RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489435.2

DNAJA4-210, Transcript of DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member A4, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene DNAJA4, Length 947 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA4-210ENST00000489435 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP29.06■■■□□ 2.24
DNAJA4-210ENST00000489435 PLEKHG3A1L390 1219 aa29.06■■■□□ 2.24
DNAJA4-210ENST00000489435 ATRNO75882 1429 aa29.03■■■□□ 2.24
DNAJA4-210ENST00000489435 BCL9LQ86UU0 1499 aa29.01■■■□□ 2.23
DNAJA4-210ENST00000489435 SLIT2O94813 1529 aa28.99■■■□□ 2.23
DNAJA4-210ENST00000489435 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
DNAJA4-210ENST00000489435 RGS12O14924 1447 aa28.97■■■□□ 2.23
DNAJA4-210ENST00000489435 UNC5CLQ8IV45 518 aa28.97■■■□□ 2.23
DNAJA4-210ENST00000489435 CABP1Q9NZU7 370 aa28.97■■■□□ 2.23
DNAJA4-210ENST00000489435 PLCH1Q4KWH8 1693 aa28.96■■■□□ 2.23
DNAJA4-210ENST00000489435 CLSPNQ9HAW4 1339 aa28.95■■■□□ 2.23
DNAJA4-210ENST00000489435 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa28.95■■■□□ 2.22
DNAJA4-210ENST00000489435 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa28.94■■■□□ 2.22
DNAJA4-210ENST00000489435 NWD2Q9ULI1 1742 aa28.93■■■□□ 2.22
DNAJA4-210ENST00000489435 ATAD2Q6PL18 1390 aa28.92■■■□□ 2.22
DNAJA4-210ENST00000489435 NUTM2GQ5VZR2 741 aa28.92■■■□□ 2.22
DNAJA4-210ENST00000489435 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP28.91■■■□□ 2.22
DNAJA4-210ENST00000489435 FAM83GA6ND36 823 aa28.91■■■□□ 2.22
DNAJA4-210ENST00000489435 ABTB2Q8N961 1025 aa28.91■■■□□ 2.22
DNAJA4-210ENST00000489435 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP28.91■■■□□ 2.22
DNAJA4-210ENST00000489435 USP6P35125 1406 aa28.89■■■□□ 2.22
DNAJA4-210ENST00000489435 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
DNAJA4-210ENST00000489435 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
DNAJA4-210ENST00000489435 PRDM11Q9NQV5 511 aa28.87■■■□□ 2.21
DNAJA4-210ENST00000489435 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa28.86■■■□□ 2.21
DNAJA4-210ENST00000489435 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
DNAJA4-210ENST00000489435 VPS72Q15906 364 aa28.85■■■□□ 2.21
DNAJA4-210ENST00000489435 NLRP13Q86W25 1043 aa28.84■■■□□ 2.21
DNAJA4-210ENST00000489435 BTG4Q9NY30 223 aa28.84■■■□□ 2.21
DNAJA4-210ENST00000489435 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP28.83■■■□□ 2.21
DNAJA4-210ENST00000489435 GLI3P10071 1580 aa28.83■■■□□ 2.21
DNAJA4-210ENST00000489435 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP28.82■■■□□ 2.2
DNAJA4-210ENST00000489435 KIAA0232Q92628 1395 aa28.82■■■□□ 2.2
DNAJA4-210ENST00000489435 AKAP12Q02952 1782 aa28.81■■■□□ 2.2
DNAJA4-210ENST00000489435 NRAPQ86VF7 1730 aa28.81■■■□□ 2.2
DNAJA4-210ENST00000489435 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP28.81■■■□□ 2.2
DNAJA4-210ENST00000489435 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP28.81■■■□□ 2.2
DNAJA4-210ENST00000489435 NRKQ7Z2Y5 1582 aa28.8■■■□□ 2.2
DNAJA4-210ENST00000489435 USP19O94966 1318 aa28.8■■■□□ 2.2
DNAJA4-210ENST00000489435 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa28.8■■■□□ 2.2
DNAJA4-210ENST00000489435 SLC24A1O60721 1099 aa28.78■■■□□ 2.2
DNAJA4-210ENST00000489435 NLRP6P59044 892 aa28.78■■■□□ 2.2
DNAJA4-210ENST00000489435 CHRNA2Q15822 529 aa28.78■■■□□ 2.2
DNAJA4-210ENST00000489435 SSH2Q76I76 1423 aa28.77■■■□□ 2.2
DNAJA4-210ENST00000489435 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
DNAJA4-210ENST00000489435 TMC1Q8TDI8 760 aa28.77■■■□□ 2.2
DNAJA4-210ENST00000489435 USP47Q96K76 1375 aa28.76■■■□□ 2.2
DNAJA4-210ENST00000489435 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP28.76■■■□□ 2.19
DNAJA4-210ENST00000489435 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa28.75■■■□□ 2.19
DNAJA4-210ENST00000489435 TTC21AQ8NDW8 1320 aa28.74■■■□□ 2.19
DNAJA4-210ENST00000489435 GCP02774 474 aa28.74■■■□□ 2.19
DNAJA4-210ENST00000489435 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP28.74■■■□□ 2.19
DNAJA4-210ENST00000489435 TESK2Q96S53 571 aa28.74■■■□□ 2.19
DNAJA4-210ENST00000489435 PIK3C2AO00443 1686 aa28.74■■■□□ 2.19
DNAJA4-210ENST00000489435 CPDO75976 1380 aa28.73■■■□□ 2.19
DNAJA4-210ENST00000489435 MON2Q7Z3U7 1717 aa28.72■■■□□ 2.19
DNAJA4-210ENST00000489435 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP28.72■■■□□ 2.19
DNAJA4-210ENST00000489435 SEPT12Q8IYM1 358 aa28.71■■■□□ 2.19
DNAJA4-210ENST00000489435 A0A0G2JS52 829 aa28.7■■■□□ 2.18
DNAJA4-210ENST00000489435 MYT1Q01538 1121 aa28.7■■■□□ 2.18
DNAJA4-210ENST00000489435 STRN4Q9NRL3 753 aa28.7■■■□□ 2.18
DNAJA4-210ENST00000489435 SLIT3O75094 1523 aa28.69■■■□□ 2.18
DNAJA4-210ENST00000489435 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa28.69■■■□□ 2.18
DNAJA4-210ENST00000489435 TERF2IPQ9NYB0 399 aa28.68■■■□□ 2.18
DNAJA4-210ENST00000489435 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa28.68■■■□□ 2.18
DNAJA4-210ENST00000489435 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa28.68■■■□□ 2.18
DNAJA4-210ENST00000489435 ZBTB7CA1YPR0 619 aa28.67■■■□□ 2.18
DNAJA4-210ENST00000489435 EVA1CP58658 441 aa28.67■■■□□ 2.18
DNAJA4-210ENST00000489435 TMF1P82094 1093 aa28.67■■■□□ 2.18
DNAJA4-210ENST00000489435 CD163L1Q9NR16 1453 aa28.66■■■□□ 2.18
DNAJA4-210ENST00000489435 NINLQ9Y2I6 1382 aa28.66■■■□□ 2.18
DNAJA4-210ENST00000489435 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP28.66■■■□□ 2.18
DNAJA4-210ENST00000489435 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
DNAJA4-210ENST00000489435 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP28.66■■■□□ 2.18
DNAJA4-210ENST00000489435 BRWD3Q6RI45 1802 aa28.64■■■□□ 2.18
DNAJA4-210ENST00000489435 LMO7Q8WWI1 1683 aa28.64■■■□□ 2.18
DNAJA4-210ENST00000489435 KCNH5Q8NCM2 988 aa28.64■■■□□ 2.18
DNAJA4-210ENST00000489435 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa28.63■■■□□ 2.17
DNAJA4-210ENST00000489435 A0A1W2PP64 1363 aa28.62■■■□□ 2.17
DNAJA4-210ENST00000489435 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP28.62■■■□□ 2.17
DNAJA4-210ENST00000489435 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa28.61■■■□□ 2.17
DNAJA4-210ENST00000489435 SOX12O15370 315 aa28.6■■■□□ 2.17
DNAJA4-210ENST00000489435 KRT27Q7Z3Y8 459 aa28.6■■■□□ 2.17
DNAJA4-210ENST00000489435 CDCA8Q53HL2 280 aa28.59■■■□□ 2.17
DNAJA4-210ENST00000489435 AATKQ6ZMQ8 1374 aa28.59■■■□□ 2.17
DNAJA4-210ENST00000489435 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
DNAJA4-210ENST00000489435 NME9Q86XW9 330 aa28.57■■■□□ 2.16
DNAJA4-210ENST00000489435 USP35Q9P2H5 1018 aa28.57■■■□□ 2.16
DNAJA4-210ENST00000489435 USP31Q70CQ4 1352 aa28.57■■■□□ 2.16
DNAJA4-210ENST00000489435 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP28.56■■■□□ 2.16
DNAJA4-210ENST00000489435 ZRANB1Q9UGI0 708 aa28.55■■■□□ 2.16
DNAJA4-210ENST00000489435 USP54Q70EL1 1684 aa28.54■■■□□ 2.16
DNAJA4-210ENST00000489435 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa28.54■■■□□ 2.16
DNAJA4-210ENST00000489435 ARHGEF25Q86VW2 580 aa28.54■■■□□ 2.16
DNAJA4-210ENST00000489435 CCDC125Q86Z20 511 aa28.54■■■□□ 2.16
DNAJA4-210ENST00000489435 NFAT5O94916 1531 aa28.53■■■□□ 2.16
DNAJA4-210ENST00000489435 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa28.52■■■□□ 2.16
DNAJA4-210ENST00000489435 TCP11L2Q8N4U5 519 aa28.51■■■□□ 2.15
DNAJA4-210ENST00000489435 COL18A1P39060 1754 aa28.51■■■□□ 2.15
DNAJA4-210ENST00000489435 BARGINQ6ZT62 677 aa28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms