RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402738.5

HERC3-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-202ENST00000402738 CENPHQ9H3R5 247 aa11.67□□□□□ -0.54
HERC3-202ENST00000402738 NINLQ9Y2I6 1382 aa11.67□□□□□ -0.54
HERC3-202ENST00000402738 KRT85P78386 507 aa11.67□□□□□ -0.54
HERC3-202ENST00000402738 NUP62CLQ9H1M0 184 aa11.67□□□□□ -0.54
HERC3-202ENST00000402738 FAM193AP78312 1265 aa11.67□□□□□ -0.54
HERC3-202ENST00000402738 PSMA5P28066 241 aa11.67□□□□□ -0.54
HERC3-202ENST00000402738 GIMAP7Q8NHV1 300 aa11.67□□□□□ -0.54
HERC3-202ENST00000402738 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa11.66□□□□□ -0.54
HERC3-202ENST00000402738 TNNT1P13805 278 aa11.66□□□□□ -0.54
HERC3-202ENST00000402738 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
HERC3-202ENST00000402738 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
HERC3-202ENST00000402738 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
HERC3-202ENST00000402738 NBPF1Q3BBV0 1214 aa11.66□□□□□ -0.54
HERC3-202ENST00000402738 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
HERC3-202ENST00000402738 HMOX1P09601 288 aa11.66□□□□□ -0.54
HERC3-202ENST00000402738 EVC2Q86UK5 1308 aa11.65□□□□□ -0.54
HERC3-202ENST00000402738 PRIMPOLQ96LW4 560 aa11.65□□□□□ -0.54
HERC3-202ENST00000402738 IGSF3O75054 1194 aa11.65□□□□□ -0.54
HERC3-202ENST00000402738 MTHFSP49914 203 aa11.65□□□□□ -0.54
HERC3-202ENST00000402738 CNTROBQ8N137 903 aa11.65□□□□□ -0.54
HERC3-202ENST00000402738 PLCD3Q8N3E9 789 aa11.65□□□□□ -0.54
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HERC3-202ENST00000402738 KIF18AQ8NI77 898 aa11.65□□□□□ -0.55
HERC3-202ENST00000402738 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.55
HERC3-202ENST00000402738 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
HERC3-202ENST00000402738 RBM25P49756 843 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
HERC3-202ENST00000402738 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
HERC3-202ENST00000402738 MAP3K11Q16584 847 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC3-202ENST00000402738 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC3-202ENST00000402738 NFXL1Q6ZNB6 911 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC3-202ENST00000402738 KDM4AO75164 1064 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC3-202ENST00000402738 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
HERC3-202ENST00000402738 STK38Q15208 465 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC3-202ENST00000402738 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
HERC3-202ENST00000402738 SMARCE1Q969G3 411 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC3-202ENST00000402738 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa11.63□□□□□ -0.55
HERC3-202ENST00000402738 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
HERC3-202ENST00000402738 ADCY5O95622 1261 aa11.63□□□□□ -0.55
HERC3-202ENST00000402738 SLFN5Q08AF3 891 aa11.63□□□□□ -0.55
HERC3-202ENST00000402738 TRDNQ13061 729 aa11.63□□□□□ -0.55
HERC3-202ENST00000402738 MLECQ14165 292 aa11.63□□□□□ -0.55
HERC3-202ENST00000402738 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
HERC3-202ENST00000402738 SPATA32Q96LK8 384 aa11.63□□□□□ -0.55
HERC3-202ENST00000402738 NUTM2FA1L443 756 aa11.63□□□□□ -0.55
HERC3-202ENST00000402738 HDGFP51858 240 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
HERC3-202ENST00000402738 STK3Q13188 491 aa11.63□□□□□ -0.55
HERC3-202ENST00000402738 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa11.63□□□□□ -0.55
HERC3-202ENST00000402738 CCDC183Q5T5S1 534 aa11.63□□□□□ -0.55
HERC3-202ENST00000402738 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa11.63□□□□□ -0.55
HERC3-202ENST00000402738 COG3Q96JB2 828 aa11.63□□□□□ -0.55
HERC3-202ENST00000402738 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
HERC3-202ENST00000402738 BAG4O95429 457 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
HERC3-202ENST00000402738 ME1P48163 572 aa11.62□□□□□ -0.55
HERC3-202ENST00000402738 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP11.62□□□□□ -0.55
HERC3-202ENST00000402738 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
HERC3-202ENST00000402738 KLHL40Q2TBA0 621 aa11.62□□□□□ -0.55
HERC3-202ENST00000402738 CEP57L1Q8IYX8 460 aa11.62□□□□□ -0.55
HERC3-202ENST00000402738 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
HERC3-202ENST00000402738 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
HERC3-202ENST00000402738 OFD1O75665 1012 aa11.62□□□□□ -0.55
HERC3-202ENST00000402738 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
HERC3-202ENST00000402738 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
HERC3-202ENST00000402738 FILIP1LQ4L180 1135 aa11.62□□□□□ -0.55
HERC3-202ENST00000402738 LRRCC1Q9C099 1032 aa11.62□□□□□ -0.55
HERC3-202ENST00000402738 SURF6O75683 361 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
HERC3-202ENST00000402738 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa11.61□□□□□ -0.55
HERC3-202ENST00000402738 TBC1D32Q96NH3 1257 aa11.61□□□□□ -0.55
HERC3-202ENST00000402738 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa11.61□□□□□ -0.55
HERC3-202ENST00000402738 MYOM3Q5VTT5 1437 aa11.61□□□□□ -0.55
HERC3-202ENST00000402738 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
HERC3-202ENST00000402738 VPS53Q5VIR6 699 aa11.61□□□□□ -0.55
HERC3-202ENST00000402738 URI1O94763 535 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
HERC3-202ENST00000402738 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
HERC3-202ENST00000402738 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
HERC3-202ENST00000402738 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
HERC3-202ENST00000402738 FSD1Q9BTV5 496 aa11.61□□□□□ -0.55
HERC3-202ENST00000402738 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
HERC3-202ENST00000402738 GGNBP2Q9H3C7 697 aa11.61□□□□□ -0.55
HERC3-202ENST00000402738 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
HERC3-202ENST00000402738 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa11.61□□□□□ -0.55
HERC3-202ENST00000402738 KRT222Q8N1A0 295 aa11.61□□□□□ -0.55
HERC3-202ENST00000402738 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
HERC3-202ENST00000402738 RSPH4AQ5TD94 716 aa11.6□□□□□ -0.55
HERC3-202ENST00000402738 PPFIBP1Q86W92 1011 aa11.6□□□□□ -0.55
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HERC3-202ENST00000402738 WWC1Q8IX03 1113 aa11.6□□□□□ -0.55
HERC3-202ENST00000402738 GDPD2Q9HCC8 539 aa11.6□□□□□ -0.55
HERC3-202ENST00000402738 CLIP2Q9UDT6 1046 aa11.6□□□□□ -0.55
HERC3-202ENST00000402738 TSPYL4Q9UJ04 414 aa11.6□□□□□ -0.55
HERC3-202ENST00000402738 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa11.6□□□□□ -0.55
HERC3-202ENST00000402738 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
HERC3-202ENST00000402738 GOLGA6L10A6NI86 522 aa11.6□□□□□ -0.55
HERC3-202ENST00000402738 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP11.6□□□□□ -0.55
HERC3-202ENST00000402738 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
HERC3-202ENST00000402738 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP11.59□□□□□ -0.55
HERC3-202ENST00000402738 NEXNQ0ZGT2 675 aa11.59□□□□□ -0.55
HERC3-202ENST00000402738 TRIM34Q9BYJ4 488 aa11.59□□□□□ -0.55
HERC3-202ENST00000402738 LMAN1P49257 510 aa11.59□□□□□ -0.55
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