RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 FKBP8Q14318 412 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRC-210ENST00000462363 ERICH6BQ5W0A0 696 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRC-210ENST00000462363 SIRT1Q96EB6 747 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRC-210ENST00000462363 NUDCQ9Y266 331 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRC-210ENST00000462363 DIP2AQ14689 1571 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRC-210ENST00000462363 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRC-210ENST00000462363 NRKQ7Z2Y5 1582 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRC-210ENST00000462363 IQSEC2Q5JU85 1478 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRC-210ENST00000462363 A0A1W2PP64 1363 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRC-210ENST00000462363 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRC-210ENST00000462363 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
PTPRC-210ENST00000462363 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRC-210ENST00000462363 ATAD2Q6PL18 1390 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRC-210ENST00000462363 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRC-210ENST00000462363 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP7.6□□□□□ -1.19
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PTPRC-210ENST00000462363 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
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PTPRC-210ENST00000462363 PDE3BQ13370 1112 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRC-210ENST00000462363 MLECQ14165 292 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRC-210ENST00000462363 PRAM1Q96QH2 718 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRC-210ENST00000462363 PTPRUQ92729 1446 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRC-210ENST00000462363 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.2
PTPRC-210ENST00000462363 ITSN1Q15811 1721 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRC-210ENST00000462363 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
PTPRC-210ENST00000462363 ADAMTS8Q9UP79 889 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRC-210ENST00000462363 NALCNQ8IZF0 1738 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRC-210ENST00000462363 CGNL1Q0VF96 1302 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRC-210ENST00000462363 LTKP29376 864 aa7.57□□□□□ -1.2
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PTPRC-210ENST00000462363 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
PTPRC-210ENST00000462363 CABP2Q9NPB3 220 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRC-210ENST00000462363 PTCH1Q13635 1447 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRC-210ENST00000462363 PNPLA6Q8IY17 1366 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRC-210ENST00000462363 ROBO2Q9HCK4 1378 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRC-210ENST00000462363 USP54Q70EL1 1684 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRC-210ENST00000462363 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
PTPRC-210ENST00000462363 NEFLP07196 543 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRC-210ENST00000462363 STK26Q9P289 416 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRC-210ENST00000462363 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRC-210ENST00000462363 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRC-210ENST00000462363 CDK19Q9BWU1 502 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRC-210ENST00000462363 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
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PTPRC-210ENST00000462363 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PTPRC-210ENST00000462363 FYB1O15117 783 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRC-210ENST00000462363 WAPLQ7Z5K2 1190 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRC-210ENST00000462363 NGEFQ8N5V2 710 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRC-210ENST00000462363 CDCA7LQ96GN5 454 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRC-210ENST00000462363 FMN2Q9NZ56 1722 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRC-210ENST00000462363 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PTPRC-210ENST00000462363 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PTPRC-210ENST00000462363 PRR36Q9H6K5 1346 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRC-210ENST00000462363 SSH2Q76I76 1423 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRC-210ENST00000462363 WASLO00401 505 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
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PTPRC-210ENST00000462363 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
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PTPRC-210ENST00000462363 LRRC7Q96NW7 1537 aa7.52□□□□□ -1.2
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PTPRC-210ENST00000462363 PIK3R4Q99570 1358 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRC-210ENST00000462363 HDGFP51858 240 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
PTPRC-210ENST00000462363 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP7.52□□□□□ -1.21
PTPRC-210ENST00000462363 MORC1Q86VD1 984 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRC-210ENST00000462363 SPNS2Q8IVW8 549 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRC-210ENST00000462363 TERF2IPQ9NYB0 399 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRC-210ENST00000462363 POGKQ9P215 609 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRC-210ENST00000462363 TBX22Q9Y458 520 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRC-210ENST00000462363 RGPD1P0DJD0 1748 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRC-210ENST00000462363 NWD1Q149M9 1564 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRC-210ENST00000462363 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
PTPRC-210ENST00000462363 AATKQ6ZMQ8 1374 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRC-210ENST00000462363 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRC-210ENST00000462363 MTHFSP49914 203 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRC-210ENST00000462363 RRP1P56182 461 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
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PTPRC-210ENST00000462363 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
PTPRC-210ENST00000462363 SLFN5Q08AF3 891 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRC-210ENST00000462363 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP7.51□□□□□ -1.21
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PTPRC-210ENST00000462363 MS4A3Q96HJ5 214 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRC-210ENST00000462363 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRC-210ENST00000462363 CABP1Q9NZU7 370 aa7.51□□□□□ -1.21
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PTPRC-210ENST00000462363 OVOS2Q6IE36 1432 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRC-210ENST00000462363 PEAK1Q9H792 1746 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRC-210ENST00000462363 TXNDC2Q86VQ3 553 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRC-210ENST00000462363 RCAN3Q9UKA8 241 aa7.5□□□□□ -1.21
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PTPRC-210ENST00000462363 PLEKHG3A1L390 1219 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRC-210ENST00000462363 CCDC27Q2M243 656 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRC-210ENST00000462363 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
PTPRC-210ENST00000462363 ANKARQ7Z5J8 1434 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRC-210ENST00000462363 APAF1O14727 1248 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRC-210ENST00000462363 USP6P35125 1406 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRC-210ENST00000462363 GOLGA2Q08379 1002 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRC-210ENST00000462363 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
PTPRC-210ENST00000462363 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
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