RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481079.1

PTPRD-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRD, Length 521 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-210ENST00000481079 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP34.27■■■■□ 3.08
PTPRD-210ENST00000481079 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP34.26■■■■□ 3.08
PTPRD-210ENST00000481079 PLCH1Q4KWH8 1693 aa34.25■■■■□ 3.07
PTPRD-210ENST00000481079 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa34.25■■■■□ 3.07
PTPRD-210ENST00000481079 RALGAPBQ86X10 1494 aa34.25■■■■□ 3.07
PTPRD-210ENST00000481079 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP34.24■■■■□ 3.07
PTPRD-210ENST00000481079 UNC5CLQ8IV45 518 aa34.24■■■■□ 3.07
PTPRD-210ENST00000481079 NWD2Q9ULI1 1742 aa34.22■■■■□ 3.07
PTPRD-210ENST00000481079 PCGF6Q9BYE7 350 aa34.22■■■■□ 3.07
PTPRD-210ENST00000481079 FAM83GA6ND36 823 aa34.2■■■■□ 3.07
PTPRD-210ENST00000481079 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP34.19■■■■□ 3.06
PTPRD-210ENST00000481079 EVC2Q86UK5 1308 aa34.19■■■■□ 3.06
PTPRD-210ENST00000481079 GLI3P10071 1580 aa34.19■■■■□ 3.06
PTPRD-210ENST00000481079 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP34.18■■■■□ 3.06
PTPRD-210ENST00000481079 CARD11Q9BXL7 1154 aa34.17■■■■□ 3.06
PTPRD-210ENST00000481079 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP34.15■■■■□ 3.06
PTPRD-210ENST00000481079 CABP1Q9NZU7 370 aa34.15■■■■□ 3.06
PTPRD-210ENST00000481079 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa34.14■■■■□ 3.06
PTPRD-210ENST00000481079 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP34.14■■■■□ 3.06
PTPRD-210ENST00000481079 NRAPQ86VF7 1730 aa34.14■■■■□ 3.06
PTPRD-210ENST00000481079 VPS72Q15906 364 aa34.11■■■■□ 3.05
PTPRD-210ENST00000481079 NUTM2GQ5VZR2 741 aa34.1■■■■□ 3.05
PTPRD-210ENST00000481079 EP400Q96L91 3159 aa34.09■■■■□ 3.05
PTPRD-210ENST00000481079 USP6P35125 1406 aa34.08■■■■□ 3.05
PTPRD-210ENST00000481079 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP34.08■■■■□ 3.05
PTPRD-210ENST00000481079 SSH2Q76I76 1423 aa34.07■■■■□ 3.04
PTPRD-210ENST00000481079 ABTB2Q8N961 1025 aa34.06■■■■□ 3.04
PTPRD-210ENST00000481079 BTG4Q9NY30 223 aa34.06■■■■□ 3.04
PTPRD-210ENST00000481079 NRKQ7Z2Y5 1582 aa34.05■■■■□ 3.04
PTPRD-210ENST00000481079 USP19O94966 1318 aa34.04■■■■□ 3.04
PTPRD-210ENST00000481079 KIAA0232Q92628 1395 aa34.04■■■■□ 3.04
PTPRD-210ENST00000481079 ATAD2Q6PL18 1390 aa34.02■■■■□ 3.04
PTPRD-210ENST00000481079 PRDM11Q9NQV5 511 aa34.02■■■■□ 3.04
PTPRD-210ENST00000481079 AKAP12Q02952 1782 aa34.02■■■■□ 3.04
PTPRD-210ENST00000481079 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP33.99■■■■□ 3.03
PTPRD-210ENST00000481079 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP33.98■■■■□ 3.03
PTPRD-210ENST00000481079 PIK3C2AO00443 1686 aa33.98■■■■□ 3.03
PTPRD-210ENST00000481079 BRWD3Q6RI45 1802 aa33.97■■■■□ 3.03
PTPRD-210ENST00000481079 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP33.97■■■■□ 3.03
PTPRD-210ENST00000481079 CHRNA2Q15822 529 aa33.96■■■■□ 3.03
PTPRD-210ENST00000481079 NLRP13Q86W25 1043 aa33.96■■■■□ 3.03
PTPRD-210ENST00000481079 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP33.96■■■■□ 3.03
PTPRD-210ENST00000481079 CLSPNQ9HAW4 1339 aa33.96■■■■□ 3.03
PTPRD-210ENST00000481079 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP33.95■■■■□ 3.03
PTPRD-210ENST00000481079 CPDO75976 1380 aa33.95■■■■□ 3.02
PTPRD-210ENST00000481079 SEPT12Q8IYM1 358 aa33.93■■■■□ 3.02
PTPRD-210ENST00000481079 TESK2Q96S53 571 aa33.93■■■■□ 3.02
PTPRD-210ENST00000481079 SLIT3O75094 1523 aa33.93■■■■□ 3.02
PTPRD-210ENST00000481079 GCP02774 474 aa33.92■■■■□ 3.02
PTPRD-210ENST00000481079 LMO7Q8WWI1 1683 aa33.92■■■■□ 3.02
PTPRD-210ENST00000481079 MON2Q7Z3U7 1717 aa33.91■■■■□ 3.02
PTPRD-210ENST00000481079 CD163L1Q9NR16 1453 aa33.91■■■■□ 3.02
PTPRD-210ENST00000481079 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa33.91■■■■□ 3.02
PTPRD-210ENST00000481079 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa33.91■■■■□ 3.02
PTPRD-210ENST00000481079 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa33.91■■■■□ 3.02
PTPRD-210ENST00000481079 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa33.9■■■■□ 3.02
PTPRD-210ENST00000481079 NLRP6P59044 892 aa33.89■■■■□ 3.02
PTPRD-210ENST00000481079 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa33.89■■■■□ 3.02
PTPRD-210ENST00000481079 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa33.88■■■■□ 3.01
PTPRD-210ENST00000481079 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP33.86■■■■□ 3.01
PTPRD-210ENST00000481079 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP33.86■■■■□ 3.01
PTPRD-210ENST00000481079 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP33.85■■■■□ 3.01
PTPRD-210ENST00000481079 TTC21AQ8NDW8 1320 aa33.84■■■■□ 3.01
PTPRD-210ENST00000481079 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa33.83■■■■□ 3.01
PTPRD-210ENST00000481079 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa33.82■■■■□ 3.01
PTPRD-210ENST00000481079 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa33.82■■■■□ 3
PTPRD-210ENST00000481079 STRN4Q9NRL3 753 aa33.81■■■■□ 3
PTPRD-210ENST00000481079 USP47Q96K76 1375 aa33.81■■■■□ 3
PTPRD-210ENST00000481079 TMC1Q8TDI8 760 aa33.79■■■■□ 3
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PTPRD-210ENST00000481079 COL18A1P39060 1754 aa33.77■■■■□ 3
PTPRD-210ENST00000481079 USP54Q70EL1 1684 aa33.77■■■■□ 3
PTPRD-210ENST00000481079 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP33.76■■■■□ 3
PTPRD-210ENST00000481079 AATKQ6ZMQ8 1374 aa33.76■■■■□ 3
PTPRD-210ENST00000481079 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP33.75■■■□□ 2.99
PTPRD-210ENST00000481079 CCDC125Q86Z20 511 aa33.75■■■□□ 2.99
PTPRD-210ENST00000481079 NFAT5O94916 1531 aa33.74■■■□□ 2.99
PTPRD-210ENST00000481079 A0A1W2PP64 1363 aa33.74■■■□□ 2.99
PTPRD-210ENST00000481079 SLC24A1O60721 1099 aa33.74■■■□□ 2.99
PTPRD-210ENST00000481079 USP31Q70CQ4 1352 aa33.73■■■□□ 2.99
PTPRD-210ENST00000481079 A0A0G2JS52 829 aa33.73■■■□□ 2.99
PTPRD-210ENST00000481079 EVA1CP58658 441 aa33.73■■■□□ 2.99
PTPRD-210ENST00000481079 MYT1Q01538 1121 aa33.73■■■□□ 2.99
PTPRD-210ENST00000481079 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP33.72■■■□□ 2.99
PTPRD-210ENST00000481079 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP33.72■■■□□ 2.99
PTPRD-210ENST00000481079 ZRANB1Q9UGI0 708 aa33.72■■■□□ 2.99
PTPRD-210ENST00000481079 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP33.71■■■□□ 2.99
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PTPRD-210ENST00000481079 NINLQ9Y2I6 1382 aa33.71■■■□□ 2.99
PTPRD-210ENST00000481079 ARHGEF25Q86VW2 580 aa33.7■■■□□ 2.99
PTPRD-210ENST00000481079 KCNH5Q8NCM2 988 aa33.7■■■□□ 2.99
PTPRD-210ENST00000481079 TERF2IPQ9NYB0 399 aa33.7■■■□□ 2.99
PTPRD-210ENST00000481079 NME9Q86XW9 330 aa33.69■■■□□ 2.98
PTPRD-210ENST00000481079 ZBTB7CA1YPR0 619 aa33.68■■■□□ 2.98
PTPRD-210ENST00000481079 BARGINQ6ZT62 677 aa33.68■■■□□ 2.98
PTPRD-210ENST00000481079 USP35Q9P2H5 1018 aa33.68■■■□□ 2.98
PTPRD-210ENST00000481079 AXIN2Q9Y2T1 843 aa33.68■■■□□ 2.98
PTPRD-210ENST00000481079 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP33.67■■■□□ 2.98
PTPRD-210ENST00000481079 SOX12O15370 315 aa33.64■■■□□ 2.98
PTPRD-210ENST00000481079 TMF1P82094 1093 aa33.64■■■□□ 2.98
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