RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466015.1

EHD1-208, Transcript of EH domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene EHD1, Length 1,290 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD1-208ENST00000466015 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa26.81■■□□□ 1.88
EHD1-208ENST00000466015 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
EHD1-208ENST00000466015 NUTM2GQ5VZR2 741 aa26.8■■□□□ 1.88
EHD1-208ENST00000466015 ABTB2Q8N961 1025 aa26.79■■□□□ 1.88
EHD1-208ENST00000466015 UNC5CLQ8IV45 518 aa26.78■■□□□ 1.88
EHD1-208ENST00000466015 ATAD2Q6PL18 1390 aa26.78■■□□□ 1.88
EHD1-208ENST00000466015 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa26.78■■□□□ 1.88
EHD1-208ENST00000466015 BCL9LQ86UU0 1499 aa26.77■■□□□ 1.88
EHD1-208ENST00000466015 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
EHD1-208ENST00000466015 ALS2Q96Q42 1657 aa26.76■■□□□ 1.87
EHD1-208ENST00000466015 ATRNO75882 1429 aa26.75■■□□□ 1.87
EHD1-208ENST00000466015 FAM83GA6ND36 823 aa26.74■■□□□ 1.87
EHD1-208ENST00000466015 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
EHD1-208ENST00000466015 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
EHD1-208ENST00000466015 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
EHD1-208ENST00000466015 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa26.73■■□□□ 1.87
EHD1-208ENST00000466015 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
EHD1-208ENST00000466015 PRDM11Q9NQV5 511 aa26.73■■□□□ 1.87
EHD1-208ENST00000466015 SLIT2O94813 1529 aa26.73■■□□□ 1.87
EHD1-208ENST00000466015 SLC24A1O60721 1099 aa26.72■■□□□ 1.87
EHD1-208ENST00000466015 NLRP13Q86W25 1043 aa26.72■■□□□ 1.87
EHD1-208ENST00000466015 TMC1Q8TDI8 760 aa26.72■■□□□ 1.87
EHD1-208ENST00000466015 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
EHD1-208ENST00000466015 USP6P35125 1406 aa26.71■■□□□ 1.87
EHD1-208ENST00000466015 BTG4Q9NY30 223 aa26.7■■□□□ 1.86
EHD1-208ENST00000466015 RGS12O14924 1447 aa26.7■■□□□ 1.86
EHD1-208ENST00000466015 ABCA3Q99758 1704 aa26.69■■□□□ 1.86
EHD1-208ENST00000466015 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
EHD1-208ENST00000466015 USP47Q96K76 1375 aa26.68■■□□□ 1.86
EHD1-208ENST00000466015 NLRP6P59044 892 aa26.67■■□□□ 1.86
EHD1-208ENST00000466015 VPS72Q15906 364 aa26.67■■□□□ 1.86
EHD1-208ENST00000466015 KIAA0232Q92628 1395 aa26.66■■□□□ 1.86
EHD1-208ENST00000466015 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
EHD1-208ENST00000466015 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
EHD1-208ENST00000466015 TESK2Q96S53 571 aa26.64■■□□□ 1.86
EHD1-208ENST00000466015 CHRNA2Q15822 529 aa26.63■■□□□ 1.85
EHD1-208ENST00000466015 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
EHD1-208ENST00000466015 USP19O94966 1318 aa26.63■■□□□ 1.85
EHD1-208ENST00000466015 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa26.63■■□□□ 1.85
EHD1-208ENST00000466015 TERF2IPQ9NYB0 399 aa26.62■■□□□ 1.85
EHD1-208ENST00000466015 GCP02774 474 aa26.61■■□□□ 1.85
EHD1-208ENST00000466015 TMF1P82094 1093 aa26.61■■□□□ 1.85
EHD1-208ENST00000466015 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
EHD1-208ENST00000466015 TTC21AQ8NDW8 1320 aa26.61■■□□□ 1.85
EHD1-208ENST00000466015 PLCH1Q4KWH8 1693 aa26.6■■□□□ 1.85
EHD1-208ENST00000466015 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
EHD1-208ENST00000466015 ZBTB7CA1YPR0 619 aa26.6■■□□□ 1.85
EHD1-208ENST00000466015 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa26.6■■□□□ 1.85
EHD1-208ENST00000466015 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
EHD1-208ENST00000466015 SSH2Q76I76 1423 aa26.59■■□□□ 1.85
EHD1-208ENST00000466015 A0A0G2JS52 829 aa26.59■■□□□ 1.85
EHD1-208ENST00000466015 MYT1Q01538 1121 aa26.59■■□□□ 1.85
EHD1-208ENST00000466015 NWD2Q9ULI1 1742 aa26.59■■□□□ 1.85
EHD1-208ENST00000466015 EVA1CP58658 441 aa26.58■■□□□ 1.85
EHD1-208ENST00000466015 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP26.58■■□□□ 1.85
EHD1-208ENST00000466015 STRN4Q9NRL3 753 aa26.58■■□□□ 1.85
EHD1-208ENST00000466015 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa26.57■■□□□ 1.84
EHD1-208ENST00000466015 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP26.57■■□□□ 1.84
EHD1-208ENST00000466015 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
EHD1-208ENST00000466015 CDCA8Q53HL2 280 aa26.55■■□□□ 1.84
EHD1-208ENST00000466015 CPDO75976 1380 aa26.55■■□□□ 1.84
EHD1-208ENST00000466015 SEPT12Q8IYM1 358 aa26.54■■□□□ 1.84
EHD1-208ENST00000466015 NINLQ9Y2I6 1382 aa26.54■■□□□ 1.84
EHD1-208ENST00000466015 GLI3P10071 1580 aa26.54■■□□□ 1.84
EHD1-208ENST00000466015 NRKQ7Z2Y5 1582 aa26.54■■□□□ 1.84
EHD1-208ENST00000466015 SOX12O15370 315 aa26.53■■□□□ 1.84
EHD1-208ENST00000466015 KCNH5Q8NCM2 988 aa26.53■■□□□ 1.84
EHD1-208ENST00000466015 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
EHD1-208ENST00000466015 A0A1W2PP64 1363 aa26.5■■□□□ 1.83
EHD1-208ENST00000466015 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa26.5■■□□□ 1.83
EHD1-208ENST00000466015 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa26.5■■□□□ 1.83
EHD1-208ENST00000466015 AKAP12Q02952 1782 aa26.49■■□□□ 1.83
EHD1-208ENST00000466015 PIK3C2AO00443 1686 aa26.49■■□□□ 1.83
EHD1-208ENST00000466015 CD163L1Q9NR16 1453 aa26.49■■□□□ 1.83
EHD1-208ENST00000466015 NME9Q86XW9 330 aa26.48■■□□□ 1.83
EHD1-208ENST00000466015 NRAPQ86VF7 1730 aa26.48■■□□□ 1.83
EHD1-208ENST00000466015 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
EHD1-208ENST00000466015 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
EHD1-208ENST00000466015 USP35Q9P2H5 1018 aa26.47■■□□□ 1.83
EHD1-208ENST00000466015 SLIT3O75094 1523 aa26.47■■□□□ 1.83
EHD1-208ENST00000466015 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP26.45■■□□□ 1.82
EHD1-208ENST00000466015 ZRANB1Q9UGI0 708 aa26.45■■□□□ 1.82
EHD1-208ENST00000466015 AATKQ6ZMQ8 1374 aa26.45■■□□□ 1.82
EHD1-208ENST00000466015 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa26.44■■□□□ 1.82
EHD1-208ENST00000466015 KRT27Q7Z3Y8 459 aa26.44■■□□□ 1.82
EHD1-208ENST00000466015 MON2Q7Z3U7 1717 aa26.43■■□□□ 1.82
EHD1-208ENST00000466015 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
EHD1-208ENST00000466015 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa26.42■■□□□ 1.82
EHD1-208ENST00000466015 USP31Q70CQ4 1352 aa26.42■■□□□ 1.82
EHD1-208ENST00000466015 ARHGEF25Q86VW2 580 aa26.41■■□□□ 1.82
EHD1-208ENST00000466015 POLR3GLQ9BT43 218 aa26.41■■□□□ 1.82
EHD1-208ENST00000466015 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa26.41■■□□□ 1.82
EHD1-208ENST00000466015 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
EHD1-208ENST00000466015 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa26.38■■□□□ 1.81
EHD1-208ENST00000466015 TCP11L2Q8N4U5 519 aa26.38■■□□□ 1.81
EHD1-208ENST00000466015 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
EHD1-208ENST00000466015 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa26.37■■□□□ 1.81
EHD1-208ENST00000466015 CCDC125Q86Z20 511 aa26.37■■□□□ 1.81
EHD1-208ENST00000466015 COG3Q96JB2 828 aa26.37■■□□□ 1.81
EHD1-208ENST00000466015 LMO7Q8WWI1 1683 aa26.36■■□□□ 1.81
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