RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454225.1

CITED1-210, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, humanhuman

TSL 5

Gene CITED1, Length 716 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1-210ENST00000454225 BCL9LQ86UU0 1499 aa36.81■■■■□ 3.48
CITED1-210ENST00000454225 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa36.8■■■■□ 3.48
CITED1-210ENST00000454225 ATRNO75882 1429 aa36.79■■■■□ 3.48
CITED1-210ENST00000454225 EVC2Q86UK5 1308 aa36.79■■■■□ 3.48
CITED1-210ENST00000454225 RGS12O14924 1447 aa36.76■■■■□ 3.48
CITED1-210ENST00000454225 SLIT2O94813 1529 aa36.76■■■■□ 3.48
CITED1-210ENST00000454225 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP36.72■■■■□ 3.47
CITED1-210ENST00000454225 UNC5CLQ8IV45 518 aa36.71■■■■□ 3.47
CITED1-210ENST00000454225 CABP1Q9NZU7 370 aa36.7■■■■□ 3.47
CITED1-210ENST00000454225 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa36.69■■■■□ 3.46
CITED1-210ENST00000454225 PLCH1Q4KWH8 1693 aa36.69■■■■□ 3.46
CITED1-210ENST00000454225 NUTM2GQ5VZR2 741 aa36.67■■■■□ 3.46
CITED1-210ENST00000454225 FAM83GA6ND36 823 aa36.66■■■■□ 3.46
CITED1-210ENST00000454225 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP36.65■■■■□ 3.46
CITED1-210ENST00000454225 NWD2Q9ULI1 1742 aa36.65■■■■□ 3.46
CITED1-210ENST00000454225 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa36.65■■■■□ 3.46
CITED1-210ENST00000454225 ABTB2Q8N961 1025 aa36.62■■■■□ 3.45
CITED1-210ENST00000454225 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP36.6■■■■□ 3.45
CITED1-210ENST00000454225 USP6P35125 1406 aa36.59■■■■□ 3.45
CITED1-210ENST00000454225 ATAD2Q6PL18 1390 aa36.59■■■■□ 3.45
CITED1-210ENST00000454225 CLSPNQ9HAW4 1339 aa36.59■■■■□ 3.45
CITED1-210ENST00000454225 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP36.58■■■■□ 3.45
CITED1-210ENST00000454225 GLI3P10071 1580 aa36.57■■■■□ 3.45
CITED1-210ENST00000454225 PRDM11Q9NQV5 511 aa36.57■■■■□ 3.44
CITED1-210ENST00000454225 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP36.56■■■■□ 3.44
CITED1-210ENST00000454225 VPS72Q15906 364 aa36.56■■■■□ 3.44
CITED1-210ENST00000454225 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP36.56■■■■□ 3.44
CITED1-210ENST00000454225 BTG4Q9NY30 223 aa36.56■■■■□ 3.44
CITED1-210ENST00000454225 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP36.55■■■■□ 3.44
CITED1-210ENST00000454225 NRAPQ86VF7 1730 aa36.54■■■■□ 3.44
CITED1-210ENST00000454225 KIAA0232Q92628 1395 aa36.53■■■■□ 3.44
CITED1-210ENST00000454225 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP36.51■■■■□ 3.44
CITED1-210ENST00000454225 USP19O94966 1318 aa36.51■■■■□ 3.43
CITED1-210ENST00000454225 NRKQ7Z2Y5 1582 aa36.5■■■■□ 3.43
CITED1-210ENST00000454225 NLRP13Q86W25 1043 aa36.5■■■■□ 3.43
CITED1-210ENST00000454225 AKAP12Q02952 1782 aa36.49■■■■□ 3.43
CITED1-210ENST00000454225 CHRNA2Q15822 529 aa36.49■■■■□ 3.43
CITED1-210ENST00000454225 SSH2Q76I76 1423 aa36.49■■■■□ 3.43
CITED1-210ENST00000454225 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa36.48■■■■□ 3.43
CITED1-210ENST00000454225 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP36.47■■■■□ 3.43
CITED1-210ENST00000454225 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa36.47■■■■□ 3.43
CITED1-210ENST00000454225 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP36.45■■■■□ 3.43
CITED1-210ENST00000454225 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP36.44■■■■□ 3.42
CITED1-210ENST00000454225 NLRP6P59044 892 aa36.44■■■■□ 3.42
CITED1-210ENST00000454225 TESK2Q96S53 571 aa36.44■■■■□ 3.42
CITED1-210ENST00000454225 PIK3C2AO00443 1686 aa36.43■■■■□ 3.42
CITED1-210ENST00000454225 TMC1Q8TDI8 760 aa36.43■■■■□ 3.42
CITED1-210ENST00000454225 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa36.42■■■■□ 3.42
CITED1-210ENST00000454225 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP36.41■■■■□ 3.42
CITED1-210ENST00000454225 USP47Q96K76 1375 aa36.41■■■■□ 3.42
CITED1-210ENST00000454225 GCP02774 474 aa36.41■■■■□ 3.42
CITED1-210ENST00000454225 SEPT12Q8IYM1 358 aa36.39■■■■□ 3.42
CITED1-210ENST00000454225 CPDO75976 1380 aa36.39■■■■□ 3.42
CITED1-210ENST00000454225 MON2Q7Z3U7 1717 aa36.38■■■■□ 3.41
CITED1-210ENST00000454225 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa36.37■■■■□ 3.41
CITED1-210ENST00000454225 STRN4Q9NRL3 753 aa36.37■■■■□ 3.41
CITED1-210ENST00000454225 TTC21AQ8NDW8 1320 aa36.36■■■■□ 3.41
CITED1-210ENST00000454225 SLIT3O75094 1523 aa36.36■■■■□ 3.41
CITED1-210ENST00000454225 CD163L1Q9NR16 1453 aa36.36■■■■□ 3.41
CITED1-210ENST00000454225 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa36.35■■■■□ 3.41
CITED1-210ENST00000454225 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa36.35■■■■□ 3.41
CITED1-210ENST00000454225 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP36.35■■■■□ 3.41
CITED1-210ENST00000454225 BRWD3Q6RI45 1802 aa36.35■■■■□ 3.41
CITED1-210ENST00000454225 A0A0G2JS52 829 aa36.34■■■■□ 3.41
CITED1-210ENST00000454225 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP36.34■■■■□ 3.41
CITED1-210ENST00000454225 MYT1Q01538 1121 aa36.34■■■■□ 3.41
CITED1-210ENST00000454225 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP36.34■■■■□ 3.41
CITED1-210ENST00000454225 ZBTB7CA1YPR0 619 aa36.32■■■■□ 3.4
CITED1-210ENST00000454225 SLC24A1O60721 1099 aa36.32■■■■□ 3.4
CITED1-210ENST00000454225 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP36.32■■■■□ 3.4
CITED1-210ENST00000454225 EP400Q96L91 3159 aa36.31■■■■□ 3.4
CITED1-210ENST00000454225 LMO7Q8WWI1 1683 aa36.31■■■■□ 3.4
CITED1-210ENST00000454225 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa36.31■■■■□ 3.4
CITED1-210ENST00000454225 EVA1CP58658 441 aa36.3■■■■□ 3.4
CITED1-210ENST00000454225 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP36.3■■■■□ 3.4
CITED1-210ENST00000454225 TERF2IPQ9NYB0 399 aa36.28■■■■□ 3.4
CITED1-210ENST00000454225 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa36.27■■■■□ 3.4
CITED1-210ENST00000454225 A0A1W2PP64 1363 aa36.27■■■■□ 3.4
CITED1-210ENST00000454225 SOX12O15370 315 aa36.25■■■■□ 3.39
CITED1-210ENST00000454225 TMF1P82094 1093 aa36.25■■■■□ 3.39
CITED1-210ENST00000454225 KRT27Q7Z3Y8 459 aa36.24■■■■□ 3.39
CITED1-210ENST00000454225 NINLQ9Y2I6 1382 aa36.24■■■■□ 3.39
CITED1-210ENST00000454225 KCNH5Q8NCM2 988 aa36.23■■■■□ 3.39
CITED1-210ENST00000454225 ZRANB1Q9UGI0 708 aa36.23■■■■□ 3.39
CITED1-210ENST00000454225 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP36.23■■■■□ 3.39
CITED1-210ENST00000454225 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP36.22■■■■□ 3.39
CITED1-210ENST00000454225 NME9Q86XW9 330 aa36.22■■■■□ 3.39
CITED1-210ENST00000454225 USP35Q9P2H5 1018 aa36.22■■■■□ 3.39
CITED1-210ENST00000454225 AATKQ6ZMQ8 1374 aa36.21■■■■□ 3.39
CITED1-210ENST00000454225 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP36.2■■■■□ 3.39
CITED1-210ENST00000454225 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa36.19■■■■□ 3.38
CITED1-210ENST00000454225 USP31Q70CQ4 1352 aa36.19■■■■□ 3.38
CITED1-210ENST00000454225 NFAT5O94916 1531 aa36.17■■■■□ 3.38
CITED1-210ENST00000454225 ARHGEF25Q86VW2 580 aa36.16■■■■□ 3.38
CITED1-210ENST00000454225 COL18A1P39060 1754 aa36.16■■■■□ 3.38
CITED1-210ENST00000454225 USP54Q70EL1 1684 aa36.15■■■■□ 3.38
CITED1-210ENST00000454225 CCDC125Q86Z20 511 aa36.13■■■■□ 3.37
CITED1-210ENST00000454225 CDCA8Q53HL2 280 aa36.12■■■■□ 3.37
CITED1-210ENST00000454225 TCP11L2Q8N4U5 519 aa36.11■■■■□ 3.37
CITED1-210ENST00000454225 AXIN2Q9Y2T1 843 aa36.11■■■■□ 3.37
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