RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466222.6

CAPN3-209, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 2

Gene CAPN3, Length 1,934 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-209ENST00000466222 USP6P35125 1406 aa25.03■■□□□ 1.6
CAPN3-209ENST00000466222 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa25.03■■□□□ 1.6
CAPN3-209ENST00000466222 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa25.03■■□□□ 1.6
CAPN3-209ENST00000466222 FOXO3O43524 673 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPN3-209ENST00000466222 MSH6P52701 1360 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPN3-209ENST00000466222 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
CAPN3-209ENST00000466222 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
CAPN3-209ENST00000466222 C1orf167Q5SNV9 1468 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPN3-209ENST00000466222 CADPS2Q86UW7 1296 aa25■■□□□ 1.59
CAPN3-209ENST00000466222 NSD2O96028 1365 aa25■■□□□ 1.59
CAPN3-209ENST00000466222 MST1RQ04912 1400 aa24.99■■□□□ 1.59
CAPN3-209ENST00000466222 SSH2Q76I76 1423 aa24.99■■□□□ 1.59
CAPN3-209ENST00000466222 FKBP8Q14318 412 aa24.99■■□□□ 1.59
CAPN3-209ENST00000466222 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
CAPN3-209ENST00000466222 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
CAPN3-209ENST00000466222 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
CAPN3-209ENST00000466222 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
CAPN3-209ENST00000466222 PSME1Q06323 249 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPN3-209ENST00000466222 NUTM2GQ5VZR2 741 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPN3-209ENST00000466222 DCCP43146 1447 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPN3-209ENST00000466222 MTHFSP49914 203 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPN3-209ENST00000466222 COG3Q96JB2 828 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPN3-209ENST00000466222 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPN3-209ENST00000466222 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPN3-209ENST00000466222 SLAIN2Q9P270 581 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPN3-209ENST00000466222 SOX12O15370 315 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPN3-209ENST00000466222 MON2Q7Z3U7 1717 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPN3-209ENST00000466222 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
CAPN3-209ENST00000466222 AKAP12Q02952 1782 aa24.89■■□□□ 1.58
CAPN3-209ENST00000466222 ABTB2Q8N961 1025 aa24.89■■□□□ 1.58
CAPN3-209ENST00000466222 TTC21AQ8NDW8 1320 aa24.89■■□□□ 1.57
CAPN3-209ENST00000466222 ITSN1Q15811 1721 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPN3-209ENST00000466222 BRINP3Q76B58 766 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPN3-209ENST00000466222 NLRP6P59044 892 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPN3-209ENST00000466222 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
CAPN3-209ENST00000466222 KRT28Q7Z3Y7 464 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPN3-209ENST00000466222 NRKQ7Z2Y5 1582 aa24.87■■□□□ 1.57
CAPN3-209ENST00000466222 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
CAPN3-209ENST00000466222 PLEKHG5O94827 1062 aa24.87■■□□□ 1.57
CAPN3-209ENST00000466222 POLKQ9UBT6 870 aa24.87■■□□□ 1.57
CAPN3-209ENST00000466222 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPN3-209ENST00000466222 LTBP4Q8N2S1 1624 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPN3-209ENST00000466222 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP24.85■■□□□ 1.57
CAPN3-209ENST00000466222 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPN3-209ENST00000466222 OVOS2Q6IE36 1432 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPN3-209ENST00000466222 LMOD2Q6P5Q4 547 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPN3-209ENST00000466222 ADAMTS8Q9UP79 889 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPN3-209ENST00000466222 USP31Q70CQ4 1352 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPN3-209ENST00000466222 KIF20BQ96Q89 1820 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPN3-209ENST00000466222 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP24.78■■□□□ 1.56
CAPN3-209ENST00000466222 NPHP3Q7Z494 1330 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPN3-209ENST00000466222 ERICH6BQ5W0A0 696 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPN3-209ENST00000466222 AATKQ6ZMQ8 1374 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPN3-209ENST00000466222 CFAP53Q96M91 514 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPN3-209ENST00000466222 PIK3C2AO00443 1686 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPN3-209ENST00000466222 PNPLA6Q8IY17 1366 aa24.73■■□□□ 1.55
CAPN3-209ENST00000466222 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa24.73■■□□□ 1.55
CAPN3-209ENST00000466222 MAP3K19Q56UN5 1328 aa24.73■■□□□ 1.55
CAPN3-209ENST00000466222 CCDC146Q8IYE0 955 aa24.73■■□□□ 1.55
CAPN3-209ENST00000466222 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
CAPN3-209ENST00000466222 KIF1AQ12756 1690 aa24.7■■□□□ 1.55
CAPN3-209ENST00000466222 PXDNQ92626 1479 aa24.7■■□□□ 1.54
CAPN3-209ENST00000466222 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
CAPN3-209ENST00000466222 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa24.7■■□□□ 1.54
CAPN3-209ENST00000466222 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
CAPN3-209ENST00000466222 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
CAPN3-209ENST00000466222 CABLES1Q8TDN4 633 aa24.69■■□□□ 1.54
CAPN3-209ENST00000466222 ZBED9Q6R2W3 1325 aa24.69■■□□□ 1.54
CAPN3-209ENST00000466222 GCP02774 474 aa24.68■■□□□ 1.54
CAPN3-209ENST00000466222 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
CAPN3-209ENST00000466222 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP24.68■■□□□ 1.54
CAPN3-209ENST00000466222 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
CAPN3-209ENST00000466222 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa24.68■■□□□ 1.54
CAPN3-209ENST00000466222 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
CAPN3-209ENST00000466222 ZBTB7CA1YPR0 619 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPN3-209ENST00000466222 SBNO1A3KN83 1393 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPN3-209ENST00000466222 PIP4K2BP78356 416 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPN3-209ENST00000466222 INSRP06213 1382 aa24.65■■□□□ 1.54
CAPN3-209ENST00000466222 IL13P35225 146 aa24.65■■□□□ 1.54
CAPN3-209ENST00000466222 AMPHP49418 695 aa24.65■■□□□ 1.54
CAPN3-209ENST00000466222 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
CAPN3-209ENST00000466222 USP19O94966 1318 aa24.64■■□□□ 1.53
CAPN3-209ENST00000466222 TNS3Q68CZ2 1445 aa24.64■■□□□ 1.53
CAPN3-209ENST00000466222 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
CAPN3-209ENST00000466222 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
CAPN3-209ENST00000466222 NUDCQ9Y266 331 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPN3-209ENST00000466222 KCNH5Q8NCM2 988 aa24.62■■□□□ 1.53
CAPN3-209ENST00000466222 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
CAPN3-209ENST00000466222 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
CAPN3-209ENST00000466222 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
CAPN3-209ENST00000466222 HOXC9P31274 260 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPN3-209ENST00000466222 SHPRHQ149N8 1683 aa24.6■■□□□ 1.53
CAPN3-209ENST00000466222 HMOX1P09601 288 aa24.6■■□□□ 1.53
CAPN3-209ENST00000466222 UBAP1LF5GYI3 381 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPN3-209ENST00000466222 APAF1O14727 1248 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPN3-209ENST00000466222 TOM1O60784 492 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPN3-209ENST00000466222 PEAK1Q9H792 1746 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPN3-209ENST00000466222 ARHGEF25Q86VW2 580 aa24.58■■□□□ 1.53
CAPN3-209ENST00000466222 FLT4P35916 1363 aa24.58■■□□□ 1.53
CAPN3-209ENST00000466222 NFAT5O94916 1531 aa24.58■■□□□ 1.52
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