RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482785.1

SHQ1-208, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 3

Gene SHQ1, Length 502 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-208ENST00000482785 BRINP3Q76B58 766 aa6.48□□□□□ -1.37
SHQ1-208ENST00000482785 FBXO22Q8NEZ5 403 aa6.48□□□□□ -1.37
SHQ1-208ENST00000482785 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
SHQ1-208ENST00000482785 PODXL2Q9NZ53 605 aa6.48□□□□□ -1.37
SHQ1-208ENST00000482785 RREB1Q92766 1687 aa6.48□□□□□ -1.37
SHQ1-208ENST00000482785 TIE1P35590 1138 aa6.47□□□□□ -1.37
SHQ1-208ENST00000482785 GGT6Q6P531 493 aa6.47□□□□□ -1.37
SHQ1-208ENST00000482785 ABHD8Q96I13 439 aa6.47□□□□□ -1.37
SHQ1-208ENST00000482785 AK7Q96M32 723 aa6.47□□□□□ -1.37
SHQ1-208ENST00000482785 SOX12O15370 315 aa6.46□□□□□ -1.38
SHQ1-208ENST00000482785 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
SHQ1-208ENST00000482785 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
SHQ1-208ENST00000482785 ZMYND15Q9H091 742 aa6.46□□□□□ -1.38
SHQ1-208ENST00000482785 CASZ1Q86V15 1759 aa6.46□□□□□ -1.38
SHQ1-208ENST00000482785 NLRP1Q9C000 1473 aa6.46□□□□□ -1.38
SHQ1-208ENST00000482785 PDE4AP27815 886 aa6.45□□□□□ -1.38
SHQ1-208ENST00000482785 GOLGA2Q08379 1002 aa6.45□□□□□ -1.38
SHQ1-208ENST00000482785 NBPF8Q3BBV2 869 aa6.45□□□□□ -1.38
SHQ1-208ENST00000482785 FAM182BQ5T319 152 aa6.45□□□□□ -1.38
SHQ1-208ENST00000482785 NBPF14Q5TI25 921 aa6.45□□□□□ -1.38
SHQ1-208ENST00000482785 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa6.45□□□□□ -1.38
SHQ1-208ENST00000482785 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
SHQ1-208ENST00000482785 RSPH6AQ9H0K4 717 aa6.45□□□□□ -1.38
SHQ1-208ENST00000482785 MIA2Q96PC5 1412 aa6.44□□□□□ -1.38
SHQ1-208ENST00000482785 PLEKHD1A6NEE1 506 aa6.44□□□□□ -1.38
SHQ1-208ENST00000482785 ZBTB7AO95365 584 aa6.44□□□□□ -1.38
SHQ1-208ENST00000482785 LHX8Q68G74 356 aa6.44□□□□□ -1.38
SHQ1-208ENST00000482785 MS4A4AQ96JQ5 239 aa6.44□□□□□ -1.38
SHQ1-208ENST00000482785 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
SHQ1-208ENST00000482785 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
SHQ1-208ENST00000482785 PTCH1Q13635 1447 aa6.43□□□□□ -1.38
SHQ1-208ENST00000482785 NCOA2Q15596 1464 aa6.43□□□□□ -1.38
SHQ1-208ENST00000482785 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
SHQ1-208ENST00000482785 CCDC85CA6NKD9 419 aa6.43□□□□□ -1.38
SHQ1-208ENST00000482785 TTLL13PA6NNM8 815 aa6.43□□□□□ -1.38
SHQ1-208ENST00000482785 UBTFP17480 764 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
SHQ1-208ENST00000482785 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
SHQ1-208ENST00000482785 MFSD10Q14728 455 aa6.43□□□□□ -1.38
SHQ1-208ENST00000482785 TXNDC2Q86VQ3 553 aa6.43□□□□□ -1.38
SHQ1-208ENST00000482785 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
SHQ1-208ENST00000482785 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
SHQ1-208ENST00000482785 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
SHQ1-208ENST00000482785 GOLGA3Q08378 1498 aa6.42□□□□□ -1.38
SHQ1-208ENST00000482785 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa6.42□□□□□ -1.38
SHQ1-208ENST00000482785 C7P10643 843 aa6.42□□□□□ -1.38
SHQ1-208ENST00000482785 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
SHQ1-208ENST00000482785 SLC39A7Q92504 469 aa6.42□□□□□ -1.38
SHQ1-208ENST00000482785 MROH1Q8NDA8 1641 aa6.41□□□□□ -1.38
SHQ1-208ENST00000482785 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP6.41□□□□□ -1.38
SHQ1-208ENST00000482785 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
SHQ1-208ENST00000482785 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
SHQ1-208ENST00000482785 MYO5CQ9NQX4 1742 aa6.41□□□□□ -1.38
SHQ1-208ENST00000482785 PZPP20742 1482 aa6.41□□□□□ -1.38
SHQ1-208ENST00000482785 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa6.4□□□□□ -1.38
SHQ1-208ENST00000482785 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
SHQ1-208ENST00000482785 CAMK2BQ13554 666 aa6.4□□□□□ -1.38
SHQ1-208ENST00000482785 GPIHBP1Q8IV16 184 aa6.4□□□□□ -1.38
SHQ1-208ENST00000482785 IL27Q8NEV9 243 aa6.4□□□□□ -1.38
SHQ1-208ENST00000482785 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
SHQ1-208ENST00000482785 SLC26A8Q96RN1 970 aa6.4□□□□□ -1.38
SHQ1-208ENST00000482785 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa6.4□□□□□ -1.38
SHQ1-208ENST00000482785 KDM4CQ9H3R0 1056 aa6.4□□□□□ -1.38
SHQ1-208ENST00000482785 ADCY9O60503 1353 aa6.4□□□□□ -1.39
SHQ1-208ENST00000482785 EFCAB6Q5THR3 1501 aa6.4□□□□□ -1.39
SHQ1-208ENST00000482785 UBR1Q8IWV7 1749 aa6.39□□□□□ -1.39
SHQ1-208ENST00000482785 TOMM70O94826 608 aa6.39□□□□□ -1.39
SHQ1-208ENST00000482785 APBA3O96018 575 aa6.39□□□□□ -1.39
SHQ1-208ENST00000482785 PRDM10Q9NQV6 1147 aa6.39□□□□□ -1.39
SHQ1-208ENST00000482785 TRIM35Q9UPQ4 493 aa6.39□□□□□ -1.39
SHQ1-208ENST00000482785 PARD3Q8TEW0 1356 aa6.39□□□□□ -1.39
SHQ1-208ENST00000482785 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SHQ1-208ENST00000482785 TRIM37O94972 964 aa6.38□□□□□ -1.39
SHQ1-208ENST00000482785 ATF3P18847 181 aa6.38□□□□□ -1.39
SHQ1-208ENST00000482785 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
SHQ1-208ENST00000482785 UNC5CLQ8IV45 518 aa6.38□□□□□ -1.39
SHQ1-208ENST00000482785 FMN1Q68DA7 1419 aa6.38□□□□□ -1.39
SHQ1-208ENST00000482785 KIF27Q86VH2 1401 aa6.38□□□□□ -1.39
SHQ1-208ENST00000482785 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa6.38□□□□□ -1.39
SHQ1-208ENST00000482785 ADGRB2O60241 1585 aa6.38□□□□□ -1.39
SHQ1-208ENST00000482785 FOXN1O15353 648 aa6.37□□□□□ -1.39
SHQ1-208ENST00000482785 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
SHQ1-208ENST00000482785 IER5LQ5T953 404 aa6.37□□□□□ -1.39
SHQ1-208ENST00000482785 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP6.37□□□□□ -1.39
SHQ1-208ENST00000482785 PLXNC1O60486 1568 aa6.36□□□□□ -1.39
SHQ1-208ENST00000482785 A0A0G2JS52 829 aa6.36□□□□□ -1.39
SHQ1-208ENST00000482785 POTEB2H3BUK9 544 aa6.36□□□□□ -1.39
SHQ1-208ENST00000482785 TRIM66O15016 1216 aa6.36□□□□□ -1.39
SHQ1-208ENST00000482785 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP6.36□□□□□ -1.39
SHQ1-208ENST00000482785 MYT1Q01538 1121 aa6.36□□□□□ -1.39
SHQ1-208ENST00000482785 PDE4DQ08499 809 aa6.36□□□□□ -1.39
SHQ1-208ENST00000482785 SLC17A8Q8NDX2 589 aa6.36□□□□□ -1.39
SHQ1-208ENST00000482785 METRNQ9UJH8 293 aa6.36□□□□□ -1.39
SHQ1-208ENST00000482785 SLIT1O75093 1534 aa6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-208ENST00000482785 MAP3K5Q99683 1374 aa6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-208ENST00000482785 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-208ENST00000482785 POTEFA5A3E0 1075 aa6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-208ENST00000482785 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-208ENST00000482785 C19orf44Q9H6X5 657 aa6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-208ENST00000482785 TET3O43151 1660 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1-208ENST00000482785 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa6.34□□□□□ -1.39
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