RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439619.6

CCDC78-204, Transcript of coiled-coil domain containing 78, humanhuman

TSL 2

Gene CCDC78, Length 1,064 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78-204ENST00000439619 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
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CCDC78-204ENST00000439619 PRDM11Q9NQV5 511 aa26.87■■□□□ 1.89
CCDC78-204ENST00000439619 BTG4Q9NY30 223 aa26.87■■□□□ 1.89
CCDC78-204ENST00000439619 ABCA3Q99758 1704 aa26.87■■□□□ 1.89
CCDC78-204ENST00000439619 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
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CCDC78-204ENST00000439619 NWD2Q9ULI1 1742 aa26.85■■□□□ 1.89
CCDC78-204ENST00000439619 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa26.85■■□□□ 1.89
CCDC78-204ENST00000439619 EVC2Q86UK5 1308 aa26.85■■□□□ 1.89
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CCDC78-204ENST00000439619 ABTB2Q8N961 1025 aa26.83■■□□□ 1.89
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CCDC78-204ENST00000439619 A0A0G2JS52 829 aa26.82■■□□□ 1.88
CCDC78-204ENST00000439619 MYT1Q01538 1121 aa26.82■■□□□ 1.88
CCDC78-204ENST00000439619 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa26.82■■□□□ 1.88
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CCDC78-204ENST00000439619 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
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CCDC78-204ENST00000439619 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
CCDC78-204ENST00000439619 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
CCDC78-204ENST00000439619 QRICH2Q9H0J4 1663 aa26.79■■□□□ 1.88
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CCDC78-204ENST00000439619 KIAA0232Q92628 1395 aa26.77■■□□□ 1.88
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CCDC78-204ENST00000439619 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
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CCDC78-204ENST00000439619 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa26.72■■□□□ 1.87
CCDC78-204ENST00000439619 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa26.72■■□□□ 1.87
CCDC78-204ENST00000439619 EVA1CP58658 441 aa26.72■■□□□ 1.87
CCDC78-204ENST00000439619 CHRNA2Q15822 529 aa26.72■■□□□ 1.87
CCDC78-204ENST00000439619 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
CCDC78-204ENST00000439619 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
CCDC78-204ENST00000439619 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa26.7■■□□□ 1.87
CCDC78-204ENST00000439619 STRN4Q9NRL3 753 aa26.7■■□□□ 1.86
CCDC78-204ENST00000439619 USP6P35125 1406 aa26.7■■□□□ 1.86
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CCDC78-204ENST00000439619 GCP02774 474 aa26.68■■□□□ 1.86
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CCDC78-204ENST00000439619 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
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CCDC78-204ENST00000439619 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa26.65■■□□□ 1.86
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CCDC78-204ENST00000439619 SLC24A1O60721 1099 aa26.58■■□□□ 1.85
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CCDC78-204ENST00000439619 TCP11L2Q8N4U5 519 aa26.56■■□□□ 1.84
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CCDC78-204ENST00000439619 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
CCDC78-204ENST00000439619 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa26.54■■□□□ 1.84
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CCDC78-204ENST00000439619 AATKQ6ZMQ8 1374 aa26.54■■□□□ 1.84
CCDC78-204ENST00000439619 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
CCDC78-204ENST00000439619 PDE3BQ13370 1112 aa26.53■■□□□ 1.84
CCDC78-204ENST00000439619 DEFB132Q7Z7B7 95 aa26.53■■□□□ 1.84
CCDC78-204ENST00000439619 SLIT3O75094 1523 aa26.52■■□□□ 1.84
CCDC78-204ENST00000439619 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
CCDC78-204ENST00000439619 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa26.51■■□□□ 1.83
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CCDC78-204ENST00000439619 TERF2IPQ9NYB0 399 aa26.51■■□□□ 1.83
CCDC78-204ENST00000439619 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
CCDC78-204ENST00000439619 FAM182BQ5T319 152 aa26.49■■□□□ 1.83
CCDC78-204ENST00000439619 LMO7Q8WWI1 1683 aa26.49■■□□□ 1.83
CCDC78-204ENST00000439619 CRB1P82279 1406 aa26.48■■□□□ 1.83
CCDC78-204ENST00000439619 PIK3C2AO00443 1686 aa26.47■■□□□ 1.83
CCDC78-204ENST00000439619 SOX12O15370 315 aa26.47■■□□□ 1.83
CCDC78-204ENST00000439619 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa26.47■■□□□ 1.83
CCDC78-204ENST00000439619 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP26.47■■□□□ 1.83
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CCDC78-204ENST00000439619 ARHGEF25Q86VW2 580 aa26.45■■□□□ 1.82
CCDC78-204ENST00000439619 AKAP12Q02952 1782 aa26.45■■□□□ 1.82
CCDC78-204ENST00000439619 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
CCDC78-204ENST00000439619 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa26.44■■□□□ 1.82
CCDC78-204ENST00000439619 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa26.43■■□□□ 1.82
CCDC78-204ENST00000439619 NINLQ9Y2I6 1382 aa26.43■■□□□ 1.82
CCDC78-204ENST00000439619 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa26.42■■□□□ 1.82
CCDC78-204ENST00000439619 WDR17Q8IZU2 1322 aa26.41■■□□□ 1.82
CCDC78-204ENST00000439619 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
CCDC78-204ENST00000439619 TRIM37O94972 964 aa26.4■■□□□ 1.82
CCDC78-204ENST00000439619 TESK2Q96S53 571 aa26.4■■□□□ 1.82
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