RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439248.5

TTLL1-203, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTLL1, Length 1,659 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL1-203ENST00000439248 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
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TTLL1-203ENST00000439248 CCDC146Q8IYE0 955 aa18.37■□□□□ 0.53
TTLL1-203ENST00000439248 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
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TTLL1-203ENST00000439248 MORC1Q86VD1 984 aa18.36■□□□□ 0.53
TTLL1-203ENST00000439248 CFAP53Q96M91 514 aa18.36■□□□□ 0.53
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TTLL1-203ENST00000439248 KNDC1Q76NI1 1749 aa18.35■□□□□ 0.53
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TTLL1-203ENST00000439248 DLC1Q96QB1 1528 aa18.29■□□□□ 0.52
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TTLL1-203ENST00000439248 IL16Q14005 1332 aa18.24■□□□□ 0.51
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TTLL1-203ENST00000439248 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
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TTLL1-203ENST00000439248 USP19O94966 1318 aa18.22■□□□□ 0.51
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TTLL1-203ENST00000439248 NWD1Q149M9 1564 aa18.18■□□□□ 0.5
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TTLL1-203ENST00000439248 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa18.15■□□□□ 0.5
TTLL1-203ENST00000439248 UBAP1LF5GYI3 381 aa18.15■□□□□ 0.5
TTLL1-203ENST00000439248 NALCNQ8IZF0 1738 aa18.14■□□□□ 0.5
TTLL1-203ENST00000439248 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
TTLL1-203ENST00000439248 ZNF428Q96B54 188 aa18.14■□□□□ 0.49
TTLL1-203ENST00000439248 CABP2Q9NPB3 220 aa18.14■□□□□ 0.49
TTLL1-203ENST00000439248 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
TTLL1-203ENST00000439248 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
TTLL1-203ENST00000439248 TERF2IPQ9NYB0 399 aa18.13■□□□□ 0.49
TTLL1-203ENST00000439248 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa18.13■□□□□ 0.49
TTLL1-203ENST00000439248 PNPLA6Q8IY17 1366 aa18.13■□□□□ 0.49
TTLL1-203ENST00000439248 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
TTLL1-203ENST00000439248 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
TTLL1-203ENST00000439248 TBC1D32Q96NH3 1257 aa18.12■□□□□ 0.49
TTLL1-203ENST00000439248 PLEKHF1Q96S99 279 aa18.12■□□□□ 0.49
TTLL1-203ENST00000439248 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
TTLL1-203ENST00000439248 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP18.12■□□□□ 0.49
TTLL1-203ENST00000439248 CDK19Q9BWU1 502 aa18.12■□□□□ 0.49
TTLL1-203ENST00000439248 DDX19BQ9UMR2 479 aa18.12■□□□□ 0.49
TTLL1-203ENST00000439248 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa18.12■□□□□ 0.49
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TTLL1-203ENST00000439248 A0A1W2PP64 1363 aa18.1■□□□□ 0.49
TTLL1-203ENST00000439248 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
TTLL1-203ENST00000439248 TOM1O60784 492 aa18.09■□□□□ 0.49
TTLL1-203ENST00000439248 TMPOP42166 694 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
TTLL1-203ENST00000439248 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
TTLL1-203ENST00000439248 LRRC7Q96NW7 1537 aa18.09■□□□□ 0.49
TTLL1-203ENST00000439248 WASLO00401 505 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
TTLL1-203ENST00000439248 NEUROD2Q15784 382 aa18.09■□□□□ 0.49
TTLL1-203ENST00000439248 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
TTLL1-203ENST00000439248 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa18.08■□□□□ 0.49
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