RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439365.6

NPAS1-201, Transcript of neuronal PAS domain protein 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene NPAS1, Length 1,341 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS1-201ENST00000439365 CABP2Q9NPB3 220 aa28.04■■■□□ 2.08
NPAS1-201ENST00000439365 PLCH1Q4KWH8 1693 aa28.03■■■□□ 2.08
NPAS1-201ENST00000439365 NBPF8Q3BBV2 869 aa28.03■■■□□ 2.08
NPAS1-201ENST00000439365 NUTM2GQ5VZR2 741 aa28.03■■■□□ 2.08
NPAS1-201ENST00000439365 BTG4Q9NY30 223 aa28.03■■■□□ 2.08
NPAS1-201ENST00000439365 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
NPAS1-201ENST00000439365 GLI3P10071 1580 aa28.01■■■□□ 2.07
NPAS1-201ENST00000439365 PLEKHG3A1L390 1219 aa28■■■□□ 2.07
NPAS1-201ENST00000439365 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
NPAS1-201ENST00000439365 A0A0G2JS52 829 aa27.99■■■□□ 2.07
NPAS1-201ENST00000439365 MYT1Q01538 1121 aa27.99■■■□□ 2.07
NPAS1-201ENST00000439365 PRDM11Q9NQV5 511 aa27.99■■■□□ 2.07
NPAS1-201ENST00000439365 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa27.99■■■□□ 2.07
NPAS1-201ENST00000439365 NWD2Q9ULI1 1742 aa27.99■■■□□ 2.07
NPAS1-201ENST00000439365 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa27.98■■■□□ 2.07
NPAS1-201ENST00000439365 QRICH2Q9H0J4 1663 aa27.98■■■□□ 2.07
NPAS1-201ENST00000439365 SEPT12Q8IYM1 358 aa27.97■■■□□ 2.07
NPAS1-201ENST00000439365 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa27.97■■■□□ 2.07
NPAS1-201ENST00000439365 ABTB2Q8N961 1025 aa27.96■■■□□ 2.07
NPAS1-201ENST00000439365 EVC2Q86UK5 1308 aa27.95■■■□□ 2.06
NPAS1-201ENST00000439365 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP27.94■■■□□ 2.06
NPAS1-201ENST00000439365 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
NPAS1-201ENST00000439365 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
NPAS1-201ENST00000439365 CABP1Q9NZU7 370 aa27.92■■■□□ 2.06
NPAS1-201ENST00000439365 KIAA0232Q92628 1395 aa27.92■■■□□ 2.06
NPAS1-201ENST00000439365 CHRNA2Q15822 529 aa27.92■■■□□ 2.06
NPAS1-201ENST00000439365 EP400Q96L91 3159 aa27.91■■■□□ 2.06
NPAS1-201ENST00000439365 TONSLQ96HA7 1378 aa27.91■■■□□ 2.06
NPAS1-201ENST00000439365 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
NPAS1-201ENST00000439365 CCDC125Q86Z20 511 aa27.9■■■□□ 2.06
NPAS1-201ENST00000439365 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa27.89■■■□□ 2.06
NPAS1-201ENST00000439365 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP27.88■■■□□ 2.05
NPAS1-201ENST00000439365 KRT27Q7Z3Y8 459 aa27.88■■■□□ 2.05
NPAS1-201ENST00000439365 NRAPQ86VF7 1730 aa27.87■■■□□ 2.05
NPAS1-201ENST00000439365 NLRP13Q86W25 1043 aa27.87■■■□□ 2.05
NPAS1-201ENST00000439365 CARD11Q9BXL7 1154 aa27.87■■■□□ 2.05
NPAS1-201ENST00000439365 STRN4Q9NRL3 753 aa27.87■■■□□ 2.05
NPAS1-201ENST00000439365 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
NPAS1-201ENST00000439365 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa27.83■■■□□ 2.05
NPAS1-201ENST00000439365 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa27.83■■■□□ 2.05
NPAS1-201ENST00000439365 BRWD3Q6RI45 1802 aa27.83■■■□□ 2.05
NPAS1-201ENST00000439365 EVA1CP58658 441 aa27.83■■■□□ 2.05
NPAS1-201ENST00000439365 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
NPAS1-201ENST00000439365 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP27.81■■■□□ 2.04
NPAS1-201ENST00000439365 ZBTB7CA1YPR0 619 aa27.81■■■□□ 2.04
NPAS1-201ENST00000439365 USP6P35125 1406 aa27.81■■■□□ 2.04
NPAS1-201ENST00000439365 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP27.8■■■□□ 2.04
NPAS1-201ENST00000439365 GCP02774 474 aa27.8■■■□□ 2.04
NPAS1-201ENST00000439365 NLRP6P59044 892 aa27.8■■■□□ 2.04
NPAS1-201ENST00000439365 USP19O94966 1318 aa27.8■■■□□ 2.04
NPAS1-201ENST00000439365 USP35Q9P2H5 1018 aa27.79■■■□□ 2.04
NPAS1-201ENST00000439365 NRKQ7Z2Y5 1582 aa27.78■■■□□ 2.04
NPAS1-201ENST00000439365 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP27.76■■■□□ 2.03
NPAS1-201ENST00000439365 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa27.76■■■□□ 2.03
NPAS1-201ENST00000439365 ZRANB1Q9UGI0 708 aa27.75■■■□□ 2.03
NPAS1-201ENST00000439365 CPDO75976 1380 aa27.74■■■□□ 2.03
NPAS1-201ENST00000439365 FAM182BQ5T319 152 aa27.72■■■□□ 2.03
NPAS1-201ENST00000439365 DEFB132Q7Z7B7 95 aa27.72■■■□□ 2.03
NPAS1-201ENST00000439365 SSH2Q76I76 1423 aa27.71■■■□□ 2.03
NPAS1-201ENST00000439365 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP27.71■■■□□ 2.03
NPAS1-201ENST00000439365 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa27.7■■■□□ 2.03
NPAS1-201ENST00000439365 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa27.69■■■□□ 2.02
NPAS1-201ENST00000439365 TMC1Q8TDI8 760 aa27.69■■■□□ 2.02
NPAS1-201ENST00000439365 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP27.69■■■□□ 2.02
NPAS1-201ENST00000439365 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa27.69■■■□□ 2.02
NPAS1-201ENST00000439365 SOX12O15370 315 aa27.68■■■□□ 2.02
NPAS1-201ENST00000439365 TCP11L2Q8N4U5 519 aa27.66■■■□□ 2.02
NPAS1-201ENST00000439365 PIK3C2AO00443 1686 aa27.65■■■□□ 2.02
NPAS1-201ENST00000439365 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa27.65■■■□□ 2.02
NPAS1-201ENST00000439365 TTC21AQ8NDW8 1320 aa27.65■■■□□ 2.02
NPAS1-201ENST00000439365 BAG6P46379 1132 aa27.65■■■□□ 2.02
NPAS1-201ENST00000439365 BARGINQ6ZT62 677 aa27.64■■■□□ 2.01
NPAS1-201ENST00000439365 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP27.64■■■□□ 2.01
NPAS1-201ENST00000439365 LMO7Q8WWI1 1683 aa27.64■■■□□ 2.01
NPAS1-201ENST00000439365 SLIT3O75094 1523 aa27.64■■■□□ 2.01
NPAS1-201ENST00000439365 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP27.63■■■□□ 2.01
NPAS1-201ENST00000439365 PDE3BQ13370 1112 aa27.63■■■□□ 2.01
NPAS1-201ENST00000439365 KCNH5Q8NCM2 988 aa27.63■■■□□ 2.01
NPAS1-201ENST00000439365 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP27.62■■■□□ 2.01
NPAS1-201ENST00000439365 AKAP12Q02952 1782 aa27.61■■■□□ 2.01
NPAS1-201ENST00000439365 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP27.61■■■□□ 2.01
NPAS1-201ENST00000439365 AATKQ6ZMQ8 1374 aa27.61■■■□□ 2.01
NPAS1-201ENST00000439365 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
NPAS1-201ENST00000439365 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa27.59■■■□□ 2.01
NPAS1-201ENST00000439365 FAM196AQ6ZSG2 479 aa27.59■■■□□ 2.01
NPAS1-201ENST00000439365 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa27.59■■■□□ 2.01
NPAS1-201ENST00000439365 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa27.59■■■□□ 2.01
NPAS1-201ENST00000439365 CRB1P82279 1406 aa27.57■■■□□ 2
NPAS1-201ENST00000439365 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP27.56■■■□□ 2
NPAS1-201ENST00000439365 PCGF6Q9BYE7 350 aa27.56■■■□□ 2
NPAS1-201ENST00000439365 TERF2IPQ9NYB0 399 aa27.56■■■□□ 2
NPAS1-201ENST00000439365 TRIM37O94972 964 aa27.55■■■□□ 2
NPAS1-201ENST00000439365 ARHGEF25Q86VW2 580 aa27.55■■■□□ 2
NPAS1-201ENST00000439365 AXIN2Q9Y2T1 843 aa27.55■■■□□ 2
NPAS1-201ENST00000439365 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa27.54■■■□□ 2
NPAS1-201ENST00000439365 NME9Q86XW9 330 aa27.54■■■□□ 2
NPAS1-201ENST00000439365 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa27.54■■■□□ 2
NPAS1-201ENST00000439365 RGPD1P0DJD0 1748 aa27.52■■■□□ 2
NPAS1-201ENST00000439365 CD163L1Q9NR16 1453 aa27.52■■■□□ 2
NPAS1-201ENST00000439365 MON2Q7Z3U7 1717 aa27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.5 ms