RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484841.5

ACTB-212, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-212ENST00000484841 CCDC61Q9Y6R9 512 aa29.03■■■□□ 2.24
ACTB-212ENST00000484841 BTG4Q9NY30 223 aa29.02■■■□□ 2.24
ACTB-212ENST00000484841 BRWD3Q6RI45 1802 aa29.01■■■□□ 2.24
ACTB-212ENST00000484841 SEPT12Q8IYM1 358 aa29.01■■■□□ 2.23
ACTB-212ENST00000484841 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
ACTB-212ENST00000484841 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
ACTB-212ENST00000484841 PRDM11Q9NQV5 511 aa28.98■■■□□ 2.23
ACTB-212ENST00000484841 ACEP12821 1306 aa28.97■■■□□ 2.23
ACTB-212ENST00000484841 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa28.97■■■□□ 2.23
ACTB-212ENST00000484841 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
ACTB-212ENST00000484841 NRAPQ86VF7 1730 aa28.97■■■□□ 2.23
ACTB-212ENST00000484841 L3MBTL2Q969R5 705 aa28.96■■■□□ 2.23
ACTB-212ENST00000484841 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa28.95■■■□□ 2.23
ACTB-212ENST00000484841 NEUROD1Q13562 356 aa28.95■■■□□ 2.22
ACTB-212ENST00000484841 NBPF8Q3BBV2 869 aa28.95■■■□□ 2.22
ACTB-212ENST00000484841 QRICH2Q9H0J4 1663 aa28.94■■■□□ 2.22
ACTB-212ENST00000484841 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
ACTB-212ENST00000484841 KRT27Q7Z3Y8 459 aa28.94■■■□□ 2.22
ACTB-212ENST00000484841 ZRANB1Q9UGI0 708 aa28.94■■■□□ 2.22
ACTB-212ENST00000484841 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
ACTB-212ENST00000484841 PLEKHG3A1L390 1219 aa28.93■■■□□ 2.22
ACTB-212ENST00000484841 SIN3AQ96ST3 1273 aa28.93■■■□□ 2.22
ACTB-212ENST00000484841 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
ACTB-212ENST00000484841 NUTM2GQ5VZR2 741 aa28.92■■■□□ 2.22
ACTB-212ENST00000484841 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
ACTB-212ENST00000484841 ABTB2Q8N961 1025 aa28.91■■■□□ 2.22
ACTB-212ENST00000484841 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
ACTB-212ENST00000484841 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa28.9■■■□□ 2.22
ACTB-212ENST00000484841 CABP2Q9NPB3 220 aa28.9■■■□□ 2.22
ACTB-212ENST00000484841 KIAA0232Q92628 1395 aa28.88■■■□□ 2.21
ACTB-212ENST00000484841 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
ACTB-212ENST00000484841 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa28.87■■■□□ 2.21
ACTB-212ENST00000484841 CHRNA2Q15822 529 aa28.85■■■□□ 2.21
ACTB-212ENST00000484841 STRN4Q9NRL3 753 aa28.85■■■□□ 2.21
ACTB-212ENST00000484841 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa28.85■■■□□ 2.21
ACTB-212ENST00000484841 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa28.85■■■□□ 2.21
ACTB-212ENST00000484841 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
ACTB-212ENST00000484841 EVA1CP58658 441 aa28.84■■■□□ 2.21
ACTB-212ENST00000484841 NLRP13Q86W25 1043 aa28.84■■■□□ 2.21
ACTB-212ENST00000484841 EVC2Q86UK5 1308 aa28.83■■■□□ 2.21
ACTB-212ENST00000484841 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP28.8■■■□□ 2.2
ACTB-212ENST00000484841 CABP1Q9NZU7 370 aa28.79■■■□□ 2.2
ACTB-212ENST00000484841 DEFB132Q7Z7B7 95 aa28.78■■■□□ 2.2
ACTB-212ENST00000484841 NRKQ7Z2Y5 1582 aa28.77■■■□□ 2.2
ACTB-212ENST00000484841 EP400Q96L91 3159 aa28.76■■■□□ 2.2
ACTB-212ENST00000484841 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa28.76■■■□□ 2.19
ACTB-212ENST00000484841 BAG6P46379 1132 aa28.76■■■□□ 2.19
ACTB-212ENST00000484841 USP35Q9P2H5 1018 aa28.75■■■□□ 2.19
ACTB-212ENST00000484841 USP19O94966 1318 aa28.73■■■□□ 2.19
ACTB-212ENST00000484841 USP6P35125 1406 aa28.73■■■□□ 2.19
ACTB-212ENST00000484841 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa28.73■■■□□ 2.19
ACTB-212ENST00000484841 GCP02774 474 aa28.72■■■□□ 2.19
ACTB-212ENST00000484841 NLRP6P59044 892 aa28.72■■■□□ 2.19
ACTB-212ENST00000484841 CPDO75976 1380 aa28.72■■■□□ 2.19
ACTB-212ENST00000484841 ZBTB7CA1YPR0 619 aa28.71■■■□□ 2.19
ACTB-212ENST00000484841 RGPD1P0DJD0 1748 aa28.71■■■□□ 2.19
ACTB-212ENST00000484841 SSH2Q76I76 1423 aa28.7■■■□□ 2.19
ACTB-212ENST00000484841 FAM182BQ5T319 152 aa28.69■■■□□ 2.18
ACTB-212ENST00000484841 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP28.69■■■□□ 2.18
ACTB-212ENST00000484841 TONSLQ96HA7 1378 aa28.68■■■□□ 2.18
ACTB-212ENST00000484841 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa28.67■■■□□ 2.18
ACTB-212ENST00000484841 PDE3BQ13370 1112 aa28.66■■■□□ 2.18
ACTB-212ENST00000484841 LMO7Q8WWI1 1683 aa28.65■■■□□ 2.18
ACTB-212ENST00000484841 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
ACTB-212ENST00000484841 BARGINQ6ZT62 677 aa28.65■■■□□ 2.18
ACTB-212ENST00000484841 TCP11L2Q8N4U5 519 aa28.65■■■□□ 2.18
ACTB-212ENST00000484841 CARD11Q9BXL7 1154 aa28.65■■■□□ 2.18
ACTB-212ENST00000484841 FAM196AQ6ZSG2 479 aa28.64■■■□□ 2.18
ACTB-212ENST00000484841 AKAP12Q02952 1782 aa28.63■■■□□ 2.17
ACTB-212ENST00000484841 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP28.62■■■□□ 2.17
ACTB-212ENST00000484841 PIK3C2AO00443 1686 aa28.61■■■□□ 2.17
ACTB-212ENST00000484841 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
ACTB-212ENST00000484841 SLIT3O75094 1523 aa28.59■■■□□ 2.17
ACTB-212ENST00000484841 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
ACTB-212ENST00000484841 KCNH5Q8NCM2 988 aa28.59■■■□□ 2.17
ACTB-212ENST00000484841 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa28.59■■■□□ 2.17
ACTB-212ENST00000484841 TTC21AQ8NDW8 1320 aa28.59■■■□□ 2.17
ACTB-212ENST00000484841 TRIM37O94972 964 aa28.57■■■□□ 2.16
ACTB-212ENST00000484841 AATKQ6ZMQ8 1374 aa28.57■■■□□ 2.16
ACTB-212ENST00000484841 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
ACTB-212ENST00000484841 CRB1P82279 1406 aa28.56■■■□□ 2.16
ACTB-212ENST00000484841 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
ACTB-212ENST00000484841 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa28.56■■■□□ 2.16
ACTB-212ENST00000484841 SOX12O15370 315 aa28.54■■■□□ 2.16
ACTB-212ENST00000484841 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP28.54■■■□□ 2.16
ACTB-212ENST00000484841 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa28.54■■■□□ 2.16
ACTB-212ENST00000484841 TMC1Q8TDI8 760 aa28.53■■■□□ 2.16
ACTB-212ENST00000484841 APBA3O96018 575 aa28.52■■■□□ 2.16
ACTB-212ENST00000484841 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
ACTB-212ENST00000484841 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP28.51■■■□□ 2.15
ACTB-212ENST00000484841 MON2Q7Z3U7 1717 aa28.51■■■□□ 2.15
ACTB-212ENST00000484841 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
ACTB-212ENST00000484841 DISP2A7MBM2 1401 aa28.51■■■□□ 2.15
ACTB-212ENST00000484841 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP28.5■■■□□ 2.15
ACTB-212ENST00000484841 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP28.5■■■□□ 2.15
ACTB-212ENST00000484841 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa28.49■■■□□ 2.15
ACTB-212ENST00000484841 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
ACTB-212ENST00000484841 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP28.48■■■□□ 2.15
ACTB-212ENST00000484841 COL18A1P39060 1754 aa28.47■■■□□ 2.15
ACTB-212ENST00000484841 ARHGEF25Q86VW2 580 aa28.47■■■□□ 2.15
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