RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468247.1

RERE-210, Transcript of arginine-glutamic acid dipeptide repeats, humanhuman

TSL 2

Gene RERE, Length 414 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RERE-210ENST00000468247 ACEP12821 1306 aa30.15■■■□□ 2.42
RERE-210ENST00000468247 QRICH2Q9H0J4 1663 aa30.14■■■□□ 2.42
RERE-210ENST00000468247 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa30.14■■■□□ 2.42
RERE-210ENST00000468247 PLEKHG3A1L390 1219 aa30.13■■■□□ 2.41
RERE-210ENST00000468247 CABP2Q9NPB3 220 aa30.13■■■□□ 2.41
RERE-210ENST00000468247 NWD2Q9ULI1 1742 aa30.13■■■□□ 2.41
RERE-210ENST00000468247 NBPF8Q3BBV2 869 aa30.12■■■□□ 2.41
RERE-210ENST00000468247 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP30.11■■■□□ 2.41
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RERE-210ENST00000468247 ATAD2Q6PL18 1390 aa30.11■■■□□ 2.41
RERE-210ENST00000468247 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP30.09■■■□□ 2.41
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RERE-210ENST00000468247 EP400Q96L91 3159 aa30.07■■■□□ 2.4
RERE-210ENST00000468247 NRAPQ86VF7 1730 aa30.06■■■□□ 2.4
RERE-210ENST00000468247 BTG4Q9NY30 223 aa30.06■■■□□ 2.4
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RERE-210ENST00000468247 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa29.92■■■□□ 2.38
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RERE-210ENST00000468247 DEFB132Q7Z7B7 95 aa29.76■■■□□ 2.35
RERE-210ENST00000468247 USP35Q9P2H5 1018 aa29.76■■■□□ 2.35
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RERE-210ENST00000468247 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP29.71■■■□□ 2.35
RERE-210ENST00000468247 TTC21AQ8NDW8 1320 aa29.7■■■□□ 2.34
RERE-210ENST00000468247 MON2Q7Z3U7 1717 aa29.69■■■□□ 2.34
RERE-210ENST00000468247 AATKQ6ZMQ8 1374 aa29.68■■■□□ 2.34
RERE-210ENST00000468247 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP29.68■■■□□ 2.34
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RERE-210ENST00000468247 TESK2Q96S53 571 aa29.68■■■□□ 2.34
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RERE-210ENST00000468247 ZRANB1Q9UGI0 708 aa29.67■■■□□ 2.34
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RERE-210ENST00000468247 ARHGEF25Q86VW2 580 aa29.63■■■□□ 2.33
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RERE-210ENST00000468247 KCNH5Q8NCM2 988 aa29.61■■■□□ 2.33
RERE-210ENST00000468247 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP29.6■■■□□ 2.33
RERE-210ENST00000468247 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP29.59■■■□□ 2.33
RERE-210ENST00000468247 A0A1W2PP64 1363 aa29.59■■■□□ 2.33
RERE-210ENST00000468247 USP31Q70CQ4 1352 aa29.59■■■□□ 2.33
RERE-210ENST00000468247 RGPD1P0DJD0 1748 aa29.58■■■□□ 2.33
RERE-210ENST00000468247 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP29.58■■■□□ 2.33
RERE-210ENST00000468247 BAG6P46379 1132 aa29.57■■■□□ 2.32
RERE-210ENST00000468247 PCGF6Q9BYE7 350 aa29.57■■■□□ 2.32
RERE-210ENST00000468247 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP29.56■■■□□ 2.32
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