RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489650.1

PTPRN-217, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRN, Length 571 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-217ENST00000489650 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
PTPRN-217ENST00000489650 TULP4Q9NRJ4 1543 aa27.1■■□□□ 1.93
PTPRN-217ENST00000489650 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
PTPRN-217ENST00000489650 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
PTPRN-217ENST00000489650 FAM182BQ5T319 152 aa27.05■■□□□ 1.92
PTPRN-217ENST00000489650 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
PTPRN-217ENST00000489650 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa27.03■■□□□ 1.92
PTPRN-217ENST00000489650 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
PTPRN-217ENST00000489650 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa27.01■■□□□ 1.91
PTPRN-217ENST00000489650 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa27.01■■□□□ 1.91
PTPRN-217ENST00000489650 BAG6P46379 1132 aa27.01■■□□□ 1.91
PTPRN-217ENST00000489650 PRDM11Q9NQV5 511 aa27.01■■□□□ 1.91
PTPRN-217ENST00000489650 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
PTPRN-217ENST00000489650 NUTM2GQ5VZR2 741 aa26.99■■□□□ 1.91
PTPRN-217ENST00000489650 STAC3Q96MF2 364 aa26.99■■□□□ 1.91
PTPRN-217ENST00000489650 CHRNA2Q15822 529 aa26.98■■□□□ 1.91
PTPRN-217ENST00000489650 CDK19Q9BWU1 502 aa26.98■■□□□ 1.91
PTPRN-217ENST00000489650 ITSN1Q15811 1721 aa26.97■■□□□ 1.91
PTPRN-217ENST00000489650 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
PTPRN-217ENST00000489650 ATP7BP35670 1465 aa26.97■■□□□ 1.91
PTPRN-217ENST00000489650 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
PTPRN-217ENST00000489650 STRN4Q9NRL3 753 aa26.95■■□□□ 1.9
PTPRN-217ENST00000489650 KIAA0232Q92628 1395 aa26.95■■□□□ 1.9
PTPRN-217ENST00000489650 HRCP23327 699 aa26.92■■□□□ 1.9
PTPRN-217ENST00000489650 RGPD1P0DJD0 1748 aa26.92■■□□□ 1.9
PTPRN-217ENST00000489650 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa26.92■■□□□ 1.9
PTPRN-217ENST00000489650 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa26.91■■□□□ 1.9
PTPRN-217ENST00000489650 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
PTPRN-217ENST00000489650 ACEP12821 1306 aa26.9■■□□□ 1.9
PTPRN-217ENST00000489650 NBPF8Q3BBV2 869 aa26.9■■□□□ 1.9
PTPRN-217ENST00000489650 USP35Q9P2H5 1018 aa26.88■■□□□ 1.89
PTPRN-217ENST00000489650 NBPF1Q3BBV0 1214 aa26.87■■□□□ 1.89
PTPRN-217ENST00000489650 CCDC61Q9Y6R9 512 aa26.87■■□□□ 1.89
PTPRN-217ENST00000489650 LRP5O75197 1615 aa26.87■■□□□ 1.89
PTPRN-217ENST00000489650 EVA1CP58658 441 aa26.86■■□□□ 1.89
PTPRN-217ENST00000489650 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
PTPRN-217ENST00000489650 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa26.85■■□□□ 1.89
PTPRN-217ENST00000489650 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
PTPRN-217ENST00000489650 TRIM37O94972 964 aa26.85■■□□□ 1.89
PTPRN-217ENST00000489650 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
PTPRN-217ENST00000489650 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
PTPRN-217ENST00000489650 PLEKHG3A1L390 1219 aa26.84■■□□□ 1.89
PTPRN-217ENST00000489650 ABTB2Q8N961 1025 aa26.84■■□□□ 1.89
PTPRN-217ENST00000489650 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa26.82■■□□□ 1.88
PTPRN-217ENST00000489650 FAM196AQ6ZSG2 479 aa26.81■■□□□ 1.88
PTPRN-217ENST00000489650 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
PTPRN-217ENST00000489650 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
PTPRN-217ENST00000489650 CABP2Q9NPB3 220 aa26.79■■□□□ 1.88
PTPRN-217ENST00000489650 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa26.79■■□□□ 1.88
PTPRN-217ENST00000489650 APBA3O96018 575 aa26.78■■□□□ 1.88
PTPRN-217ENST00000489650 CAMKK2Q96RR4 588 aa26.78■■□□□ 1.88
PTPRN-217ENST00000489650 DISP2A7MBM2 1401 aa26.78■■□□□ 1.88
PTPRN-217ENST00000489650 SSH2Q76I76 1423 aa26.78■■□□□ 1.88
PTPRN-217ENST00000489650 NRKQ7Z2Y5 1582 aa26.78■■□□□ 1.88
PTPRN-217ENST00000489650 PDE3BQ13370 1112 aa26.76■■□□□ 1.87
PTPRN-217ENST00000489650 BARGINQ6ZT62 677 aa26.76■■□□□ 1.87
PTPRN-217ENST00000489650 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa26.75■■□□□ 1.87
PTPRN-217ENST00000489650 NLRP13Q86W25 1043 aa26.74■■□□□ 1.87
PTPRN-217ENST00000489650 USP19O94966 1318 aa26.73■■□□□ 1.87
PTPRN-217ENST00000489650 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
PTPRN-217ENST00000489650 ZBTB7CA1YPR0 619 aa26.73■■□□□ 1.87
PTPRN-217ENST00000489650 GCP02774 474 aa26.73■■□□□ 1.87
PTPRN-217ENST00000489650 TCP11L2Q8N4U5 519 aa26.73■■□□□ 1.87
PTPRN-217ENST00000489650 LMO7Q8WWI1 1683 aa26.72■■□□□ 1.87
PTPRN-217ENST00000489650 CPDO75976 1380 aa26.71■■□□□ 1.87
PTPRN-217ENST00000489650 CABP1Q9NZU7 370 aa26.69■■□□□ 1.86
PTPRN-217ENST00000489650 QRICH2Q9H0J4 1663 aa26.68■■□□□ 1.86
PTPRN-217ENST00000489650 NLRP6P59044 892 aa26.66■■□□□ 1.86
PTPRN-217ENST00000489650 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
PTPRN-217ENST00000489650 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
PTPRN-217ENST00000489650 RREB1Q92766 1687 aa26.63■■□□□ 1.85
PTPRN-217ENST00000489650 PARD3Q8TEW0 1356 aa26.63■■□□□ 1.85
PTPRN-217ENST00000489650 L3MBTL2Q969R5 705 aa26.62■■□□□ 1.85
PTPRN-217ENST00000489650 USP6P35125 1406 aa26.62■■□□□ 1.85
PTPRN-217ENST00000489650 NUP188Q5SRE5 1749 aa26.62■■□□□ 1.85
PTPRN-217ENST00000489650 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
PTPRN-217ENST00000489650 NBPF14Q5TI25 921 aa26.6■■□□□ 1.85
PTPRN-217ENST00000489650 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
PTPRN-217ENST00000489650 CRB1P82279 1406 aa26.59■■□□□ 1.85
PTPRN-217ENST00000489650 SIN3AQ96ST3 1273 aa26.58■■□□□ 1.85
PTPRN-217ENST00000489650 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa26.57■■□□□ 1.84
PTPRN-217ENST00000489650 AATKQ6ZMQ8 1374 aa26.57■■□□□ 1.84
PTPRN-217ENST00000489650 SLIT3O75094 1523 aa26.56■■□□□ 1.84
PTPRN-217ENST00000489650 AXIN2Q9Y2T1 843 aa26.56■■□□□ 1.84
PTPRN-217ENST00000489650 PIK3C2AO00443 1686 aa26.55■■□□□ 1.84
PTPRN-217ENST00000489650 EVC2Q86UK5 1308 aa26.55■■□□□ 1.84
PTPRN-217ENST00000489650 COL18A1P39060 1754 aa26.54■■□□□ 1.84
PTPRN-217ENST00000489650 DDB1Q16531 1140 aa26.54■■□□□ 1.84
PTPRN-217ENST00000489650 SOX12O15370 315 aa26.53■■□□□ 1.84
PTPRN-217ENST00000489650 NEUROD1Q13562 356 aa26.52■■□□□ 1.84
PTPRN-217ENST00000489650 SBF2Q86WG5 1849 aa26.52■■□□□ 1.84
PTPRN-217ENST00000489650 PEAK1Q9H792 1746 aa26.52■■□□□ 1.84
PTPRN-217ENST00000489650 RGPD5Q99666 1765 aa26.51■■□□□ 1.83
PTPRN-217ENST00000489650 LRRC37A3O60309 1634 aa26.51■■□□□ 1.83
PTPRN-217ENST00000489650 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa26.51■■□□□ 1.83
PTPRN-217ENST00000489650 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa26.51■■□□□ 1.83
PTPRN-217ENST00000489650 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa26.51■■□□□ 1.83
PTPRN-217ENST00000489650 OVOS2Q6IE36 1432 aa26.51■■□□□ 1.83
PTPRN-217ENST00000489650 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa26.51■■□□□ 1.83
PTPRN-217ENST00000489650 PTF1AQ7RTS3 328 aa26.51■■□□□ 1.83
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