RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477413.1

CNIH4-208, Transcript of cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 4, human

TSL 5

Gene CNIH4, Length 820 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNIH4-208	ENST00000477413	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		32.44	■■■□□ 2.78
CNIH4-208	ENST00000477413	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		32.44	■■■□□ 2.78
CNIH4-208	ENST00000477413	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		32.44	■■■□□ 2.78
CNIH4-208	ENST00000477413	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		32.43	■■■□□ 2.78
CNIH4-208	ENST00000477413	ACE	P12821	1306 aa		32.42	■■■□□ 2.78
CNIH4-208	ENST00000477413	TONSL	Q96HA7	1378 aa		32.42	■■■□□ 2.78
CNIH4-208	ENST00000477413	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		32.42	■■■□□ 2.78
CNIH4-208	ENST00000477413	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		32.41	■■■□□ 2.78
CNIH4-208	ENST00000477413	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	32.41	■■■□□ 2.78
CNIH4-208	ENST00000477413	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	32.4	■■■□□ 2.78
CNIH4-208	ENST00000477413	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	32.4	■■■□□ 2.78
CNIH4-208	ENST00000477413	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	32.38	■■■□□ 2.77
CNIH4-208	ENST00000477413	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	32.36	■■■□□ 2.77
CNIH4-208	ENST00000477413	EVC2	Q86UK5	1308 aa		32.35	■■■□□ 2.77
CNIH4-208	ENST00000477413	EP400	Q96L91	3159 aa		32.35	■■■□□ 2.77
CNIH4-208	ENST00000477413	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		32.34	■■■□□ 2.77
CNIH4-208	ENST00000477413	CABP2	Q9NPB3	220 aa		32.34	■■■□□ 2.77
CNIH4-208	ENST00000477413	VPS72	Q15906	364 aa		32.33	■■■□□ 2.77
CNIH4-208	ENST00000477413	FAM83G	A6ND36	823 aa		32.32	■■■□□ 2.76
CNIH4-208	ENST00000477413	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		32.32	■■■□□ 2.76
CNIH4-208	ENST00000477413	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	32.31	■■■□□ 2.76
CNIH4-208	ENST00000477413	AKAP12	Q02952	1782 aa		32.31	■■■□□ 2.76
CNIH4-208	ENST00000477413	USP6	P35125	1406 aa		32.31	■■■□□ 2.76
CNIH4-208	ENST00000477413	USP19	O94966	1318 aa		32.29	■■■□□ 2.76
CNIH4-208	ENST00000477413	SSH2	Q76I76	1423 aa		32.29	■■■□□ 2.76
CNIH4-208	ENST00000477413	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		32.25	■■■□□ 2.75
CNIH4-208	ENST00000477413	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		32.25	■■■□□ 2.75
CNIH4-208	ENST00000477413	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	32.24	■■■□□ 2.75
CNIH4-208	ENST00000477413	PIK3C2A	O00443	1686 aa		32.24	■■■□□ 2.75
CNIH4-208	ENST00000477413	CPD	O75976	1380 aa		32.23	■■■□□ 2.75
CNIH4-208	ENST00000477413	CABP1	Q9NZU7	370 aa		32.23	■■■□□ 2.75
CNIH4-208	ENST00000477413	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		32.23	■■■□□ 2.75
CNIH4-208	ENST00000477413	KIAA0232	Q92628	1395 aa		32.22	■■■□□ 2.75
CNIH4-208	ENST00000477413	SLIT3	O75094	1523 aa		32.22	■■■□□ 2.75
CNIH4-208	ENST00000477413	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	32.21	■■■□□ 2.75
CNIH4-208	ENST00000477413	PLEKHG5	O94827	1062 aa		32.21	■■■□□ 2.75
CNIH4-208	ENST00000477413	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		32.2	■■■□□ 2.75
CNIH4-208	ENST00000477413	BTG4	Q9NY30	223 aa		32.2	■■■□□ 2.75
CNIH4-208	ENST00000477413	ABTB2	Q8N961	1025 aa		32.19	■■■□□ 2.74
CNIH4-208	ENST00000477413	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		32.19	■■■□□ 2.74
CNIH4-208	ENST00000477413	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		32.19	■■■□□ 2.74
CNIH4-208	ENST00000477413	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		32.18	■■■□□ 2.74
CNIH4-208	ENST00000477413	USP54	Q70EL1	1684 aa		32.15	■■■□□ 2.74
CNIH4-208	ENST00000477413	NLRP13	Q86W25	1043 aa		32.15	■■■□□ 2.74
CNIH4-208	ENST00000477413	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		32.13	■■■□□ 2.73
CNIH4-208	ENST00000477413	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		32.13	■■■□□ 2.73
CNIH4-208	ENST00000477413	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		32.13	■■■□□ 2.73
CNIH4-208	ENST00000477413	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	32.13	■■■□□ 2.73
CNIH4-208	ENST00000477413	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	32.12	■■■□□ 2.73
CNIH4-208	ENST00000477413	CD163L1	Q9NR16	1453 aa		32.11	■■■□□ 2.73
CNIH4-208	ENST00000477413	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		32.11	■■■□□ 2.73
CNIH4-208	ENST00000477413	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		32.1	■■■□□ 2.73
CNIH4-208	ENST00000477413	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		32.08	■■■□□ 2.73
CNIH4-208	ENST00000477413	GC	P02774	474 aa		32.08	■■■□□ 2.73
CNIH4-208	ENST00000477413	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		32.08	■■■□□ 2.73
CNIH4-208	ENST00000477413	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	32.07	■■■□□ 2.72
CNIH4-208	ENST00000477413	CCDC125	Q86Z20	511 aa		32.07	■■■□□ 2.72
CNIH4-208	ENST00000477413	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	32.07	■■■□□ 2.72
CNIH4-208	ENST00000477413	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		32.06	■■■□□ 2.72
CNIH4-208	ENST00000477413	CHRNA2	Q15822	529 aa		32.06	■■■□□ 2.72
CNIH4-208	ENST00000477413	TESK2	Q96S53	571 aa		32.06	■■■□□ 2.72
CNIH4-208	ENST00000477413	COL18A1	P39060	1754 aa		32.05	■■■□□ 2.72
CNIH4-208	ENST00000477413	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		32.04	■■■□□ 2.72
CNIH4-208	ENST00000477413	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	32.04	■■■□□ 2.72
CNIH4-208	ENST00000477413	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	32.03	■■■□□ 2.72
CNIH4-208	ENST00000477413	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		32.03	■■■□□ 2.72
CNIH4-208	ENST00000477413	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	32.03	■■■□□ 2.72
CNIH4-208	ENST00000477413	ABCC6	O95255	1503 aa		32.02	■■■□□ 2.72
CNIH4-208	ENST00000477413	SLC24A1	O60721	1099 aa		32.02	■■■□□ 2.72
CNIH4-208	ENST00000477413	NLRP6	P59044	892 aa		32.02	■■■□□ 2.72
CNIH4-208	ENST00000477413	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		32.02	■■■□□ 2.72
CNIH4-208	ENST00000477413	NFAT5	O94916	1531 aa		32.01	■■■□□ 2.72
CNIH4-208	ENST00000477413	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	32.01	■■■□□ 2.71
CNIH4-208	ENST00000477413	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		32	■■■□□ 2.71
CNIH4-208	ENST00000477413	USP31	Q70CQ4	1352 aa		31.98	■■■□□ 2.71
CNIH4-208	ENST00000477413	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	31.98	■■■□□ 2.71
CNIH4-208	ENST00000477413	ST20-MTHFS	A0A0A6YYL1	179 aa		31.97	■■■□□ 2.71
CNIH4-208	ENST00000477413	USP47	Q96K76	1375 aa		31.96	■■■□□ 2.71
CNIH4-208	ENST00000477413	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		31.95	■■■□□ 2.71
CNIH4-208	ENST00000477413		A0A1W2PP64	1363 aa		31.94	■■■□□ 2.7
CNIH4-208	ENST00000477413	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	31.93	■■■□□ 2.7
CNIH4-208	ENST00000477413	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		31.93	■■■□□ 2.7
CNIH4-208	ENST00000477413	STRN4	Q9NRL3	753 aa		31.92	■■■□□ 2.7
CNIH4-208	ENST00000477413	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		31.91	■■■□□ 2.7
CNIH4-208	ENST00000477413	CRB1	P82279	1406 aa		31.91	■■■□□ 2.7
CNIH4-208	ENST00000477413	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		31.9	■■■□□ 2.7
CNIH4-208	ENST00000477413	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		31.9	■■■□□ 2.7
CNIH4-208	ENST00000477413	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	31.89	■■■□□ 2.7
CNIH4-208	ENST00000477413	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	31.89	■■■□□ 2.7
CNIH4-208	ENST00000477413	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		31.89	■■■□□ 2.7
CNIH4-208	ENST00000477413	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	31.89	■■■□□ 2.7
CNIH4-208	ENST00000477413	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		31.88	■■■□□ 2.69
CNIH4-208	ENST00000477413	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		31.88	■■■□□ 2.69
CNIH4-208	ENST00000477413	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		31.87	■■■□□ 2.69
CNIH4-208	ENST00000477413	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		31.87	■■■□□ 2.69
CNIH4-208	ENST00000477413		A0A0G2JS52	829 aa		31.87	■■■□□ 2.69
CNIH4-208	ENST00000477413	EVA1C	P58658	441 aa		31.87	■■■□□ 2.69
CNIH4-208	ENST00000477413	MYT1	Q01538	1121 aa		31.87	■■■□□ 2.69
CNIH4-208	ENST00000477413	RGPD5	Q99666	1765 aa		31.86	■■■□□ 2.69
CNIH4-208	ENST00000477413	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	31.86	■■■□□ 2.69

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