RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430356.3

PITRM1-AS1-201, PITRM1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PITRM1-AS1, Length 3,998 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 NCLP19338 710 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 ARID3AQ99856 593 aa10.63□□□□□ -0.71
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 PTPRTO14522 1441 aa10.63□□□□□ -0.71
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 MSNP26038 577 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 GBP4Q96PP9 640 aa10.62□□□□□ -0.71
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 PPLO60437 1756 aa10.62□□□□□ -0.71
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 MYOM2P54296 1465 aa10.62□□□□□ -0.71
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 ABCC3O15438 1527 aa10.62□□□□□ -0.71
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa10.61□□□□□ -0.71
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 EFCAB6Q5THR3 1501 aa10.61□□□□□ -0.71
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa10.61□□□□□ -0.71
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 GOLGA6L22H0YM25 854 aa10.61□□□□□ -0.71
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 PODXL2Q9NZ53 605 aa10.61□□□□□ -0.71
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa10.61□□□□□ -0.71
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 TERF1P54274 439 aa10.6□□□□□ -0.71
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 RBM10P98175 930 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa10.6□□□□□ -0.71
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 DMRT2Q9Y5R5 561 aa10.6□□□□□ -0.71
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 TPM2P07951 284 aa10.6□□□□□ -0.71
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 IDI1Q13907 227 aa10.6□□□□□ -0.71
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 TNNQ9UQP3 1299 aa10.59□□□□□ -0.71
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 CLEC17AQ6ZS10 378 aa10.58□□□□□ -0.71
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 FAM13BQ9NYF5 915 aa10.58□□□□□ -0.71
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa10.58□□□□□ -0.72
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 AAMPQ13685 434 aa10.58□□□□□ -0.72
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 MROH2AA6NES4 1674 aa10.58□□□□□ -0.72
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 LMTK2Q8IWU2 1503 aa10.58□□□□□ -0.72
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 WWC1Q8IX03 1113 aa10.58□□□□□ -0.72
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 ITPRIPQ8IWB1 547 aa10.57□□□□□ -0.72
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 CFAP70Q5T0N1 1121 aa10.57□□□□□ -0.72
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 PDCL3Q9H2J4 239 aa10.57□□□□□ -0.72
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 STAG3Q9UJ98 1225 aa10.57□□□□□ -0.72
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 RARSP54136 660 aaKnown RBP10.56□□□□□ -0.72
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 RLBP1P12271 317 aa10.56□□□□□ -0.72
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP10.56□□□□□ -0.72
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa10.56□□□□□ -0.72
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 NASPP49321 788 aaPredicted RBP10.56□□□□□ -0.72
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 MORC1Q86VD1 984 aa10.56□□□□□ -0.72
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP10.56□□□□□ -0.72
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa10.56□□□□□ -0.72
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PITRM1-AS1-201ENST00000430356 ERBB4Q15303 1308 aa10.55□□□□□ -0.72
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa10.55□□□□□ -0.72
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 NGEFQ8N5V2 710 aa10.55□□□□□ -0.72
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa10.54□□□□□ -0.72
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 SMC4Q9NTJ3 1288 aa10.54□□□□□ -0.72
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 ZBTB7CA1YPR0 619 aa10.54□□□□□ -0.72
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 TCP11L2Q8N4U5 519 aa10.54□□□□□ -0.72
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 NOS1P29475 1434 aa10.54□□□□□ -0.72
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 PTMSP20962 102 aa10.53□□□□□ -0.72
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 TMEM132EQ6IEE7 984 aa10.53□□□□□ -0.72
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 CCDC173Q0VFZ6 552 aa10.53□□□□□ -0.72
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 GAS2L3Q86XJ1 694 aa10.53□□□□□ -0.72
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa10.53□□□□□ -0.72
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.72
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 ZSCAN30Q86W11 494 aa10.52□□□□□ -0.73
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 RUNDC1Q96C34 613 aa10.52□□□□□ -0.73
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 CFAP53Q96M91 514 aa10.52□□□□□ -0.73
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 LNPKQ9C0E8 428 aa10.52□□□□□ -0.73
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 MVPQ14764 893 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.73
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 KIF1BO60333 1816 aa10.52□□□□□ -0.73
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 MED14O60244 1454 aa10.51□□□□□ -0.73
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 AGLP35573 1532 aa10.51□□□□□ -0.73
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP10.51□□□□□ -0.73
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 QRICH2Q9H0J4 1663 aa10.51□□□□□ -0.73
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 SLC52A1Q9NWF4 448 aa10.5□□□□□ -0.73
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 PRDM4Q9UKN5 801 aa10.5□□□□□ -0.73
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 PTMAP06454 111 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 TRAK1Q9UPV9 953 aa10.49□□□□□ -0.73
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 ERVK-7P63135 1459 aa10.49□□□□□ -0.73
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 ITSN1Q15811 1721 aa10.49□□□□□ -0.73
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 MCTP1Q6DN14 999 aa10.48□□□□□ -0.73
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 STK26Q9P289 416 aa10.48□□□□□ -0.73
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 DDX19BQ9UMR2 479 aa10.48□□□□□ -0.73
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 PPP6R1Q9UPN7 881 aa10.48□□□□□ -0.73
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 SSFA2P28290 1259 aa10.48□□□□□ -0.73
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP10.48□□□□□ -0.73
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 ADGRB3O60242 1522 aa10.48□□□□□ -0.73
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 PREX1Q8TCU6 1659 aa10.48□□□□□ -0.73
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 ANKRD45Q5TZF3 282 aa10.48□□□□□ -0.73
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 KNDC1Q76NI1 1749 aa10.47□□□□□ -0.73
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
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