RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490386.1

CLEC3B-203, Transcript of C-type lectin domain family 3 member B, humanhuman

TSL 3

Gene CLEC3B, Length 708 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC3B-203ENST00000490386 ALS2Q96Q42 1657 aa41.44■■■■■ 4.22
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CLEC3B-203ENST00000490386 CCDC125Q86Z20 511 aa41.41■■■■■ 4.22
CLEC3B-203ENST00000490386 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP41.4■■■■■ 4.22
CLEC3B-203ENST00000490386 BTG4Q9NY30 223 aa41.39■■■■■ 4.22
CLEC3B-203ENST00000490386 ABCA3Q99758 1704 aa41.38■■■■■ 4.21
CLEC3B-203ENST00000490386 NWD2Q9ULI1 1742 aa41.38■■■■■ 4.21
CLEC3B-203ENST00000490386 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP41.37■■■■■ 4.21
CLEC3B-203ENST00000490386 CABP2Q9NPB3 220 aa41.37■■■■■ 4.21
CLEC3B-203ENST00000490386 GLI3P10071 1580 aa41.35■■■■■ 4.21
CLEC3B-203ENST00000490386 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP41.34■■■■■ 4.21
CLEC3B-203ENST00000490386 SEPT12Q8IYM1 358 aa41.34■■■■■ 4.21
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CLEC3B-203ENST00000490386 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa41.32■■■■■ 4.21
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CLEC3B-203ENST00000490386 PLCH1Q4KWH8 1693 aa41.3■■■■■ 4.2
CLEC3B-203ENST00000490386 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa41.3■■■■■ 4.2
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CLEC3B-203ENST00000490386 QRICH2Q9H0J4 1663 aa41.23■■■■■ 4.19
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CLEC3B-203ENST00000490386 TONSLQ96HA7 1378 aa41.2■■■■■ 4.19
CLEC3B-203ENST00000490386 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa41.19■■■■■ 4.19
CLEC3B-203ENST00000490386 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa41.19■■■■■ 4.19
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CLEC3B-203ENST00000490386 CHRNA2Q15822 529 aa41.16■■■■■ 4.18
CLEC3B-203ENST00000490386 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP41.16■■■■■ 4.18
CLEC3B-203ENST00000490386 USP19O94966 1318 aa41.16■■■■■ 4.18
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CLEC3B-203ENST00000490386 NRAPQ86VF7 1730 aa41.14■■■■■ 4.18
CLEC3B-203ENST00000490386 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP41.13■■■■■ 4.17
CLEC3B-203ENST00000490386 EP400Q96L91 3159 aa41.13■■■■■ 4.17
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CLEC3B-203ENST00000490386 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP41.1■■■■■ 4.17
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CLEC3B-203ENST00000490386 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa41.08■■■■■ 4.17
CLEC3B-203ENST00000490386 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa41.08■■■■■ 4.17
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CLEC3B-203ENST00000490386 BRWD3Q6RI45 1802 aa41.02■■■■■ 4.16
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CLEC3B-203ENST00000490386 TTC21AQ8NDW8 1320 aa40.96■■■■■ 4.15
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CLEC3B-203ENST00000490386 KCNH5Q8NCM2 988 aa40.92■■■■■ 4.14
CLEC3B-203ENST00000490386 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP40.92■■■■■ 4.14
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CLEC3B-203ENST00000490386 TCP11L2Q8N4U5 519 aa40.91■■■■■ 4.14
CLEC3B-203ENST00000490386 AATKQ6ZMQ8 1374 aa40.9■■■■■ 4.14
CLEC3B-203ENST00000490386 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP40.9■■■■■ 4.14
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CLEC3B-203ENST00000490386 SLIT3O75094 1523 aa40.87■■■■■ 4.13
CLEC3B-203ENST00000490386 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa40.86■■■■■ 4.13
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CLEC3B-203ENST00000490386 LMO7Q8WWI1 1683 aa40.85■■■■■ 4.13
CLEC3B-203ENST00000490386 TMC1Q8TDI8 760 aa40.83■■■■■ 4.13
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CLEC3B-203ENST00000490386 FAM182BQ5T319 152 aa40.82■■■■■ 4.13
CLEC3B-203ENST00000490386 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP40.82■■■■■ 4.13
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CLEC3B-203ENST00000490386 PIK3C2AO00443 1686 aa40.78■■■■■ 4.12
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CLEC3B-203ENST00000490386 CRB1P82279 1406 aa40.77■■■■■ 4.12
CLEC3B-203ENST00000490386 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa40.77■■■■■ 4.12
CLEC3B-203ENST00000490386 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa40.77■■■■■ 4.12
CLEC3B-203ENST00000490386 AKAP12Q02952 1782 aa40.76■■■■■ 4.12
CLEC3B-203ENST00000490386 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP40.74■■■■■ 4.11
CLEC3B-203ENST00000490386 TESK2Q96S53 571 aa40.74■■■■■ 4.11
CLEC3B-203ENST00000490386 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa40.73■■■■■ 4.11
CLEC3B-203ENST00000490386 USP31Q70CQ4 1352 aa40.73■■■■■ 4.11
CLEC3B-203ENST00000490386 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP40.72■■■■■ 4.11
CLEC3B-203ENST00000490386 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa40.72■■■■■ 4.11
CLEC3B-203ENST00000490386 AXIN2Q9Y2T1 843 aa40.72■■■■■ 4.11
CLEC3B-203ENST00000490386 SOX12O15370 315 aa40.7■■■■■ 4.11
CLEC3B-203ENST00000490386 WDR17Q8IZU2 1322 aa40.69■■■■■ 4.11
CLEC3B-203ENST00000490386 NINLQ9Y2I6 1382 aa40.69■■■■■ 4.1
CLEC3B-203ENST00000490386 CD163L1Q9NR16 1453 aa40.69■■■■■ 4.1
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