RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481438.1

DCTN3-211, Transcript of dynactin subunit 3, humanhuman

TSL 2

Gene DCTN3, Length 401 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN3-211ENST00000481438 TNRQ92752 1358 aa7.25□□□□□ -1.25
DCTN3-211ENST00000481438 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
DCTN3-211ENST00000481438 ADAM33Q9BZ11 813 aa7.25□□□□□ -1.25
DCTN3-211ENST00000481438 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa7.25□□□□□ -1.25
DCTN3-211ENST00000481438 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
DCTN3-211ENST00000481438 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
DCTN3-211ENST00000481438 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
DCTN3-211ENST00000481438 VWDEQ8N2E2 1590 aa7.25□□□□□ -1.25
DCTN3-211ENST00000481438 DEPDC5O75140 1603 aa7.24□□□□□ -1.25
DCTN3-211ENST00000481438 NBPF8Q3BBV2 869 aa7.24□□□□□ -1.25
DCTN3-211ENST00000481438 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
DCTN3-211ENST00000481438 ZBED2Q9BTP6 218 aa7.24□□□□□ -1.25
DCTN3-211ENST00000481438 SLC4A5Q9BY07 1137 aa7.24□□□□□ -1.25
DCTN3-211ENST00000481438 PTPRTO14522 1441 aa7.24□□□□□ -1.25
DCTN3-211ENST00000481438 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa7.24□□□□□ -1.25
DCTN3-211ENST00000481438 LMTK2Q8IWU2 1503 aa7.23□□□□□ -1.25
DCTN3-211ENST00000481438 E9PCH4 1651 aa7.23□□□□□ -1.25
DCTN3-211ENST00000481438 TET3O43151 1660 aa7.23□□□□□ -1.25
DCTN3-211ENST00000481438 TXNDC2Q86VQ3 553 aa7.23□□□□□ -1.25
DCTN3-211ENST00000481438 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa7.23□□□□□ -1.25
DCTN3-211ENST00000481438 BCORL1Q5H9F3 1711 aa7.22□□□□□ -1.25
DCTN3-211ENST00000481438 NOS1P29475 1434 aa7.22□□□□□ -1.25
DCTN3-211ENST00000481438 PTPREP23469 700 aa7.22□□□□□ -1.25
DCTN3-211ENST00000481438 HDGFP51858 240 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
DCTN3-211ENST00000481438 MAP3K9P80192 1104 aa7.22□□□□□ -1.25
DCTN3-211ENST00000481438 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
DCTN3-211ENST00000481438 ZDHHC16Q969W1 377 aa7.22□□□□□ -1.25
DCTN3-211ENST00000481438 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa7.22□□□□□ -1.25
DCTN3-211ENST00000481438 ERVK-7P63135 1459 aa7.22□□□□□ -1.25
DCTN3-211ENST00000481438 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
DCTN3-211ENST00000481438 EFCAB6Q5THR3 1501 aa7.22□□□□□ -1.25
DCTN3-211ENST00000481438 UGGT1Q9NYU2 1555 aa7.21□□□□□ -1.25
DCTN3-211ENST00000481438 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa7.21□□□□□ -1.26
DCTN3-211ENST00000481438 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
DCTN3-211ENST00000481438 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
DCTN3-211ENST00000481438 EID1Q9Y6B2 187 aa7.21□□□□□ -1.26
DCTN3-211ENST00000481438 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa7.21□□□□□ -1.26
DCTN3-211ENST00000481438 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
DCTN3-211ENST00000481438 MADDQ8WXG6 1647 aa7.2□□□□□ -1.26
DCTN3-211ENST00000481438 HSPA2P54652 639 aa7.2□□□□□ -1.26
DCTN3-211ENST00000481438 CAMK2BQ13554 666 aa7.2□□□□□ -1.26
DCTN3-211ENST00000481438 NBPF1Q3BBV0 1214 aa7.2□□□□□ -1.26
DCTN3-211ENST00000481438 CFAP70Q5T0N1 1121 aa7.2□□□□□ -1.26
DCTN3-211ENST00000481438 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa7.2□□□□□ -1.26
DCTN3-211ENST00000481438 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
DCTN3-211ENST00000481438 PTPRMP28827 1452 aa7.19□□□□□ -1.26
DCTN3-211ENST00000481438 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa7.19□□□□□ -1.26
DCTN3-211ENST00000481438 LTKP29376 864 aa7.19□□□□□ -1.26
DCTN3-211ENST00000481438 TMEM132EQ6IEE7 984 aa7.19□□□□□ -1.26
DCTN3-211ENST00000481438 ANKLE2Q86XL3 938 aa7.19□□□□□ -1.26
DCTN3-211ENST00000481438 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP7.19□□□□□ -1.26
DCTN3-211ENST00000481438 STK26Q9P289 416 aa7.19□□□□□ -1.26
DCTN3-211ENST00000481438 ADAMTSL3P82987 1691 aa7.19□□□□□ -1.26
DCTN3-211ENST00000481438 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa7.18□□□□□ -1.26
DCTN3-211ENST00000481438 STAC3Q96MF2 364 aa7.18□□□□□ -1.26
DCTN3-211ENST00000481438 CARD11Q9BXL7 1154 aa7.18□□□□□ -1.26
DCTN3-211ENST00000481438 CLTCL1P53675 1640 aa7.18□□□□□ -1.26
DCTN3-211ENST00000481438 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa7.18□□□□□ -1.26
DCTN3-211ENST00000481438 TRPM2O94759 1503 aa7.17□□□□□ -1.26
DCTN3-211ENST00000481438 SYNMO15061 1565 aa7.17□□□□□ -1.26
DCTN3-211ENST00000481438 C3P01024 1663 aa7.17□□□□□ -1.26
DCTN3-211ENST00000481438 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
DCTN3-211ENST00000481438 PREX1Q8TCU6 1659 aa7.17□□□□□ -1.26
DCTN3-211ENST00000481438 COL9A1P20849 921 aa7.17□□□□□ -1.26
DCTN3-211ENST00000481438 SLC26A8Q96RN1 970 aa7.17□□□□□ -1.26
DCTN3-211ENST00000481438 PTPN5P54829 565 aa7.16□□□□□ -1.26
DCTN3-211ENST00000481438 THSD4Q6ZMP0 1018 aa7.16□□□□□ -1.26
DCTN3-211ENST00000481438 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
DCTN3-211ENST00000481438 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
DCTN3-211ENST00000481438 RIMS2Q9UQ26 1411 aa7.16□□□□□ -1.26
DCTN3-211ENST00000481438 KIF1BO60333 1816 aa7.15□□□□□ -1.26
DCTN3-211ENST00000481438 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa7.15□□□□□ -1.26
DCTN3-211ENST00000481438 PHF14O94880 888 aa7.15□□□□□ -1.26
DCTN3-211ENST00000481438 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
DCTN3-211ENST00000481438 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP7.15□□□□□ -1.26
DCTN3-211ENST00000481438 PROX2Q3B8N5 592 aa7.15□□□□□ -1.26
DCTN3-211ENST00000481438 POLR3GLQ9BT43 218 aa7.15□□□□□ -1.26
DCTN3-211ENST00000481438 TRAK1Q9UPV9 953 aa7.15□□□□□ -1.26
DCTN3-211ENST00000481438 TMEM2Q9UHN6 1383 aa7.15□□□□□ -1.26
DCTN3-211ENST00000481438 A2ML1A8K2U0 1454 aa7.15□□□□□ -1.27
DCTN3-211ENST00000481438 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa7.15□□□□□ -1.27
DCTN3-211ENST00000481438 MROH2AA6NES4 1674 aa7.14□□□□□ -1.27
DCTN3-211ENST00000481438 DPYSL4O14531 572 aa7.14□□□□□ -1.27
DCTN3-211ENST00000481438 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
DCTN3-211ENST00000481438 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP7.14□□□□□ -1.27
DCTN3-211ENST00000481438 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa7.14□□□□□ -1.27
DCTN3-211ENST00000481438 TYW1BQ6NUM6 668 aa7.14□□□□□ -1.27
DCTN3-211ENST00000481438 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
DCTN3-211ENST00000481438 NLRP1Q9C000 1473 aa7.14□□□□□ -1.27
DCTN3-211ENST00000481438 PIK3C2BO00750 1634 aa7.13□□□□□ -1.27
DCTN3-211ENST00000481438 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa7.13□□□□□ -1.27
DCTN3-211ENST00000481438 WNT2BQ93097 391 aa7.13□□□□□ -1.27
DCTN3-211ENST00000481438 MYO5BQ9ULV0 1848 aa7.13□□□□□ -1.27
DCTN3-211ENST00000481438 PRAG1Q86YV5 1406 aa7.12□□□□□ -1.27
DCTN3-211ENST00000481438 FBXW7Q969H0 707 aa7.12□□□□□ -1.27
DCTN3-211ENST00000481438 POGKQ9P215 609 aa7.12□□□□□ -1.27
DCTN3-211ENST00000481438 RABGEF1Q9UJ41 708 aa7.12□□□□□ -1.27
DCTN3-211ENST00000481438 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa7.12□□□□□ -1.27
DCTN3-211ENST00000481438 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa7.11□□□□□ -1.27
DCTN3-211ENST00000481438 WAPLQ7Z5K2 1190 aa7.11□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms