RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000381558.6

TNNT3-204, Transcript of troponin T3, fast skeletal type, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TNNT3, Length 1,258 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT3-204ENST00000381558 NWD2Q9ULI1 1742 aa23.12■■□□□ 1.29
TNNT3-204ENST00000381558 NBPF8Q3BBV2 869 aa23.11■■□□□ 1.29
TNNT3-204ENST00000381558 EVC2Q86UK5 1308 aa23.1■■□□□ 1.29
TNNT3-204ENST00000381558 PLCH1Q4KWH8 1693 aa23.1■■□□□ 1.29
TNNT3-204ENST00000381558 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa23.1■■□□□ 1.29
TNNT3-204ENST00000381558 PLEKHG5O94827 1062 aa23.1■■□□□ 1.29
TNNT3-204ENST00000381558 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
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TNNT3-204ENST00000381558 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa23.08■■□□□ 1.29
TNNT3-204ENST00000381558 RALGAPBQ86X10 1494 aa23.08■■□□□ 1.29
TNNT3-204ENST00000381558 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
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TNNT3-204ENST00000381558 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
TNNT3-204ENST00000381558 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa23.04■■□□□ 1.28
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TNNT3-204ENST00000381558 VPS72Q15906 364 aa23.04■■□□□ 1.28
TNNT3-204ENST00000381558 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
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TNNT3-204ENST00000381558 NLRP13Q86W25 1043 aa22.96■■□□□ 1.27
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TNNT3-204ENST00000381558 AKAP12Q02952 1782 aa22.93■■□□□ 1.26
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TNNT3-204ENST00000381558 SLC24A1O60721 1099 aa22.91■■□□□ 1.26
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TNNT3-204ENST00000381558 SEPT12Q8IYM1 358 aa22.9■■□□□ 1.26
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TNNT3-204ENST00000381558 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa22.88■■□□□ 1.25
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TNNT3-204ENST00000381558 CCDC125Q86Z20 511 aa22.88■■□□□ 1.25
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TNNT3-204ENST00000381558 KRT27Q7Z3Y8 459 aa22.83■■□□□ 1.25
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TNNT3-204ENST00000381558 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa22.82■■□□□ 1.24
TNNT3-204ENST00000381558 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa22.81■■□□□ 1.24
TNNT3-204ENST00000381558 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
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TNNT3-204ENST00000381558 NINLQ9Y2I6 1382 aa22.8■■□□□ 1.24
TNNT3-204ENST00000381558 TERF2IPQ9NYB0 399 aa22.8■■□□□ 1.24
TNNT3-204ENST00000381558 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa22.8■■□□□ 1.24
TNNT3-204ENST00000381558 AATKQ6ZMQ8 1374 aa22.79■■□□□ 1.24
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TNNT3-204ENST00000381558 USP47Q96K76 1375 aa22.78■■□□□ 1.24
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TNNT3-204ENST00000381558 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
TNNT3-204ENST00000381558 USP54Q70EL1 1684 aa22.76■■□□□ 1.23
TNNT3-204ENST00000381558 USP31Q70CQ4 1352 aa22.76■■□□□ 1.23
TNNT3-204ENST00000381558 ZBTB7CA1YPR0 619 aa22.75■■□□□ 1.23
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TNNT3-204ENST00000381558 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
TNNT3-204ENST00000381558 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP22.74■■□□□ 1.23
TNNT3-204ENST00000381558 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
TNNT3-204ENST00000381558 A0A1W2PP64 1363 aa22.74■■□□□ 1.23
TNNT3-204ENST00000381558 COL18A1P39060 1754 aa22.73■■□□□ 1.23
TNNT3-204ENST00000381558 ARHGEF25Q86VW2 580 aa22.72■■□□□ 1.23
TNNT3-204ENST00000381558 TCP11L2Q8N4U5 519 aa22.72■■□□□ 1.23
TNNT3-204ENST00000381558 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
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TNNT3-204ENST00000381558 NFAT5O94916 1531 aa22.72■■□□□ 1.23
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