RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458278.6

ANKRD54-208, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD54, Length 623 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-208ENST00000458278 ATRNO75882 1429 aa24.5■■□□□ 1.51
ANKRD54-208ENST00000458278 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa24.5■■□□□ 1.51
ANKRD54-208ENST00000458278 SLIT2O94813 1529 aa24.5■■□□□ 1.51
ANKRD54-208ENST00000458278 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
ANKRD54-208ENST00000458278 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa24.49■■□□□ 1.51
ANKRD54-208ENST00000458278 CLSPNQ9HAW4 1339 aa24.48■■□□□ 1.51
ANKRD54-208ENST00000458278 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa24.46■■□□□ 1.51
ANKRD54-208ENST00000458278 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
ANKRD54-208ENST00000458278 NWD2Q9ULI1 1742 aa24.45■■□□□ 1.5
ANKRD54-208ENST00000458278 UNC5CLQ8IV45 518 aa24.45■■□□□ 1.5
ANKRD54-208ENST00000458278 RGS12O14924 1447 aa24.44■■□□□ 1.5
ANKRD54-208ENST00000458278 PCGF6Q9BYE7 350 aa24.44■■□□□ 1.5
ANKRD54-208ENST00000458278 PLCH1Q4KWH8 1693 aa24.43■■□□□ 1.5
ANKRD54-208ENST00000458278 PLEKHG5O94827 1062 aa24.43■■□□□ 1.5
ANKRD54-208ENST00000458278 CABP1Q9NZU7 370 aa24.41■■□□□ 1.5
ANKRD54-208ENST00000458278 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa24.41■■□□□ 1.5
ANKRD54-208ENST00000458278 ATAD2Q6PL18 1390 aa24.41■■□□□ 1.5
ANKRD54-208ENST00000458278 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
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ANKRD54-208ENST00000458278 ABTB2Q8N961 1025 aa24.37■■□□□ 1.49
ANKRD54-208ENST00000458278 VPS72Q15906 364 aa24.36■■□□□ 1.49
ANKRD54-208ENST00000458278 GLI3P10071 1580 aa24.34■■□□□ 1.49
ANKRD54-208ENST00000458278 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
ANKRD54-208ENST00000458278 NRAPQ86VF7 1730 aa24.34■■□□□ 1.49
ANKRD54-208ENST00000458278 USP19O94966 1318 aa24.34■■□□□ 1.49
ANKRD54-208ENST00000458278 NLRP13Q86W25 1043 aa24.33■■□□□ 1.49
ANKRD54-208ENST00000458278 PRDM11Q9NQV5 511 aa24.33■■□□□ 1.49
ANKRD54-208ENST00000458278 AKAP12Q02952 1782 aa24.33■■□□□ 1.49
ANKRD54-208ENST00000458278 SSH2Q76I76 1423 aa24.33■■□□□ 1.49
ANKRD54-208ENST00000458278 SLC24A1O60721 1099 aa24.32■■□□□ 1.48
ANKRD54-208ENST00000458278 NUTM2GQ5VZR2 741 aa24.32■■□□□ 1.48
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ANKRD54-208ENST00000458278 NRKQ7Z2Y5 1582 aa24.31■■□□□ 1.48
ANKRD54-208ENST00000458278 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP24.31■■□□□ 1.48
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ANKRD54-208ENST00000458278 BTG4Q9NY30 223 aa24.31■■□□□ 1.48
ANKRD54-208ENST00000458278 KIAA0232Q92628 1395 aa24.3■■□□□ 1.48
ANKRD54-208ENST00000458278 TESK2Q96S53 571 aa24.28■■□□□ 1.48
ANKRD54-208ENST00000458278 CPDO75976 1380 aa24.28■■□□□ 1.48
ANKRD54-208ENST00000458278 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa24.27■■□□□ 1.48
ANKRD54-208ENST00000458278 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
ANKRD54-208ENST00000458278 PIK3C2AO00443 1686 aa24.27■■□□□ 1.48
ANKRD54-208ENST00000458278 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
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ANKRD54-208ENST00000458278 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
ANKRD54-208ENST00000458278 GCP02774 474 aa24.25■■□□□ 1.47
ANKRD54-208ENST00000458278 NLRP6P59044 892 aa24.25■■□□□ 1.47
ANKRD54-208ENST00000458278 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
ANKRD54-208ENST00000458278 SLIT3O75094 1523 aa24.25■■□□□ 1.47
ANKRD54-208ENST00000458278 EP400Q96L91 3159 aa24.24■■□□□ 1.47
ANKRD54-208ENST00000458278 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa24.24■■□□□ 1.47
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ANKRD54-208ENST00000458278 CHRNA2Q15822 529 aa24.23■■□□□ 1.47
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ANKRD54-208ENST00000458278 NINLQ9Y2I6 1382 aa24.22■■□□□ 1.47
ANKRD54-208ENST00000458278 CD163L1Q9NR16 1453 aa24.21■■□□□ 1.47
ANKRD54-208ENST00000458278 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa24.21■■□□□ 1.47
ANKRD54-208ENST00000458278 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa24.21■■□□□ 1.47
ANKRD54-208ENST00000458278 LMO7Q8WWI1 1683 aa24.21■■□□□ 1.47
ANKRD54-208ENST00000458278 BRWD3Q6RI45 1802 aa24.2■■□□□ 1.46
ANKRD54-208ENST00000458278 SEPT12Q8IYM1 358 aa24.2■■□□□ 1.46
ANKRD54-208ENST00000458278 TMC1Q8TDI8 760 aa24.2■■□□□ 1.46
ANKRD54-208ENST00000458278 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
ANKRD54-208ENST00000458278 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa24.18■■□□□ 1.46
ANKRD54-208ENST00000458278 TERF2IPQ9NYB0 399 aa24.18■■□□□ 1.46
ANKRD54-208ENST00000458278 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa24.18■■□□□ 1.46
ANKRD54-208ENST00000458278 KCNH5Q8NCM2 988 aa24.16■■□□□ 1.46
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ANKRD54-208ENST00000458278 USP54Q70EL1 1684 aa24.15■■□□□ 1.46
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ANKRD54-208ENST00000458278 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa24.14■■□□□ 1.46
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ANKRD54-208ENST00000458278 STRN4Q9NRL3 753 aa24.14■■□□□ 1.45
ANKRD54-208ENST00000458278 A0A1W2PP64 1363 aa24.14■■□□□ 1.45
ANKRD54-208ENST00000458278 USP31Q70CQ4 1352 aa24.14■■□□□ 1.45
ANKRD54-208ENST00000458278 CCDC125Q86Z20 511 aa24.13■■□□□ 1.45
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ANKRD54-208ENST00000458278 ARHGEF25Q86VW2 580 aa24.1■■□□□ 1.45
ANKRD54-208ENST00000458278 COL18A1P39060 1754 aa24.1■■□□□ 1.45
ANKRD54-208ENST00000458278 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
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ANKRD54-208ENST00000458278 BARGINQ6ZT62 677 aa24.07■■□□□ 1.44
ANKRD54-208ENST00000458278 NME9Q86XW9 330 aa24.07■■□□□ 1.44
ANKRD54-208ENST00000458278 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa24.06■■□□□ 1.44
ANKRD54-208ENST00000458278 ZBTB7CA1YPR0 619 aa24.06■■□□□ 1.44
ANKRD54-208ENST00000458278 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
ANKRD54-208ENST00000458278 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
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