RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376303.6

SYP-202, Transcript of synaptophysin, humanhuman

TSL 2

Gene SYP, Length 858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-202ENST00000376303 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa25.43■■□□□ 1.66
SYP-202ENST00000376303 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
SYP-202ENST00000376303 CCDC61Q9Y6R9 512 aa25.42■■□□□ 1.66
SYP-202ENST00000376303 NRAPQ86VF7 1730 aa25.41■■□□□ 1.66
SYP-202ENST00000376303 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
SYP-202ENST00000376303 SEPT12Q8IYM1 358 aa25.4■■□□□ 1.66
SYP-202ENST00000376303 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
SYP-202ENST00000376303 L3MBTL2Q969R5 705 aa25.39■■□□□ 1.66
SYP-202ENST00000376303 BTG4Q9NY30 223 aa25.39■■□□□ 1.66
SYP-202ENST00000376303 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
SYP-202ENST00000376303 PLEKHG3A1L390 1219 aa25.38■■□□□ 1.65
SYP-202ENST00000376303 ACEP12821 1306 aa25.37■■□□□ 1.65
SYP-202ENST00000376303 NBPF8Q3BBV2 869 aa25.37■■□□□ 1.65
SYP-202ENST00000376303 QRICH2Q9H0J4 1663 aa25.36■■□□□ 1.65
SYP-202ENST00000376303 SIN3AQ96ST3 1273 aa25.35■■□□□ 1.65
SYP-202ENST00000376303 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
SYP-202ENST00000376303 PRDM11Q9NQV5 511 aa25.34■■□□□ 1.65
SYP-202ENST00000376303 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
SYP-202ENST00000376303 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa25.33■■□□□ 1.65
SYP-202ENST00000376303 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
SYP-202ENST00000376303 KRT27Q7Z3Y8 459 aa25.31■■□□□ 1.64
SYP-202ENST00000376303 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa25.3■■□□□ 1.64
SYP-202ENST00000376303 NEUROD1Q13562 356 aa25.3■■□□□ 1.64
SYP-202ENST00000376303 KIAA0232Q92628 1395 aa25.3■■□□□ 1.64
SYP-202ENST00000376303 A0A0G2JS52 829 aa25.29■■□□□ 1.64
SYP-202ENST00000376303 MYT1Q01538 1121 aa25.29■■□□□ 1.64
SYP-202ENST00000376303 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
SYP-202ENST00000376303 CABP2Q9NPB3 220 aa25.29■■□□□ 1.64
SYP-202ENST00000376303 NUTM2GQ5VZR2 741 aa25.28■■□□□ 1.64
SYP-202ENST00000376303 ABTB2Q8N961 1025 aa25.28■■□□□ 1.64
SYP-202ENST00000376303 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa25.28■■□□□ 1.64
SYP-202ENST00000376303 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa25.28■■□□□ 1.64
SYP-202ENST00000376303 ZRANB1Q9UGI0 708 aa25.27■■□□□ 1.64
SYP-202ENST00000376303 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
SYP-202ENST00000376303 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
SYP-202ENST00000376303 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
SYP-202ENST00000376303 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
SYP-202ENST00000376303 CHRNA2Q15822 529 aa25.24■■□□□ 1.63
SYP-202ENST00000376303 NRKQ7Z2Y5 1582 aa25.23■■□□□ 1.63
SYP-202ENST00000376303 EVC2Q86UK5 1308 aa25.23■■□□□ 1.63
SYP-202ENST00000376303 NLRP13Q86W25 1043 aa25.23■■□□□ 1.63
SYP-202ENST00000376303 CABP1Q9NZU7 370 aa25.22■■□□□ 1.63
SYP-202ENST00000376303 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa25.21■■□□□ 1.63
SYP-202ENST00000376303 USP19O94966 1318 aa25.21■■□□□ 1.63
SYP-202ENST00000376303 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa25.21■■□□□ 1.63
SYP-202ENST00000376303 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa25.2■■□□□ 1.62
SYP-202ENST00000376303 STRN4Q9NRL3 753 aa25.2■■□□□ 1.62
SYP-202ENST00000376303 CPDO75976 1380 aa25.19■■□□□ 1.62
SYP-202ENST00000376303 DEFB132Q7Z7B7 95 aa25.19■■□□□ 1.62
SYP-202ENST00000376303 USP6P35125 1406 aa25.19■■□□□ 1.62
SYP-202ENST00000376303 GCP02774 474 aa25.17■■□□□ 1.62
SYP-202ENST00000376303 EVA1CP58658 441 aa25.17■■□□□ 1.62
SYP-202ENST00000376303 LMO7Q8WWI1 1683 aa25.16■■□□□ 1.62
SYP-202ENST00000376303 SSH2Q76I76 1423 aa25.15■■□□□ 1.62
SYP-202ENST00000376303 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa25.15■■□□□ 1.62
SYP-202ENST00000376303 RGPD1P0DJD0 1748 aa25.14■■□□□ 1.61
SYP-202ENST00000376303 NLRP6P59044 892 aa25.13■■□□□ 1.61
SYP-202ENST00000376303 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
SYP-202ENST00000376303 BAG6P46379 1132 aa25.12■■□□□ 1.61
SYP-202ENST00000376303 AKAP12Q02952 1782 aa25.11■■□□□ 1.61
SYP-202ENST00000376303 BARGINQ6ZT62 677 aa25.11■■□□□ 1.61
SYP-202ENST00000376303 USP35Q9P2H5 1018 aa25.11■■□□□ 1.61
SYP-202ENST00000376303 FAM182BQ5T319 152 aa25.1■■□□□ 1.61
SYP-202ENST00000376303 PIK3C2AO00443 1686 aa25.1■■□□□ 1.61
SYP-202ENST00000376303 SLIT3O75094 1523 aa25.09■■□□□ 1.61
SYP-202ENST00000376303 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
SYP-202ENST00000376303 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa25.08■■□□□ 1.61
SYP-202ENST00000376303 CARD11Q9BXL7 1154 aa25.08■■□□□ 1.61
SYP-202ENST00000376303 TONSLQ96HA7 1378 aa25.07■■□□□ 1.6
SYP-202ENST00000376303 TCP11L2Q8N4U5 519 aa25.07■■□□□ 1.6
SYP-202ENST00000376303 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
SYP-202ENST00000376303 FAM196AQ6ZSG2 479 aa25.06■■□□□ 1.6
SYP-202ENST00000376303 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
SYP-202ENST00000376303 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
SYP-202ENST00000376303 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa25.05■■□□□ 1.6
SYP-202ENST00000376303 AATKQ6ZMQ8 1374 aa25.05■■□□□ 1.6
SYP-202ENST00000376303 TTC21AQ8NDW8 1320 aa25.04■■□□□ 1.6
SYP-202ENST00000376303 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
SYP-202ENST00000376303 PDE3BQ13370 1112 aa25.03■■□□□ 1.6
SYP-202ENST00000376303 DISP2A7MBM2 1401 aa25.03■■□□□ 1.6
SYP-202ENST00000376303 ZBTB7CA1YPR0 619 aa25.02■■□□□ 1.6
SYP-202ENST00000376303 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
SYP-202ENST00000376303 COL18A1P39060 1754 aa25.02■■□□□ 1.6
SYP-202ENST00000376303 CRB1P82279 1406 aa25.02■■□□□ 1.6
SYP-202ENST00000376303 KCNH5Q8NCM2 988 aa25.01■■□□□ 1.59
SYP-202ENST00000376303 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
SYP-202ENST00000376303 MON2Q7Z3U7 1717 aa25■■□□□ 1.59
SYP-202ENST00000376303 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
SYP-202ENST00000376303 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
SYP-202ENST00000376303 TRIM37O94972 964 aa24.98■■□□□ 1.59
SYP-202ENST00000376303 RGPD5Q99666 1765 aa24.97■■□□□ 1.59
SYP-202ENST00000376303 ARHGEF25Q86VW2 580 aa24.96■■□□□ 1.59
SYP-202ENST00000376303 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa24.95■■□□□ 1.58
SYP-202ENST00000376303 AXIN2Q9Y2T1 843 aa24.95■■□□□ 1.58
SYP-202ENST00000376303 WDR17Q8IZU2 1322 aa24.93■■□□□ 1.58
SYP-202ENST00000376303 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
SYP-202ENST00000376303 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
SYP-202ENST00000376303 CD163L1Q9NR16 1453 aa24.92■■□□□ 1.58
SYP-202ENST00000376303 SOX12O15370 315 aa24.92■■□□□ 1.58
SYP-202ENST00000376303 APBA3O96018 575 aa24.92■■□□□ 1.58
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