RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423048.5

ALMS1-201, Transcript of ALMS1, centrosome and basal body associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ALMS1, Length 5,194 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALMS1-201ENST00000423048 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
ALMS1-201ENST00000423048 GORABQ5T7V8 394 aa8.61□□□□□ -1.03
ALMS1-201ENST00000423048 CRBNQ96SW2 442 aa8.61□□□□□ -1.03
ALMS1-201ENST00000423048 PLEKHG5O94827 1062 aa8.6□□□□□ -1.03
ALMS1-201ENST00000423048 FOXD1Q16676 465 aa8.6□□□□□ -1.03
ALMS1-201ENST00000423048 FAM43AQ8N2R8 423 aa8.6□□□□□ -1.03
ALMS1-201ENST00000423048 TEX35Q5T0J7 233 aa8.6□□□□□ -1.03
ALMS1-201ENST00000423048 TTC21AQ8NDW8 1320 aa8.6□□□□□ -1.03
ALMS1-201ENST00000423048 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
ALMS1-201ENST00000423048 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
ALMS1-201ENST00000423048 MAPKBP1O60336 1514 aa8.6□□□□□ -1.03
ALMS1-201ENST00000423048 RIPK4P57078 832 aa8.6□□□□□ -1.03
ALMS1-201ENST00000423048 TUBB4BP68371 445 aa8.6□□□□□ -1.03
ALMS1-201ENST00000423048 SIRT1Q96EB6 747 aa8.6□□□□□ -1.03
ALMS1-201ENST00000423048 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
ALMS1-201ENST00000423048 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP8.59□□□□□ -1.03
ALMS1-201ENST00000423048 TAF7LQ5H9L4 462 aa8.59□□□□□ -1.03
ALMS1-201ENST00000423048 C22orf23Q9BZE7 217 aa8.59□□□□□ -1.03
ALMS1-201ENST00000423048 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
ALMS1-201ENST00000423048 MAST1Q9Y2H9 1570 aa8.59□□□□□ -1.03
ALMS1-201ENST00000423048 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
ALMS1-201ENST00000423048 TTC5Q8N0Z6 440 aa8.59□□□□□ -1.03
ALMS1-201ENST00000423048 KDM5BQ9UGL1 1544 aa8.59□□□□□ -1.03
ALMS1-201ENST00000423048 NEO1Q92859 1461 aa8.59□□□□□ -1.03
ALMS1-201ENST00000423048 TICAM2Q86XR7 235 aa8.59□□□□□ -1.03
ALMS1-201ENST00000423048 BRMS1Q9HCU9 246 aa8.59□□□□□ -1.03
ALMS1-201ENST00000423048 RTL1A6NKG5 1358 aa8.59□□□□□ -1.03
ALMS1-201ENST00000423048 MYO6Q9UM54 1294 aa8.59□□□□□ -1.03
ALMS1-201ENST00000423048 TRDNQ13061 729 aa8.58□□□□□ -1.04
ALMS1-201ENST00000423048 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP8.58□□□□□ -1.04
ALMS1-201ENST00000423048 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
ALMS1-201ENST00000423048 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
ALMS1-201ENST00000423048 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
ALMS1-201ENST00000423048 CD109Q6YHK3 1445 aa8.58□□□□□ -1.04
ALMS1-201ENST00000423048 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa8.58□□□□□ -1.04
ALMS1-201ENST00000423048 ARHGEF11O15085 1522 aa8.58□□□□□ -1.04
ALMS1-201ENST00000423048 APAF1O14727 1248 aa8.58□□□□□ -1.04
ALMS1-201ENST00000423048 SLFN5Q08AF3 891 aa8.58□□□□□ -1.04
ALMS1-201ENST00000423048 MVPQ14764 893 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
ALMS1-201ENST00000423048 PRAG1Q86YV5 1406 aa8.58□□□□□ -1.04
ALMS1-201ENST00000423048 NEMFO60524 1076 aa8.58□□□□□ -1.04
ALMS1-201ENST00000423048 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
ALMS1-201ENST00000423048 AMOTQ4VCS5 1084 aa8.58□□□□□ -1.04
ALMS1-201ENST00000423048 TAF3Q5VWG9 929 aa8.58□□□□□ -1.04
ALMS1-201ENST00000423048 CCDC146Q8IYE0 955 aa8.58□□□□□ -1.04
ALMS1-201ENST00000423048 FAM13BQ9NYF5 915 aa8.58□□□□□ -1.04
ALMS1-201ENST00000423048 TRAK1Q9UPV9 953 aa8.58□□□□□ -1.04
ALMS1-201ENST00000423048 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
ALMS1-201ENST00000423048 PARD3Q8TEW0 1356 aa8.58□□□□□ -1.04
ALMS1-201ENST00000423048 H3BQV1 296 aa8.57□□□□□ -1.04
ALMS1-201ENST00000423048 IFFO2Q5TF58 517 aa8.57□□□□□ -1.04
ALMS1-201ENST00000423048 BACH2Q9BYV9 841 aa8.57□□□□□ -1.04
ALMS1-201ENST00000423048 CTNNA3Q9UI47 895 aa8.57□□□□□ -1.04
ALMS1-201ENST00000423048 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa8.57□□□□□ -1.04
ALMS1-201ENST00000423048 CDKL5O76039 1030 aa8.57□□□□□ -1.04
ALMS1-201ENST00000423048 FANCAO15360 1455 aa8.57□□□□□ -1.04
ALMS1-201ENST00000423048 GNAI2P04899 355 aa8.57□□□□□ -1.04
ALMS1-201ENST00000423048 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
ALMS1-201ENST00000423048 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
ALMS1-201ENST00000423048 WASF1Q92558 559 aa8.57□□□□□ -1.04
ALMS1-201ENST00000423048 SETQ01105 290 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
ALMS1-201ENST00000423048 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa8.56□□□□□ -1.04
ALMS1-201ENST00000423048 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
ALMS1-201ENST00000423048 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa8.56□□□□□ -1.04
ALMS1-201ENST00000423048 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
ALMS1-201ENST00000423048 EXOC6Q8TAG9 804 aa8.56□□□□□ -1.04
ALMS1-201ENST00000423048 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
ALMS1-201ENST00000423048 ANKRD45Q5TZF3 282 aa8.56□□□□□ -1.04
ALMS1-201ENST00000423048 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa8.56□□□□□ -1.04
ALMS1-201ENST00000423048 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
ALMS1-201ENST00000423048 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
ALMS1-201ENST00000423048 CBFA2T2O43439 604 aa8.56□□□□□ -1.04
ALMS1-201ENST00000423048 SART3Q15020 963 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
ALMS1-201ENST00000423048 NFE2L2Q16236 605 aa8.56□□□□□ -1.04
ALMS1-201ENST00000423048 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
ALMS1-201ENST00000423048 SMC3Q9UQE7 1217 aa8.56□□□□□ -1.04
ALMS1-201ENST00000423048 RDXP35241 583 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
ALMS1-201ENST00000423048 ADCY10Q96PN6 1610 aa8.55□□□□□ -1.04
ALMS1-201ENST00000423048 A2MP01023 1474 aa8.55□□□□□ -1.04
ALMS1-201ENST00000423048 BECN2A8MW95 431 aa8.55□□□□□ -1.04
ALMS1-201ENST00000423048 CTAGE5O15320 804 aa8.55□□□□□ -1.04
ALMS1-201ENST00000423048 UVSSAQ2YD98 709 aa8.55□□□□□ -1.04
ALMS1-201ENST00000423048 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa8.55□□□□□ -1.04
ALMS1-201ENST00000423048 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
ALMS1-201ENST00000423048 STK26Q9P289 416 aa8.55□□□□□ -1.04
ALMS1-201ENST00000423048 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
ALMS1-201ENST00000423048 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
ALMS1-201ENST00000423048 ERICH2A1L162 156 aa8.54□□□□□ -1.04
ALMS1-201ENST00000423048 MAGI2Q86UL8 1455 aa8.54□□□□□ -1.04
ALMS1-201ENST00000423048 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP8.54□□□□□ -1.04
ALMS1-201ENST00000423048 TRPM2O94759 1503 aa8.54□□□□□ -1.04
ALMS1-201ENST00000423048 ATP10BO94823 1461 aa8.54□□□□□ -1.04
ALMS1-201ENST00000423048 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
ALMS1-201ENST00000423048 TCP11L2Q8N4U5 519 aa8.54□□□□□ -1.04
ALMS1-201ENST00000423048 ANAPC15P60006 121 aa8.54□□□□□ -1.04
ALMS1-201ENST00000423048 SASS6Q6UVJ0 657 aa8.54□□□□□ -1.04
ALMS1-201ENST00000423048 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
ALMS1-201ENST00000423048 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
ALMS1-201ENST00000423048 SPG7Q9UQ90 795 aa8.54□□□□□ -1.04
ALMS1-201ENST00000423048 MYOM2P54296 1465 aa8.54□□□□□ -1.04
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