RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471526.1

SHQ1-206, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 4

Gene SHQ1, Length 553 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-206ENST00000471526 NWD2Q9ULI1 1742 aa27.89■■■□□ 2.06
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SHQ1-206ENST00000471526 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa27.65■■■□□ 2.02
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SHQ1-206ENST00000471526 USP6P35125 1406 aa27.57■■■□□ 2
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SHQ1-206ENST00000471526 DDB1Q16531 1140 aa27.37■■□□□ 1.97
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SHQ1-206ENST00000471526 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa27.36■■□□□ 1.97
SHQ1-206ENST00000471526 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP27.36■■□□□ 1.97
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SHQ1-206ENST00000471526 LRP5O75197 1615 aa27.34■■□□□ 1.97
SHQ1-206ENST00000471526 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
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