RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472446.1

PEMT-208, Transcript of phosphatidylethanolamine N-methyltransferase, human

TSL 3

Gene PEMT, Length 473 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PEMT-208	ENST00000472446	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	33.97	■■■■□ 3.03
PEMT-208	ENST00000472446	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	33.94	■■■■□ 3.02
PEMT-208	ENST00000472446	ALS2	Q96Q42	1657 aa		33.93	■■■■□ 3.02
PEMT-208	ENST00000472446	BAG6	P46379	1132 aa		33.93	■■■■□ 3.02
PEMT-208	ENST00000472446	NRAP	Q86VF7	1730 aa		33.9	■■■■□ 3.02
PEMT-208	ENST00000472446	HRC	P23327	699 aa		33.9	■■■■□ 3.02
PEMT-208	ENST00000472446	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		33.9	■■■■□ 3.02
PEMT-208	ENST00000472446	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	33.88	■■■■□ 3.01
PEMT-208	ENST00000472446	ITSN1	Q15811	1721 aa		33.86	■■■■□ 3.01
PEMT-208	ENST00000472446	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		33.84	■■■■□ 3.01
PEMT-208	ENST00000472446	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		33.84	■■■■□ 3.01
PEMT-208	ENST00000472446	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	33.82	■■■■□ 3
PEMT-208	ENST00000472446	CDK19	Q9BWU1	502 aa		33.81	■■■■□ 3
PEMT-208	ENST00000472446	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		33.8	■■■■□ 3
PEMT-208	ENST00000472446	ATP7B	P35670	1465 aa		33.8	■■■■□ 3
PEMT-208	ENST00000472446	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		33.76	■■■■□ 3
PEMT-208	ENST00000472446	KIAA0232	Q92628	1395 aa		33.76	■■■■□ 3
PEMT-208	ENST00000472446	STRN4	Q9NRL3	753 aa		33.76	■■■□□ 2.99
PEMT-208	ENST00000472446	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		33.76	■■■□□ 2.99
PEMT-208	ENST00000472446	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	33.74	■■■□□ 2.99
PEMT-208	ENST00000472446	CHRNA2	Q15822	529 aa		33.74	■■■□□ 2.99
PEMT-208	ENST00000472446	FAM182B	Q5T319	152 aa		33.74	■■■□□ 2.99
PEMT-208	ENST00000472446	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		33.74	■■■□□ 2.99
PEMT-208	ENST00000472446	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		33.73	■■■□□ 2.99
PEMT-208	ENST00000472446	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	33.73	■■■□□ 2.99
PEMT-208	ENST00000472446	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	33.73	■■■□□ 2.99
PEMT-208	ENST00000472446	ACE	P12821	1306 aa		33.73	■■■□□ 2.99
PEMT-208	ENST00000472446	EVA1C	P58658	441 aa		33.72	■■■□□ 2.99
PEMT-208	ENST00000472446	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		33.72	■■■□□ 2.99
PEMT-208	ENST00000472446	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		33.72	■■■□□ 2.99
PEMT-208	ENST00000472446	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	33.7	■■■□□ 2.98
PEMT-208	ENST00000472446	ABTB2	Q8N961	1025 aa		33.69	■■■□□ 2.98
PEMT-208	ENST00000472446	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		33.68	■■■□□ 2.98
PEMT-208	ENST00000472446	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	33.68	■■■□□ 2.98
PEMT-208	ENST00000472446	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		33.67	■■■□□ 2.98
PEMT-208	ENST00000472446	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		33.67	■■■□□ 2.98
PEMT-208	ENST00000472446	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		33.67	■■■□□ 2.98
PEMT-208	ENST00000472446	LRP5	O75197	1615 aa		33.66	■■■□□ 2.98
PEMT-208	ENST00000472446	USP35	Q9P2H5	1018 aa		33.66	■■■□□ 2.98
PEMT-208	ENST00000472446	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	33.65	■■■□□ 2.98
PEMT-208	ENST00000472446	PDE3B	Q13370	1112 aa		33.63	■■■□□ 2.97
PEMT-208	ENST00000472446	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		33.63	■■■□□ 2.97
PEMT-208	ENST00000472446	NLRP13	Q86W25	1043 aa		33.61	■■■□□ 2.97
PEMT-208	ENST00000472446	DISP2	A7MBM2	1401 aa		33.61	■■■□□ 2.97
PEMT-208	ENST00000472446	TRIM37	O94972	964 aa		33.6	■■■□□ 2.97
PEMT-208	ENST00000472446	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		33.6	■■■□□ 2.97
PEMT-208	ENST00000472446	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		33.59	■■■□□ 2.97
PEMT-208	ENST00000472446	SSH2	Q76I76	1423 aa		33.59	■■■□□ 2.97
PEMT-208	ENST00000472446	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	33.58	■■■□□ 2.97
PEMT-208	ENST00000472446	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	33.58	■■■□□ 2.97
PEMT-208	ENST00000472446	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	33.58	■■■□□ 2.97
PEMT-208	ENST00000472446	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		33.56	■■■□□ 2.96
PEMT-208	ENST00000472446	APBA3	O96018	575 aa		33.56	■■■□□ 2.96
PEMT-208	ENST00000472446	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		33.56	■■■□□ 2.96
PEMT-208	ENST00000472446	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	33.55	■■■□□ 2.96
PEMT-208	ENST00000472446	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	33.54	■■■□□ 2.96
PEMT-208	ENST00000472446	CABP2	Q9NPB3	220 aa		33.54	■■■□□ 2.96
PEMT-208	ENST00000472446	CPD	O75976	1380 aa		33.54	■■■□□ 2.96
PEMT-208	ENST00000472446	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		33.54	■■■□□ 2.96
PEMT-208	ENST00000472446	USP19	O94966	1318 aa		33.53	■■■□□ 2.96
PEMT-208	ENST00000472446	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	33.52	■■■□□ 2.96
PEMT-208	ENST00000472446	GC	P02774	474 aa		33.52	■■■□□ 2.96
PEMT-208	ENST00000472446	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	33.52	■■■□□ 2.96
PEMT-208	ENST00000472446	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		33.51	■■■□□ 2.95
PEMT-208	ENST00000472446	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		33.5	■■■□□ 2.95
PEMT-208	ENST00000472446	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		33.5	■■■□□ 2.95
PEMT-208	ENST00000472446	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		33.49	■■■□□ 2.95
PEMT-208	ENST00000472446	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	33.45	■■■□□ 2.95
PEMT-208	ENST00000472446	NLRP6	P59044	892 aa		33.45	■■■□□ 2.95
PEMT-208	ENST00000472446	NBPF14	Q5TI25	921 aa		33.45	■■■□□ 2.95
PEMT-208	ENST00000472446	CABP1	Q9NZU7	370 aa		33.45	■■■□□ 2.95
PEMT-208	ENST00000472446	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		33.44	■■■□□ 2.94
PEMT-208	ENST00000472446	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		33.42	■■■□□ 2.94
PEMT-208	ENST00000472446	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	33.4	■■■□□ 2.94
PEMT-208	ENST00000472446	EVC2	Q86UK5	1308 aa		33.4	■■■□□ 2.94
PEMT-208	ENST00000472446	USP6	P35125	1406 aa		33.39	■■■□□ 2.94
PEMT-208	ENST00000472446	CRB1	P82279	1406 aa		33.39	■■■□□ 2.94
PEMT-208	ENST00000472446	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		33.36	■■■□□ 2.93
PEMT-208	ENST00000472446	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		33.35	■■■□□ 2.93
PEMT-208	ENST00000472446	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		33.34	■■■□□ 2.93
PEMT-208	ENST00000472446	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	33.33	■■■□□ 2.93
PEMT-208	ENST00000472446	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	33.32	■■■□□ 2.92
PEMT-208	ENST00000472446	DDB1	Q16531	1140 aa		33.31	■■■□□ 2.92
PEMT-208	ENST00000472446	RREB1	Q92766	1687 aa		33.31	■■■□□ 2.92
PEMT-208	ENST00000472446	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		33.3	■■■□□ 2.92
PEMT-208	ENST00000472446	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		33.3	■■■□□ 2.92
PEMT-208	ENST00000472446	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		33.3	■■■□□ 2.92
PEMT-208	ENST00000472446	SLIT3	O75094	1523 aa		33.3	■■■□□ 2.92
PEMT-208	ENST00000472446	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		33.28	■■■□□ 2.92
PEMT-208	ENST00000472446	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	33.28	■■■□□ 2.92
PEMT-208	ENST00000472446	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		33.26	■■■□□ 2.92
PEMT-208	ENST00000472446	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	33.25	■■■□□ 2.91
PEMT-208	ENST00000472446	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		33.24	■■■□□ 2.91
PEMT-208	ENST00000472446	NEUROD1	Q13562	356 aa		33.24	■■■□□ 2.91
PEMT-208	ENST00000472446	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		33.24	■■■□□ 2.91
PEMT-208	ENST00000472446	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		33.24	■■■□□ 2.91
PEMT-208	ENST00000472446	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		33.24	■■■□□ 2.91
PEMT-208	ENST00000472446	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		33.23	■■■□□ 2.91
PEMT-208	ENST00000472446	SOX12	O15370	315 aa		33.22	■■■□□ 2.91
PEMT-208	ENST00000472446	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	33.22	■■■□□ 2.91

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