RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489379.1

EHD1-211, Transcript of EH domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene EHD1, Length 588 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD1-211ENST00000489379 RXRBP28702 533 aa34.44■■■■□ 3.1
EHD1-211ENST00000489379 USP21Q9UK80 565 aa34.43■■■■□ 3.1
EHD1-211ENST00000489379 ATAD2Q6PL18 1390 aa34.43■■■■□ 3.1
EHD1-211ENST00000489379 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP34.42■■■■□ 3.1
EHD1-211ENST00000489379 CABP1Q9NZU7 370 aa34.41■■■■□ 3.1
EHD1-211ENST00000489379 CABLES1Q8TDN4 633 aa34.4■■■■□ 3.1
EHD1-211ENST00000489379 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP34.39■■■■□ 3.1
EHD1-211ENST00000489379 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP34.39■■■■□ 3.1
EHD1-211ENST00000489379 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP34.38■■■■□ 3.09
EHD1-211ENST00000489379 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP34.36■■■■□ 3.09
EHD1-211ENST00000489379 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP34.36■■■■□ 3.09
EHD1-211ENST00000489379 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP34.35■■■■□ 3.09
EHD1-211ENST00000489379 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa34.34■■■■□ 3.09
EHD1-211ENST00000489379 SLIT2O94813 1529 aa34.34■■■■□ 3.09
EHD1-211ENST00000489379 BCL9LQ86UU0 1499 aa34.33■■■■□ 3.09
EHD1-211ENST00000489379 NWD2Q9ULI1 1742 aa34.33■■■■□ 3.09
EHD1-211ENST00000489379 ATRNO75882 1429 aa34.32■■■■□ 3.08
EHD1-211ENST00000489379 USP6P35125 1406 aa34.32■■■■□ 3.08
EHD1-211ENST00000489379 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa34.31■■■■□ 3.08
EHD1-211ENST00000489379 PLEKHG5O94827 1062 aa34.3■■■■□ 3.08
EHD1-211ENST00000489379 UNC5CLQ8IV45 518 aa34.3■■■■□ 3.08
EHD1-211ENST00000489379 ABTB2Q8N961 1025 aa34.3■■■■□ 3.08
EHD1-211ENST00000489379 AKAP12Q02952 1782 aa34.3■■■■□ 3.08
EHD1-211ENST00000489379 USP47Q96K76 1375 aa34.27■■■■□ 3.08
EHD1-211ENST00000489379 TESK2Q96S53 571 aa34.27■■■■□ 3.08
EHD1-211ENST00000489379 PLCH1Q4KWH8 1693 aa34.27■■■■□ 3.08
EHD1-211ENST00000489379 NLRP13Q86W25 1043 aa34.26■■■■□ 3.08
EHD1-211ENST00000489379 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP34.26■■■■□ 3.07
EHD1-211ENST00000489379 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP34.26■■■■□ 3.07
EHD1-211ENST00000489379 FAM83GA6ND36 823 aa34.24■■■■□ 3.07
EHD1-211ENST00000489379 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP34.23■■■■□ 3.07
EHD1-211ENST00000489379 SSH2Q76I76 1423 aa34.23■■■■□ 3.07
EHD1-211ENST00000489379 NUTM2GQ5VZR2 741 aa34.21■■■■□ 3.07
EHD1-211ENST00000489379 USP19O94966 1318 aa34.21■■■■□ 3.07
EHD1-211ENST00000489379 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP34.2■■■■□ 3.07
EHD1-211ENST00000489379 TTC21AQ8NDW8 1320 aa34.19■■■■□ 3.06
EHD1-211ENST00000489379 NINLQ9Y2I6 1382 aa34.19■■■■□ 3.06
EHD1-211ENST00000489379 PRDM11Q9NQV5 511 aa34.18■■■■□ 3.06
EHD1-211ENST00000489379 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP34.18■■■■□ 3.06
EHD1-211ENST00000489379 MON2Q7Z3U7 1717 aa34.18■■■■□ 3.06
EHD1-211ENST00000489379 TMF1P82094 1093 aa34.17■■■■□ 3.06
EHD1-211ENST00000489379 RGS12O14924 1447 aa34.16■■■■□ 3.06
EHD1-211ENST00000489379 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa34.16■■■■□ 3.06
EHD1-211ENST00000489379 VPS72Q15906 364 aa34.16■■■■□ 3.06
EHD1-211ENST00000489379 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP34.16■■■■□ 3.06
EHD1-211ENST00000489379 TMC1Q8TDI8 760 aa34.16■■■■□ 3.06
EHD1-211ENST00000489379 NLRP6P59044 892 aa34.15■■■■□ 3.06
EHD1-211ENST00000489379 TERF2IPQ9NYB0 399 aa34.15■■■■□ 3.06
EHD1-211ENST00000489379 CDCA8Q53HL2 280 aa34.14■■■■□ 3.06
EHD1-211ENST00000489379 BTG4Q9NY30 223 aa34.14■■■■□ 3.06
EHD1-211ENST00000489379 NRKQ7Z2Y5 1582 aa34.14■■■■□ 3.06
EHD1-211ENST00000489379 NRAPQ86VF7 1730 aa34.13■■■■□ 3.05
EHD1-211ENST00000489379 KIAA0232Q92628 1395 aa34.13■■■■□ 3.05
EHD1-211ENST00000489379 PIK3C2AO00443 1686 aa34.12■■■■□ 3.05
EHD1-211ENST00000489379 CPDO75976 1380 aa34.12■■■■□ 3.05
EHD1-211ENST00000489379 GCP02774 474 aa34.12■■■■□ 3.05
EHD1-211ENST00000489379 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa34.11■■■■□ 3.05
EHD1-211ENST00000489379 CD163L1Q9NR16 1453 aa34.1■■■■□ 3.05
EHD1-211ENST00000489379 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP34.1■■■■□ 3.05
EHD1-211ENST00000489379 GLI3P10071 1580 aa34.09■■■■□ 3.05
EHD1-211ENST00000489379 SLIT3O75094 1523 aa34.09■■■■□ 3.05
EHD1-211ENST00000489379 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP34.06■■■■□ 3.04
EHD1-211ENST00000489379 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP34.05■■■■□ 3.04
EHD1-211ENST00000489379 KCNH5Q8NCM2 988 aa34.05■■■■□ 3.04
EHD1-211ENST00000489379 CHRNA2Q15822 529 aa34.03■■■■□ 3.04
EHD1-211ENST00000489379 A0A1W2PP64 1363 aa34.02■■■■□ 3.04
EHD1-211ENST00000489379 USP54Q70EL1 1684 aa34.01■■■■□ 3.04
EHD1-211ENST00000489379 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP34.01■■■■□ 3.03
EHD1-211ENST00000489379 USP31Q70CQ4 1352 aa34■■■■□ 3.03
EHD1-211ENST00000489379 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP34■■■■□ 3.03
EHD1-211ENST00000489379 LMO7Q8WWI1 1683 aa33.99■■■■□ 3.03
EHD1-211ENST00000489379 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP33.98■■■■□ 3.03
EHD1-211ENST00000489379 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa33.97■■■■□ 3.03
EHD1-211ENST00000489379 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa33.97■■■■□ 3.03
EHD1-211ENST00000489379 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa33.97■■■■□ 3.03
EHD1-211ENST00000489379 EVA1CP58658 441 aa33.96■■■■□ 3.03
EHD1-211ENST00000489379 AATKQ6ZMQ8 1374 aa33.96■■■■□ 3.03
EHD1-211ENST00000489379 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP33.95■■■■□ 3.03
EHD1-211ENST00000489379 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa33.95■■■■□ 3.03
EHD1-211ENST00000489379 SEPT12Q8IYM1 358 aa33.92■■■■□ 3.02
EHD1-211ENST00000489379 STRN4Q9NRL3 753 aa33.92■■■■□ 3.02
EHD1-211ENST00000489379 NME9Q86XW9 330 aa33.91■■■■□ 3.02
EHD1-211ENST00000489379 BRWD3Q6RI45 1802 aa33.9■■■■□ 3.02
EHD1-211ENST00000489379 ARHGEF25Q86VW2 580 aa33.9■■■■□ 3.02
EHD1-211ENST00000489379 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa33.89■■■■□ 3.02
EHD1-211ENST00000489379 NFAT5O94916 1531 aa33.89■■■■□ 3.02
EHD1-211ENST00000489379 COL18A1P39060 1754 aa33.88■■■■□ 3.01
EHD1-211ENST00000489379 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP33.87■■■■□ 3.01
EHD1-211ENST00000489379 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP33.87■■■■□ 3.01
EHD1-211ENST00000489379 ABCC6O95255 1503 aa33.87■■■■□ 3.01
EHD1-211ENST00000489379 ZBTB7CA1YPR0 619 aa33.86■■■■□ 3.01
EHD1-211ENST00000489379 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP33.86■■■■□ 3.01
EHD1-211ENST00000489379 ZRANB1Q9UGI0 708 aa33.85■■■■□ 3.01
EHD1-211ENST00000489379 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa33.84■■■■□ 3.01
EHD1-211ENST00000489379 OVOS2Q6IE36 1432 aa33.84■■■■□ 3.01
EHD1-211ENST00000489379 MYOM1P52179 1685 aa33.84■■■■□ 3.01
EHD1-211ENST00000489379 A0A0G2JS52 829 aa33.83■■■■□ 3.01
EHD1-211ENST00000489379 MYT1Q01538 1121 aa33.83■■■■□ 3.01
EHD1-211ENST00000489379 SOX12O15370 315 aa33.82■■■■□ 3
EHD1-211ENST00000489379 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP33.82■■■■□ 3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.4 ms