RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CRB1P82279 1406 aa19.03■□□□□ 0.64
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AATKQ6ZMQ8 1374 aa19■□□□□ 0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 COL18A1P39060 1754 aa18.99■□□□□ 0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NLRP6P59044 892 aa18.99■□□□□ 0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP18.99■□□□□ 0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa18.99■□□□□ 0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa18.99■□□□□ 0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa18.99■□□□□ 0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OVOS2Q6IE36 1432 aa18.99■□□□□ 0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZBTB7CA1YPR0 619 aa18.98■□□□□ 0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AKAP12Q02952 1782 aa18.98■□□□□ 0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SBF2Q86WG5 1849 aa18.97■□□□□ 0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 L3MBTL2Q969R5 705 aa18.97■□□□□ 0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EVC2Q86UK5 1308 aa18.96■□□□□ 0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NBPF14Q5TI25 921 aa18.96■□□□□ 0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa18.93■□□□□ 0.62
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