□ 1.95
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
HOXB-AS3-215ENST00000494420 EP400Q96L91 3159 aa27.21■■□□□ 1.95
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa27.21■■□□□ 1.95
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa27.2■■□□□ 1.94
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SOX12O15370 315 aa27.19■■□□□ 1.94
HOXB-AS3-215ENST00000494420 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP27.19■■□□□ 1.94
HOXB-AS3-215ENST00000494420 FAM182BQ5T319 152 aa27.18■■□□□ 1.94
HOXB-AS3-215ENST00000494420 KCNH5Q8NCM2 988 aa27.18■■□□□ 1.94
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SLC24A1O60721 1099 aa27.17■■□□□ 1.94
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SLIT3O75094 1523 aa27.16■■□□□ 1.94
HOXB-AS3-215ENST00000494420 BARGINQ6ZT62 677 aa27.16■■□□□ 1.94
HOXB-AS3-215ENST00000494420 DEFB132Q7Z7B7 95 aa27.16■■□□□ 1.94
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TCP11L2Q8N4U5 519 aa27.16■■□□□ 1.94
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TESK2Q96S53 571 aa27.16■■□□□ 1.94
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PIK3C2AO00443 1686 aa27.16■■□□□ 1.94
HOXB-AS3-215ENST00000494420 AKAP12Q02952 1782 aa27.16■■□□□ 1.94
HOXB-AS3-215ENST00000494420 AATKQ6ZMQ8 1374 aa27.15■■□□□ 1.94
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HOXB-AS3-215ENST00000494420 ZRANB1Q9UGI0 708 aa27.15■■□□□ 1.94
HOXB-AS3-215ENST00000494420 LMO7Q8WWI1 1683 aa27.14■■□□□ 1.93
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa27.13■■□□□ 1.93
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ARHGEF25Q86VW2 580 aa27.12■■□□□ 1.93
HOXB-AS3-215ENST00000494420 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CLSPNQ9HAW4 1339 aa27.12■■□□□ 1.93
HOXB-AS3-215ENST00000494420 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
HOXB-AS3-215ENST00000494420 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa27.11■■□□□ 1.93
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PDE3BQ13370 1112 aa27.11■■□□□ 1.93
HOXB-AS3-215ENST00000494420 NME9Q86XW9 330 aa27.11■■□□□ 1.93
HOXB-AS3-215ENST00000494420 AXIN2Q9Y2T1 843 aa27.1■■□□□ 1.93
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CD163L1Q9NR16 1453 aa27.1■■□□□ 1.93
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa27.09■■□□□ 1.93
HOXB-AS3-215ENST00000494420 BAG6P46379 1132 aa27.08■■□□□ 1.93
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HOXB-AS3-215ENST00000494420 CRB1P82279 1406 aa27.07■■□□□ 1.92
HOXB-AS3-215ENST00000494420 FAM196AQ6ZSG2 479 aa27.07■■□□□ 1.92
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