RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000377078.2

USP11-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 11, humanhuman

TSL 5

Gene USP11, Length 1,077 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11-202ENST00000377078 ABCA3Q99758 1704 aa24.48■■□□□ 1.51
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USP11-202ENST00000377078 EVC2Q86UK5 1308 aa24.46■■□□□ 1.51
USP11-202ENST00000377078 NBPF8Q3BBV2 869 aa24.46■■□□□ 1.51
USP11-202ENST00000377078 CABP2Q9NPB3 220 aa24.46■■□□□ 1.51
USP11-202ENST00000377078 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa24.45■■□□□ 1.51
USP11-202ENST00000377078 ATAD2Q6PL18 1390 aa24.45■■□□□ 1.5
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USP11-202ENST00000377078 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa24.24■■□□□ 1.47
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USP11-202ENST00000377078 AKAP12Q02952 1782 aa24.17■■□□□ 1.46
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USP11-202ENST00000377078 USP35Q9P2H5 1018 aa24.14■■□□□ 1.45
USP11-202ENST00000377078 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa24.14■■□□□ 1.45
USP11-202ENST00000377078 LMO7Q8WWI1 1683 aa24.12■■□□□ 1.45
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USP11-202ENST00000377078 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa24.09■■□□□ 1.45
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USP11-202ENST00000377078 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
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USP11-202ENST00000377078 CD163L1Q9NR16 1453 aa24.06■■□□□ 1.44
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USP11-202ENST00000377078 ARHGEF25Q86VW2 580 aa24.05■■□□□ 1.44
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USP11-202ENST00000377078 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa24.04■■□□□ 1.44
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