RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362869.1

RNU6-552P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 552, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-552P, Length 119 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRR20BP86481 221 aa6.86□□□□□ -1.31
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRR20AP86496 221 aa6.86□□□□□ -1.31
RNU6-552P-201ENST00000362869 NR6A1Q15406 480 aa6.86□□□□□ -1.31
RNU6-552P-201ENST00000362869 NBPF14Q5TI25 921 aa6.86□□□□□ -1.31
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF511Q8NB15 262 aa6.86□□□□□ -1.31
RNU6-552P-201ENST00000362869 ARMC2Q8NEN0 867 aa6.86□□□□□ -1.31
RNU6-552P-201ENST00000362869 BAP1Q92560 729 aa6.86□□□□□ -1.31
RNU6-552P-201ENST00000362869 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
RNU6-552P-201ENST00000362869 PKD2L1Q9P0L9 805 aa6.86□□□□□ -1.31
RNU6-552P-201ENST00000362869 GFRA3O60609 400 aa6.85□□□□□ -1.31
RNU6-552P-201ENST00000362869 SH3BP2P78314 561 aa6.85□□□□□ -1.31
RNU6-552P-201ENST00000362869 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
RNU6-552P-201ENST00000362869 BANK1Q8NDB2 785 aa6.85□□□□□ -1.31
RNU6-552P-201ENST00000362869 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
RNU6-552P-201ENST00000362869 LAPTM4AQ15012 233 aa6.84□□□□□ -1.31
RNU6-552P-201ENST00000362869 EHBP1Q8NDI1 1231 aa6.84□□□□□ -1.31
RNU6-552P-201ENST00000362869 FKBPLQ9UIM3 349 aa6.84□□□□□ -1.31
RNU6-552P-201ENST00000362869 PNMA1Q8ND90 353 aa6.83□□□□□ -1.32
RNU6-552P-201ENST00000362869 EPS8L1Q8TE68 723 aa6.83□□□□□ -1.32
RNU6-552P-201ENST00000362869 MRGPRX2Q96LB1 330 aa6.83□□□□□ -1.32
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
RNU6-552P-201ENST00000362869 SOCS7O14512 581 aa6.82□□□□□ -1.32
RNU6-552P-201ENST00000362869 AGERQ15109 404 aa6.82□□□□□ -1.32
RNU6-552P-201ENST00000362869 CYP4X1Q8N118 509 aa6.82□□□□□ -1.32
RNU6-552P-201ENST00000362869 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP6.82□□□□□ -1.32
RNU6-552P-201ENST00000362869 APBB1O00213 710 aa6.81□□□□□ -1.32
RNU6-552P-201ENST00000362869 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
RNU6-552P-201ENST00000362869 MTMR14Q8NCE2 650 aa6.81□□□□□ -1.32
RNU6-552P-201ENST00000362869 FOXJ1Q92949 421 aa6.81□□□□□ -1.32
RNU6-552P-201ENST00000362869 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRIM34Q9BYJ4 488 aa6.81□□□□□ -1.32
RNU6-552P-201ENST00000362869 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
RNU6-552P-201ENST00000362869 VARSP26640 1264 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
RNU6-552P-201ENST00000362869 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa6.8□□□□□ -1.32
RNU6-552P-201ENST00000362869 SNRKQ9NRH2 765 aa6.8□□□□□ -1.32
RNU6-552P-201ENST00000362869 TOR4AQ9NXH8 423 aa6.8□□□□□ -1.32
RNU6-552P-201ENST00000362869 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM187AA6NFU0 413 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU6-552P-201ENST00000362869 PDXDC2PQ6P474 469 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU6-552P-201ENST00000362869 Q6ZNB5 142 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU6-552P-201ENST00000362869 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU6-552P-201ENST00000362869 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
RNU6-552P-201ENST00000362869 PKDCCQ504Y2 493 aa6.78□□□□□ -1.32
RNU6-552P-201ENST00000362869 C4orf48Q5BLP8 95 aa6.78□□□□□ -1.32
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM174AQ8TBP5 190 aa6.78□□□□□ -1.32
RNU6-552P-201ENST00000362869 CARD14Q9BXL6 1004 aa6.78□□□□□ -1.32
RNU6-552P-201ENST00000362869 TLL2Q9Y6L7 1015 aa6.78□□□□□ -1.32
RNU6-552P-201ENST00000362869 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa6.78□□□□□ -1.32
RNU6-552P-201ENST00000362869 SIAH2O43255 324 aa6.77□□□□□ -1.33
RNU6-552P-201ENST00000362869 ALDH1A1P00352 501 aa6.77□□□□□ -1.33
RNU6-552P-201ENST00000362869 MCM6Q14566 821 aa6.77□□□□□ -1.33
RNU6-552P-201ENST00000362869 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa6.77□□□□□ -1.33
RNU6-552P-201ENST00000362869 J3QL48 77 aa6.76□□□□□ -1.33
RNU6-552P-201ENST00000362869 PTK2Q05397 1052 aa6.76□□□□□ -1.33
RNU6-552P-201ENST00000362869 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa6.76□□□□□ -1.33
RNU6-552P-201ENST00000362869 GPSM3Q9Y4H4 160 aa6.76□□□□□ -1.33
RNU6-552P-201ENST00000362869 SMPD1P17405 629 aa6.75□□□□□ -1.33
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZBTB33Q86T24 672 aa6.75□□□□□ -1.33
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRM3Q9NNZ6 103 aa6.75□□□□□ -1.33
RNU6-552P-201ENST00000362869 WASF2Q9Y6W5 498 aa6.75□□□□□ -1.33
RNU6-552P-201ENST00000362869 DGAT1O75907 488 aa6.74□□□□□ -1.33
RNU6-552P-201ENST00000362869 ARID5BQ14865 1188 aa6.74□□□□□ -1.33
RNU6-552P-201ENST00000362869 ERFEQ4G0M1 354 aa6.74□□□□□ -1.33
RNU6-552P-201ENST00000362869 MPNDQ8N594 471 aa6.74□□□□□ -1.33
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC10A4Q96EP9 437 aa6.74□□□□□ -1.33
RNU6-552P-201ENST00000362869 OCSTAMPQ9BR26 566 aa6.74□□□□□ -1.33
RNU6-552P-201ENST00000362869 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa6.74□□□□□ -1.33
RNU6-552P-201ENST00000362869 GPR37L1O60883 481 aa6.73□□□□□ -1.33
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
RNU6-552P-201ENST00000362869 ADAM32Q8TC27 787 aa6.73□□□□□ -1.33
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZBBXA8MT70 800 aa6.72□□□□□ -1.33
RNU6-552P-201ENST00000362869 ADH1CP00326 375 aa6.72□□□□□ -1.33
RNU6-552P-201ENST00000362869 FBXO45P0C2W1 286 aa6.72□□□□□ -1.33
RNU6-552P-201ENST00000362869 FLIIQ13045 1269 aa6.72□□□□□ -1.33
RNU6-552P-201ENST00000362869 CDK15Q96Q40 435 aa6.72□□□□□ -1.33
RNU6-552P-201ENST00000362869 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa6.72□□□□□ -1.33
RNU6-552P-201ENST00000362869 AVPP01185 164 aa6.71□□□□□ -1.34
RNU6-552P-201ENST00000362869 FSHRP23945 695 aa6.71□□□□□ -1.34
RNU6-552P-201ENST00000362869 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
RNU6-552P-201ENST00000362869 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
RNU6-552P-201ENST00000362869 MYT1Q01538 1121 aa6.7□□□□□ -1.34
RNU6-552P-201ENST00000362869 NNTQ13423 1086 aa6.7□□□□□ -1.34
RNU6-552P-201ENST00000362869 HPS1Q92902 700 aa6.7□□□□□ -1.34
RNU6-552P-201ENST00000362869 GDPD2Q9HCC8 539 aa6.7□□□□□ -1.34
RNU6-552P-201ENST00000362869 UBTFP17480 764 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
RNU6-552P-201ENST00000362869 ABL2P42684 1182 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-552P-201ENST00000362869 NR1H3Q13133 447 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-552P-201ENST00000362869 NR5A1Q13285 461 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-552P-201ENST00000362869 CTC1Q2NKJ3 1217 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-552P-201ENST00000362869 NBPF20Q3BBV1 942 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRAF7Q6Q0C0 670 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-552P-201ENST00000362869 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
RNU6-552P-201ENST00000362869 LCE2BO14633 110 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-552P-201ENST00000362869 AXIN1O15169 862 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-552P-201ENST00000362869 ST8SIA5O15466 376 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-552P-201ENST00000362869 GRM5P41594 1212 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-552P-201ENST00000362869 CRIPAKQ8N1N5 446 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-552P-201ENST00000362869 COG6Q9Y2V7 657 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-552P-201ENST00000362869 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.3 ms