RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC27Q2M243 656 aa24.38■■□□□ 1.49
CCSAP-203ENST00000366687 TATP17735 454 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
CCSAP-203ENST00000366687 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
CCSAP-203ENST00000366687 RABEP1Q15276 862 aa24.38■■□□□ 1.49
CCSAP-203ENST00000366687 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa24.38■■□□□ 1.49
CCSAP-203ENST00000366687 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
CCSAP-203ENST00000366687 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.37■■□□□ 1.49
CCSAP-203ENST00000366687 SDF4Q9BRK5 362 aa24.37■■□□□ 1.49
CCSAP-203ENST00000366687 BRMS1Q9HCU9 246 aa24.37■■□□□ 1.49
CCSAP-203ENST00000366687 PRM3Q9NNZ6 103 aa24.37■■□□□ 1.49
CCSAP-203ENST00000366687 CCT4P50991 539 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
CCSAP-203ENST00000366687 FOSBP53539 338 aa24.37■■□□□ 1.49
CCSAP-203ENST00000366687 SART3Q15020 963 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
CCSAP-203ENST00000366687 BCAR3O75815 825 aa24.36■■□□□ 1.49
CCSAP-203ENST00000366687 MBD3O95983 291 aa24.35■■□□□ 1.49
CCSAP-203ENST00000366687 MRE11P49959 708 aa24.35■■□□□ 1.49
CCSAP-203ENST00000366687 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa24.34■■□□□ 1.49
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
CCSAP-203ENST00000366687 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
CCSAP-203ENST00000366687 C1orf115Q9H7X2 142 aa24.33■■□□□ 1.49
CCSAP-203ENST00000366687 ERBINQ96RT1 1412 aa24.33■■□□□ 1.49
CCSAP-203ENST00000366687 ATAD2Q6PL18 1390 aa24.33■■□□□ 1.49
CCSAP-203ENST00000366687 TOPBP1Q92547 1522 aa24.33■■□□□ 1.49
CCSAP-203ENST00000366687 KIF6Q6ZMV9 814 aa24.33■■□□□ 1.49
CCSAP-203ENST00000366687 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
CCSAP-203ENST00000366687 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa24.32■■□□□ 1.48
CCSAP-203ENST00000366687 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa24.32■■□□□ 1.48
CCSAP-203ENST00000366687 NESP48681 1621 aa24.32■■□□□ 1.48
CCSAP-203ENST00000366687 FYB1O15117 783 aa24.32■■□□□ 1.48
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
CCSAP-203ENST00000366687 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP24.32■■□□□ 1.48
CCSAP-203ENST00000366687 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
CCSAP-203ENST00000366687 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
CCSAP-203ENST00000366687 FAM43AQ8N2R8 423 aa24.31■■□□□ 1.48
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF428Q96B54 188 aa24.31■■□□□ 1.48
CCSAP-203ENST00000366687 DAPK1P53355 1430 aa24.31■■□□□ 1.48
CCSAP-203ENST00000366687 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
CCSAP-203ENST00000366687 OLFM4Q6UX06 510 aa24.29■■□□□ 1.48
CCSAP-203ENST00000366687 TRAK2O60296 914 aa24.29■■□□□ 1.48
CCSAP-203ENST00000366687 NASPP49321 788 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
CCSAP-203ENST00000366687 RAPGEF3O95398 923 aa24.28■■□□□ 1.48
CCSAP-203ENST00000366687 IFT57Q9NWB7 429 aa24.28■■□□□ 1.48
CCSAP-203ENST00000366687 MVPQ14764 893 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
CCSAP-203ENST00000366687 FCHSD2O94868 740 aa24.28■■□□□ 1.48
CCSAP-203ENST00000366687 LRRCC1Q9C099 1032 aa24.28■■□□□ 1.48
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC158Q5M9N0 1113 aa24.27■■□□□ 1.48
CCSAP-203ENST00000366687 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
CCSAP-203ENST00000366687 TIAM1Q13009 1591 aa24.27■■□□□ 1.47
CCSAP-203ENST00000366687 FAM177BA6PVY3 158 aa24.26■■□□□ 1.47
CCSAP-203ENST00000366687 STRN4Q9NRL3 753 aa24.26■■□□□ 1.47
CCSAP-203ENST00000366687 TOP2BQ02880 1626 aa24.26■■□□□ 1.47
CCSAP-203ENST00000366687 KINO60870 393 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
CCSAP-203ENST00000366687 SLC26A8Q96RN1 970 aa24.26■■□□□ 1.47
CCSAP-203ENST00000366687 HECW1Q76N89 1606 aa24.25■■□□□ 1.47
CCSAP-203ENST00000366687 AKNAQ7Z591 1439 aa24.25■■□□□ 1.47
CCSAP-203ENST00000366687 CABP4P57796 275 aa24.25■■□□□ 1.47
CCSAP-203ENST00000366687 RNF214Q8ND24 703 aa24.25■■□□□ 1.47
CCSAP-203ENST00000366687 SPG7Q9UQ90 795 aa24.24■■□□□ 1.47
CCSAP-203ENST00000366687 CNNM1Q9NRU3 951 aa24.24■■□□□ 1.47
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC61Q9Y6R9 512 aa24.24■■□□□ 1.47
CCSAP-203ENST00000366687 ANKLE2Q86XL3 938 aa24.23■■□□□ 1.47
CCSAP-203ENST00000366687 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
CCSAP-203ENST00000366687 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
CCSAP-203ENST00000366687 BACH2Q9BYV9 841 aa24.23■■□□□ 1.47
CCSAP-203ENST00000366687 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.22■■□□□ 1.47
CCSAP-203ENST00000366687 MNS1Q8NEH6 495 aa24.22■■□□□ 1.47
CCSAP-203ENST00000366687 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
CCSAP-203ENST00000366687 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa24.22■■□□□ 1.47
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC39Q9UFE4 941 aa24.22■■□□□ 1.47
CCSAP-203ENST00000366687 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa24.22■■□□□ 1.47
CCSAP-203ENST00000366687 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP24.22■■□□□ 1.47
CCSAP-203ENST00000366687 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
CCSAP-203ENST00000366687 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
CCSAP-203ENST00000366687 FAM13BQ9NYF5 915 aa24.21■■□□□ 1.47
CCSAP-203ENST00000366687 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.47
CCSAP-203ENST00000366687 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.47
CCSAP-203ENST00000366687 ANKRD1Q15327 319 aa24.2■■□□□ 1.46
CCSAP-203ENST00000366687 NAIPQ13075 1403 aa24.2■■□□□ 1.46
CCSAP-203ENST00000366687 ATP2B1P20020 1258 aa24.2■■□□□ 1.46
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
CCSAP-203ENST00000366687 OFD1O75665 1012 aa24.2■■□□□ 1.46
CCSAP-203ENST00000366687 TTC39AQ5SRH9 613 aa24.2■■□□□ 1.46
CCSAP-203ENST00000366687 CHD1LQ86WJ1 897 aa24.19■■□□□ 1.46
CCSAP-203ENST00000366687 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
CCSAP-203ENST00000366687 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
CCSAP-203ENST00000366687 MTMR7Q9Y216 660 aa24.19■■□□□ 1.46
CCSAP-203ENST00000366687 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa24.19■■□□□ 1.46
CCSAP-203ENST00000366687 FIBPO43427 364 aa24.19■■□□□ 1.46
CCSAP-203ENST00000366687 TRIM5Q9C035 493 aa24.19■■□□□ 1.46
CCSAP-203ENST00000366687 HMGXB3Q12766 1538 aa24.19■■□□□ 1.46
CCSAP-203ENST00000366687 NFE2L2Q16236 605 aa24.18■■□□□ 1.46
CCSAP-203ENST00000366687 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
CCSAP-203ENST00000366687 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
CCSAP-203ENST00000366687 IKQ13123 557 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
CCSAP-203ENST00000366687 JMYQ8N9B5 988 aa24.17■■□□□ 1.46
CCSAP-203ENST00000366687 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
CCSAP-203ENST00000366687 STK38Q15208 465 aa24.17■■□□□ 1.46
CCSAP-203ENST00000366687 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
CCSAP-203ENST00000366687 TEX35Q5T0J7 233 aa24.17■■□□□ 1.46
CCSAP-203ENST00000366687 PRDM11Q9NQV5 511 aa24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.2 ms