RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489160.1

CCL20-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

TSL 3

Gene CCL20, Length 673 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-204ENST00000489160 PNMA1Q8ND90 353 aa9.66□□□□□ -0.86
CCL20-204ENST00000489160 EPS8L1Q8TE68 723 aa9.66□□□□□ -0.86
CCL20-204ENST00000489160 C1orf115Q9H7X2 142 aa9.66□□□□□ -0.86
CCL20-204ENST00000489160 CCDC24Q8N4L8 307 aa9.65□□□□□ -0.86
CCL20-204ENST00000489160 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
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CCL20-204ENST00000489160 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
CCL20-204ENST00000489160 GPR37L1O60883 481 aa9.63□□□□□ -0.87
CCL20-204ENST00000489160 F12P00748 615 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
CCL20-204ENST00000489160 KCNH2Q12809 1159 aa9.63□□□□□ -0.87
CCL20-204ENST00000489160 IRF5Q13568 498 aa9.63□□□□□ -0.87
CCL20-204ENST00000489160 WASHC4Q2M389 1173 aa9.63□□□□□ -0.87
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CCL20-204ENST00000489160 V9GY48 417 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
CCL20-204ENST00000489160 CTHP32929 405 aa9.6□□□□□ -0.87
CCL20-204ENST00000489160 SLC19A1P41440 591 aa9.6□□□□□ -0.87
CCL20-204ENST00000489160 PLA2G2CQ5R387 149 aa9.6□□□□□ -0.87
CCL20-204ENST00000489160 MAP10Q9P2G4 905 aa9.6□□□□□ -0.87
CCL20-204ENST00000489160 ARXQ96QS3 562 aa9.59□□□□□ -0.87
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CCL20-204ENST00000489160 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
CCL20-204ENST00000489160 LIAT1Q6ZQX7 453 aa9.58□□□□□ -0.88
CCL20-204ENST00000489160 CCDC82Q8N4S0 544 aa9.58□□□□□ -0.88
CCL20-204ENST00000489160 POM121CA8CG34 1229 aa9.57□□□□□ -0.88
CCL20-204ENST00000489160 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
CCL20-204ENST00000489160 ARMC2Q8NEN0 867 aa9.57□□□□□ -0.88
CCL20-204ENST00000489160 ARID3AQ99856 593 aa9.57□□□□□ -0.88
CCL20-204ENST00000489160 SERPINA10Q9UK55 444 aa9.57□□□□□ -0.88
CCL20-204ENST00000489160 VAC14Q08AM6 782 aa9.56□□□□□ -0.88
CCL20-204ENST00000489160 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
CCL20-204ENST00000489160 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
CCL20-204ENST00000489160 UNC93B1Q9H1C4 597 aa9.56□□□□□ -0.88
CCL20-204ENST00000489160 SPRYD7Q5W111 196 aa9.55□□□□□ -0.88
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CCL20-204ENST00000489160 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
CCL20-204ENST00000489160 TRIM32Q13049 653 aa9.54□□□□□ -0.88
CCL20-204ENST00000489160 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP9.54□□□□□ -0.88
CCL20-204ENST00000489160 SOX11P35716 441 aa9.53□□□□□ -0.88
CCL20-204ENST00000489160 NR1H3Q13133 447 aa9.53□□□□□ -0.88
CCL20-204ENST00000489160 NBPF14Q5TI25 921 aa9.53□□□□□ -0.88
CCL20-204ENST00000489160 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
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CCL20-204ENST00000489160 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa9.52□□□□□ -0.89
CCL20-204ENST00000489160 GPSM3Q9Y4H4 160 aa9.52□□□□□ -0.89
CCL20-204ENST00000489160 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP9.51□□□□□ -0.89
CCL20-204ENST00000489160 PDXDC2PQ6P474 469 aa9.51□□□□□ -0.89
CCL20-204ENST00000489160 HOMEZQ8IX15 550 aa9.51□□□□□ -0.89
CCL20-204ENST00000489160 FBXO45P0C2W1 286 aa9.5□□□□□ -0.89
CCL20-204ENST00000489160 PTK2Q05397 1052 aa9.5□□□□□ -0.89
CCL20-204ENST00000489160 ZNF697Q5TEC3 545 aa9.5□□□□□ -0.89
CCL20-204ENST00000489160 BAP1Q92560 729 aa9.5□□□□□ -0.89
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CCL20-204ENST00000489160 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa9.49□□□□□ -0.89
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CCL20-204ENST00000489160 ZNF592Q92610 1267 aa9.46□□□□□ -0.9
CCL20-204ENST00000489160 WNT7AO00755 349 aa9.45□□□□□ -0.9
CCL20-204ENST00000489160 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
CCL20-204ENST00000489160 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
CCL20-204ENST00000489160 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa9.44□□□□□ -0.9
CCL20-204ENST00000489160 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa9.44□□□□□ -0.9
CCL20-204ENST00000489160 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
CCL20-204ENST00000489160 AGERQ15109 404 aa9.43□□□□□ -0.9
CCL20-204ENST00000489160 OCSTAMPQ9BR26 566 aa9.43□□□□□ -0.9
CCL20-204ENST00000489160 GDF9O60383 454 aa9.42□□□□□ -0.9
CCL20-204ENST00000489160 VARSP26640 1264 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
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CCL20-204ENST00000489160 PRR20CP86479 221 aa9.42□□□□□ -0.9
CCL20-204ENST00000489160 PRR20DP86480 221 aa9.42□□□□□ -0.9
CCL20-204ENST00000489160 PRR20BP86481 221 aa9.42□□□□□ -0.9
CCL20-204ENST00000489160 PRR20AP86496 221 aa9.42□□□□□ -0.9
CCL20-204ENST00000489160 FOXC1Q12948 553 aa9.42□□□□□ -0.9
CCL20-204ENST00000489160 EHBP1Q8NDI1 1231 aa9.42□□□□□ -0.9
CCL20-204ENST00000489160 FOXJ1Q92949 421 aa9.42□□□□□ -0.9
CCL20-204ENST00000489160 PKD2L1Q9P0L9 805 aa9.42□□□□□ -0.9
CCL20-204ENST00000489160 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa9.41□□□□□ -0.9
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CCL20-204ENST00000489160 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa9.41□□□□□ -0.9
CCL20-204ENST00000489160 UCN2Q96RP3 112 aa9.4□□□□□ -0.9
CCL20-204ENST00000489160 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa9.4□□□□□ -0.9
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CCL20-204ENST00000489160 MRGPRX2Q96LB1 330 aa9.39□□□□□ -0.91
CCL20-204ENST00000489160 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa9.39□□□□□ -0.91
CCL20-204ENST00000489160 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa9.38□□□□□ -0.91
CCL20-204ENST00000489160 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
CCL20-204ENST00000489160 TRIM67Q6ZTA4 783 aa9.38□□□□□ -0.91
CCL20-204ENST00000489160 MPNDQ8N594 471 aa9.38□□□□□ -0.91
CCL20-204ENST00000489160 CARD14Q9BXL6 1004 aa9.38□□□□□ -0.91
CCL20-204ENST00000489160 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
CCL20-204ENST00000489160 SIAH2O43255 324 aa9.37□□□□□ -0.91
CCL20-204ENST00000489160 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
CCL20-204ENST00000489160 LAPTM4AQ15012 233 aa9.37□□□□□ -0.91
CCL20-204ENST00000489160 C4orf48Q5BLP8 95 aa9.37□□□□□ -0.91
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