RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438888.5

PRAME-208, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 4

Gene PRAME, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-208ENST00000438888 NWD2Q9ULI1 1742 aa17.97■□□□□ 0.47
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PRAME-208ENST00000438888 CLSPNQ9HAW4 1339 aa17.96■□□□□ 0.46
PRAME-208ENST00000438888 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
PRAME-208ENST00000438888 KRT27Q7Z3Y8 459 aa17.95■□□□□ 0.46
PRAME-208ENST00000438888 ALS2Q96Q42 1657 aa17.93■□□□□ 0.46
PRAME-208ENST00000438888 NRAPQ86VF7 1730 aa17.92■□□□□ 0.46
PRAME-208ENST00000438888 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
PRAME-208ENST00000438888 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
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PRAME-208ENST00000438888 FAM182BQ5T319 152 aa17.89■□□□□ 0.45
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PRAME-208ENST00000438888 CHRNA2Q15822 529 aa17.88■□□□□ 0.45
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PRAME-208ENST00000438888 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa17.86■□□□□ 0.45
PRAME-208ENST00000438888 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa17.86■□□□□ 0.45
PRAME-208ENST00000438888 ACEP12821 1306 aa17.85■□□□□ 0.45
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PRAME-208ENST00000438888 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa17.8■□□□□ 0.44
PRAME-208ENST00000438888 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP17.8■□□□□ 0.44
PRAME-208ENST00000438888 ABTB2Q8N961 1025 aa17.8■□□□□ 0.44
PRAME-208ENST00000438888 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa17.8■□□□□ 0.44
PRAME-208ENST00000438888 NEUROD1Q13562 356 aa17.79■□□□□ 0.44
PRAME-208ENST00000438888 CABP2Q9NPB3 220 aa17.79■□□□□ 0.44
PRAME-208ENST00000438888 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa17.78■□□□□ 0.44
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PRAME-208ENST00000438888 EVA1CP58658 441 aa17.78■□□□□ 0.44
PRAME-208ENST00000438888 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa17.78■□□□□ 0.44
PRAME-208ENST00000438888 ZBTB7CA1YPR0 619 aa17.77■□□□□ 0.44
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PRAME-208ENST00000438888 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa17.73■□□□□ 0.43
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PRAME-208ENST00000438888 NLRP13Q86W25 1043 aa17.72■□□□□ 0.43
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PRAME-208ENST00000438888 CPDO75976 1380 aa17.71■□□□□ 0.43
PRAME-208ENST00000438888 GCP02774 474 aa17.71■□□□□ 0.43
PRAME-208ENST00000438888 PDE3BQ13370 1112 aa17.71■□□□□ 0.43
PRAME-208ENST00000438888 FAM196AQ6ZSG2 479 aa17.71■□□□□ 0.43
PRAME-208ENST00000438888 L3MBTL2Q969R5 705 aa17.71■□□□□ 0.43
PRAME-208ENST00000438888 CABP1Q9NZU7 370 aa17.71■□□□□ 0.43
PRAME-208ENST00000438888 LRP5O75197 1615 aa17.7■□□□□ 0.42
PRAME-208ENST00000438888 APBA3O96018 575 aa17.7■□□□□ 0.42
PRAME-208ENST00000438888 TCP11L2Q8N4U5 519 aa17.7■□□□□ 0.42
PRAME-208ENST00000438888 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa17.7■□□□□ 0.42
PRAME-208ENST00000438888 DISP2A7MBM2 1401 aa17.7■□□□□ 0.42
PRAME-208ENST00000438888 LMO7Q8WWI1 1683 aa17.69■□□□□ 0.42
PRAME-208ENST00000438888 BARGINQ6ZT62 677 aa17.69■□□□□ 0.42
PRAME-208ENST00000438888 USP6P35125 1406 aa17.68■□□□□ 0.42
PRAME-208ENST00000438888 NLRP6P59044 892 aa17.68■□□□□ 0.42
PRAME-208ENST00000438888 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP17.67■□□□□ 0.42
PRAME-208ENST00000438888 CAMKK2Q96RR4 588 aa17.66■□□□□ 0.42
PRAME-208ENST00000438888 EVC2Q86UK5 1308 aa17.66■□□□□ 0.42
PRAME-208ENST00000438888 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP17.66■□□□□ 0.42
PRAME-208ENST00000438888 SOX12O15370 315 aa17.64■□□□□ 0.41
PRAME-208ENST00000438888 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP17.64■□□□□ 0.41
PRAME-208ENST00000438888 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa17.63■□□□□ 0.41
PRAME-208ENST00000438888 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP17.63■□□□□ 0.41
PRAME-208ENST00000438888 CRB1P82279 1406 aa17.63■□□□□ 0.41
PRAME-208ENST00000438888 SLIT3O75094 1523 aa17.62■□□□□ 0.41
PRAME-208ENST00000438888 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa17.62■□□□□ 0.41
PRAME-208ENST00000438888 PIK3C2AO00443 1686 aa17.61■□□□□ 0.41
PRAME-208ENST00000438888 PARD3Q8TEW0 1356 aa17.61■□□□□ 0.41
PRAME-208ENST00000438888 AATKQ6ZMQ8 1374 aa17.6■□□□□ 0.41
PRAME-208ENST00000438888 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa17.59■□□□□ 0.41
PRAME-208ENST00000438888 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP17.58■□□□□ 0.41
PRAME-208ENST00000438888 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa17.58■□□□□ 0.41
PRAME-208ENST00000438888 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa17.58■□□□□ 0.41
PRAME-208ENST00000438888 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP17.58■□□□□ 0.41
PRAME-208ENST00000438888 OVOS2Q6IE36 1432 aa17.58■□□□□ 0.41
PRAME-208ENST00000438888 AXIN2Q9Y2T1 843 aa17.58■□□□□ 0.4
PRAME-208ENST00000438888 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa17.57■□□□□ 0.4
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