RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458666.1

LMCD1-AS1-207, LMCD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene LMCD1-AS1, Length 581 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 ABTB2Q8N961 1025 aa14.88□□□□□ -0.03
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 EVC2Q86UK5 1308 aa14.88□□□□□ -0.03
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 RALGAPBQ86X10 1494 aa14.88□□□□□ -0.03
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 USP32Q8NFA0 1604 aa14.88□□□□□ -0.03
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 TONSLQ96HA7 1378 aa14.86□□□□□ -0.03
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 CCDC125Q86Z20 511 aa14.86□□□□□ -0.03
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 CABP1Q9NZU7 370 aa14.86□□□□□ -0.03
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa14.85□□□□□ -0.03
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 EVA1CP58658 441 aa14.84□□□□□ -0.03
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 CHRNA2Q15822 529 aa14.84□□□□□ -0.03
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 NLRP13Q86W25 1043 aa14.84□□□□□ -0.03
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 CARD11Q9BXL7 1154 aa14.84□□□□□ -0.03
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 STRN4Q9NRL3 753 aa14.84□□□□□ -0.03
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 KIAA0232Q92628 1395 aa14.84□□□□□ -0.03
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.03
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa14.83□□□□□ -0.03
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 KRT27Q7Z3Y8 459 aa14.83□□□□□ -0.04
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 ZBTB7CA1YPR0 619 aa14.81□□□□□ -0.04
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 NLRP6P59044 892 aa14.8□□□□□ -0.04
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 GCP02774 474 aa14.79□□□□□ -0.04
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa14.79□□□□□ -0.04
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa14.79□□□□□ -0.04
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 USP35Q9P2H5 1018 aa14.79□□□□□ -0.04
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 ZRANB1Q9UGI0 708 aa14.79□□□□□ -0.04
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 GLI3P10071 1580 aa14.77□□□□□ -0.04
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 USP19O94966 1318 aa14.76□□□□□ -0.05
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 ITSN1Q15811 1721 aa14.76□□□□□ -0.05
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 TMC1Q8TDI8 760 aa14.76□□□□□ -0.05
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 USP6P35125 1406 aa14.75□□□□□ -0.05
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 ALS2Q96Q42 1657 aa14.75□□□□□ -0.05
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa14.75□□□□□ -0.05
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 SOX12O15370 315 aa14.74□□□□□ -0.05
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 CPDO75976 1380 aa14.73□□□□□ -0.05
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa14.73□□□□□ -0.05
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 NWD2Q9ULI1 1742 aa14.72□□□□□ -0.05
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa14.72□□□□□ -0.05
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 PLCH1Q4KWH8 1693 aa14.72□□□□□ -0.05
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 BAG6P46379 1132 aa14.72□□□□□ -0.05
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 PDE3BQ13370 1112 aa14.72□□□□□ -0.05
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 FAM182BQ5T319 152 aa14.72□□□□□ -0.05
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 DEFB132Q7Z7B7 95 aa14.72□□□□□ -0.05
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 TCP11L2Q8N4U5 519 aa14.72□□□□□ -0.05
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 KCNH5Q8NCM2 988 aa14.72□□□□□ -0.05
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 QRICH2Q9H0J4 1663 aa14.71□□□□□ -0.05
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 TTC21AQ8NDW8 1320 aa14.71□□□□□ -0.05
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP14.71□□□□□ -0.05
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 EP400Q96L91 3159 aa14.71□□□□□ -0.05
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 SSH2Q76I76 1423 aa14.71□□□□□ -0.05
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 ABCA3Q99758 1704 aa14.71□□□□□ -0.05
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa14.71□□□□□ -0.06
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 SLC24A1O60721 1099 aa14.7□□□□□ -0.06
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 BARGINQ6ZT62 677 aa14.7□□□□□ -0.06
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 PCGF6Q9BYE7 350 aa14.7□□□□□ -0.06
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 TERF2IPQ9NYB0 399 aa14.7□□□□□ -0.06
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa14.7□□□□□ -0.06
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa14.69□□□□□ -0.06
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa14.68□□□□□ -0.06
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 FAM196AQ6ZSG2 479 aa14.68□□□□□ -0.06
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa14.68□□□□□ -0.06
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 AATKQ6ZMQ8 1374 aa14.68□□□□□ -0.06
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa14.67□□□□□ -0.06
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa14.65□□□□□ -0.06
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 NRKQ7Z2Y5 1582 aa14.65□□□□□ -0.06
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 TRIM37O94972 964 aa14.65□□□□□ -0.06
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 ARHGEF25Q86VW2 580 aa14.65□□□□□ -0.06
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 NRAPQ86VF7 1730 aa14.64□□□□□ -0.07
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 NME9Q86XW9 330 aa14.64□□□□□ -0.07
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 CRB1P82279 1406 aa14.64□□□□□ -0.07
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 APBA3O96018 575 aa14.63□□□□□ -0.07
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 AXIN2Q9Y2T1 843 aa14.63□□□□□ -0.07
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 TMF1P82094 1093 aa14.62□□□□□ -0.07
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa14.62□□□□□ -0.07
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 TESK2Q96S53 571 aa14.62□□□□□ -0.07
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 WDR17Q8IZU2 1322 aa14.62□□□□□ -0.07
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa14.61□□□□□ -0.07
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 DDB1Q16531 1140 aa14.61□□□□□ -0.07
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 SLIT3O75094 1523 aa14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.1 ms