RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491139.5

NELFE-210, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-210ENST00000491139 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa30.74■■■□□ 2.51
NELFE-210ENST00000491139 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa30.74■■■□□ 2.51
NELFE-210ENST00000491139 PRR36Q9H6K5 1346 aa30.74■■■□□ 2.51
NELFE-210ENST00000491139 ADGRB1O14514 1584 aa30.74■■■□□ 2.51
NELFE-210ENST00000491139 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP30.73■■■□□ 2.51
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NELFE-210ENST00000491139 FAM182BQ5T319 152 aa30.72■■■□□ 2.51
NELFE-210ENST00000491139 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP30.71■■■□□ 2.51
NELFE-210ENST00000491139 TULP4Q9NRJ4 1543 aa30.71■■■□□ 2.51
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NELFE-210ENST00000491139 RGPD1P0DJD0 1748 aa30.7■■■□□ 2.5
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NELFE-210ENST00000491139 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa30.62■■■□□ 2.49
NELFE-210ENST00000491139 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa30.62■■■□□ 2.49
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NELFE-210ENST00000491139 NUTM2GQ5VZR2 741 aa30.52■■■□□ 2.48
NELFE-210ENST00000491139 EVA1CP58658 441 aa30.51■■■□□ 2.47
NELFE-210ENST00000491139 USP35Q9P2H5 1018 aa30.51■■■□□ 2.47
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NELFE-210ENST00000491139 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP30.48■■■□□ 2.47
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NELFE-210ENST00000491139 BARGINQ6ZT62 677 aa30.48■■■□□ 2.47
NELFE-210ENST00000491139 NBPF8Q3BBV2 869 aa30.46■■■□□ 2.47
NELFE-210ENST00000491139 ACEP12821 1306 aa30.46■■■□□ 2.47
NELFE-210ENST00000491139 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP30.45■■■□□ 2.47
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NELFE-210ENST00000491139 TCP11L2Q8N4U5 519 aa30.42■■■□□ 2.46
NELFE-210ENST00000491139 ABTB2Q8N961 1025 aa30.42■■■□□ 2.46
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NELFE-210ENST00000491139 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa30.39■■■□□ 2.45
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NELFE-210ENST00000491139 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa30.37■■■□□ 2.45
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NELFE-210ENST00000491139 USP19O94966 1318 aa30.35■■■□□ 2.45
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NELFE-210ENST00000491139 NUP188Q5SRE5 1749 aa30.32■■■□□ 2.44
NELFE-210ENST00000491139 LMO7Q8WWI1 1683 aa30.32■■■□□ 2.44
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NELFE-210ENST00000491139 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP30.28■■■□□ 2.44
NELFE-210ENST00000491139 SPON1Q9HCB6 807 aa30.27■■■□□ 2.44
NELFE-210ENST00000491139 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa30.26■■■□□ 2.43
NELFE-210ENST00000491139 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP30.26■■■□□ 2.43
NELFE-210ENST00000491139 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP30.25■■■□□ 2.43
NELFE-210ENST00000491139 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa30.25■■■□□ 2.43
NELFE-210ENST00000491139 YY1P25490 414 aa30.25■■■□□ 2.43
NELFE-210ENST00000491139 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP30.25■■■□□ 2.43
NELFE-210ENST00000491139 NBPF1Q3BBV0 1214 aa30.24■■■□□ 2.43
NELFE-210ENST00000491139 CRB1P82279 1406 aa30.23■■■□□ 2.43
NELFE-210ENST00000491139 KCNQ2O43526 872 aa30.23■■■□□ 2.43
NELFE-210ENST00000491139 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP30.23■■■□□ 2.43
NELFE-210ENST00000491139 ZBTB7CA1YPR0 619 aa30.22■■■□□ 2.43
NELFE-210ENST00000491139 CABP2Q9NPB3 220 aa30.22■■■□□ 2.43
NELFE-210ENST00000491139 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa30.21■■■□□ 2.43
NELFE-210ENST00000491139 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa30.21■■■□□ 2.43
NELFE-210ENST00000491139 OVOS2Q6IE36 1432 aa30.21■■■□□ 2.43
NELFE-210ENST00000491139 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP30.21■■■□□ 2.43
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NELFE-210ENST00000491139 NLRP6P59044 892 aa30.19■■■□□ 2.42
NELFE-210ENST00000491139 AATKQ6ZMQ8 1374 aa30.18■■■□□ 2.42
NELFE-210ENST00000491139 PLSCR1O15162 318 aa30.17■■■□□ 2.42
NELFE-210ENST00000491139 DDB1Q16531 1140 aa30.17■■■□□ 2.42
NELFE-210ENST00000491139 CABP1Q9NZU7 370 aa30.16■■■□□ 2.42
NELFE-210ENST00000491139 NINLQ9Y2I6 1382 aa30.15■■■□□ 2.42
NELFE-210ENST00000491139 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa30.15■■■□□ 2.42
NELFE-210ENST00000491139 USP6P35125 1406 aa30.14■■■□□ 2.42
NELFE-210ENST00000491139 PEAK1Q9H792 1746 aa30.14■■■□□ 2.42
NELFE-210ENST00000491139 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP30.12■■■□□ 2.41
NELFE-210ENST00000491139 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP30.11■■■□□ 2.41
NELFE-210ENST00000491139 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa30.11■■■□□ 2.41
NELFE-210ENST00000491139 SLIT3O75094 1523 aa30.11■■■□□ 2.41
NELFE-210ENST00000491139 LRRC37A3O60309 1634 aa30.11■■■□□ 2.41
NELFE-210ENST00000491139 SBF2Q86WG5 1849 aa30.1■■■□□ 2.41
NELFE-210ENST00000491139 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP30.09■■■□□ 2.41
NELFE-210ENST00000491139 WDR17Q8IZU2 1322 aa30.08■■■□□ 2.41
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