RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460909.1

RPUSD3-210, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 3, humanhuman

TSL 2

Gene RPUSD3, Length 578 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD3-210ENST00000460909 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
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RPUSD3-210ENST00000460909 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
RPUSD3-210ENST00000460909 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
RPUSD3-210ENST00000460909 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa28.89■■■□□ 2.22
RPUSD3-210ENST00000460909 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa28.89■■■□□ 2.21
RPUSD3-210ENST00000460909 ADAMTS2O95450 1211 aa28.88■■■□□ 2.21
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RPUSD3-210ENST00000460909 NINLQ9Y2I6 1382 aa28.85■■■□□ 2.21
RPUSD3-210ENST00000460909 CDCA8Q53HL2 280 aa28.83■■■□□ 2.21
RPUSD3-210ENST00000460909 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
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RPUSD3-210ENST00000460909 A0A1W2PP64 1363 aa28.8■■■□□ 2.2
RPUSD3-210ENST00000460909 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa28.8■■■□□ 2.2
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RPUSD3-210ENST00000460909 PIK3C2AO00443 1686 aa28.8■■■□□ 2.2
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RPUSD3-210ENST00000460909 NUTM2GQ5VZR2 741 aa28.79■■■□□ 2.2
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RPUSD3-210ENST00000460909 MYOM1P52179 1685 aa28.78■■■□□ 2.2
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RPUSD3-210ENST00000460909 SLIT3O75094 1523 aa28.69■■■□□ 2.18
RPUSD3-210ENST00000460909 FAM83GA6ND36 823 aa28.69■■■□□ 2.18
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RPUSD3-210ENST00000460909 GGNBP2Q9H3C7 697 aa28.49■■■□□ 2.15
RPUSD3-210ENST00000460909 COG3Q96JB2 828 aa28.48■■■□□ 2.15
RPUSD3-210ENST00000460909 LTN1O94822 1766 aa28.45■■■□□ 2.15
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RPUSD3-210ENST00000460909 ZBTB7CA1YPR0 619 aa28.44■■■□□ 2.14
RPUSD3-210ENST00000460909 AXIN2Q9Y2T1 843 aa28.44■■■□□ 2.14
RPUSD3-210ENST00000460909 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP28.44■■■□□ 2.14
RPUSD3-210ENST00000460909 RGS12O14924 1447 aa28.43■■■□□ 2.14
RPUSD3-210ENST00000460909 RGPD5Q99666 1765 aa28.43■■■□□ 2.14
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