RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000343131.6

SYCE1-202, Transcript of synaptonemal complex central element protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYCE1, Length 1,113 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE1-202ENST00000343131 NRKQ7Z2Y5 1582 aa23■■□□□ 1.27
SYCE1-202ENST00000343131 FAM83GA6ND36 823 aa22.99■■□□□ 1.27
SYCE1-202ENST00000343131 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
SYCE1-202ENST00000343131 VPS72Q15906 364 aa22.99■■□□□ 1.27
SYCE1-202ENST00000343131 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
SYCE1-202ENST00000343131 CDK19Q9BWU1 502 aa22.98■■□□□ 1.27
SYCE1-202ENST00000343131 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
SYCE1-202ENST00000343131 BTG4Q9NY30 223 aa22.95■■□□□ 1.26
SYCE1-202ENST00000343131 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa22.95■■□□□ 1.26
SYCE1-202ENST00000343131 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa22.94■■□□□ 1.26
SYCE1-202ENST00000343131 SEPT12Q8IYM1 358 aa22.94■■□□□ 1.26
SYCE1-202ENST00000343131 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
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SYCE1-202ENST00000343131 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
SYCE1-202ENST00000343131 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa22.91■■□□□ 1.26
SYCE1-202ENST00000343131 NUTM2GQ5VZR2 741 aa22.91■■□□□ 1.26
SYCE1-202ENST00000343131 L3MBTL2Q969R5 705 aa22.91■■□□□ 1.26
SYCE1-202ENST00000343131 KIAA0232Q92628 1395 aa22.9■■□□□ 1.26
SYCE1-202ENST00000343131 A0A0G2JS52 829 aa22.9■■□□□ 1.26
SYCE1-202ENST00000343131 MYT1Q01538 1121 aa22.9■■□□□ 1.26
SYCE1-202ENST00000343131 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.9■■□□□ 1.26
SYCE1-202ENST00000343131 PRDM11Q9NQV5 511 aa22.9■■□□□ 1.26
SYCE1-202ENST00000343131 LMO7Q8WWI1 1683 aa22.89■■□□□ 1.25
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SYCE1-202ENST00000343131 CCDC61Q9Y6R9 512 aa22.88■■□□□ 1.25
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SYCE1-202ENST00000343131 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
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SYCE1-202ENST00000343131 CHRNA2Q15822 529 aa22.86■■□□□ 1.25
SYCE1-202ENST00000343131 CABP2Q9NPB3 220 aa22.86■■□□□ 1.25
SYCE1-202ENST00000343131 AKAP12Q02952 1782 aa22.86■■□□□ 1.25
SYCE1-202ENST00000343131 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
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SYCE1-202ENST00000343131 KRT27Q7Z3Y8 459 aa22.85■■□□□ 1.25
SYCE1-202ENST00000343131 CCDC125Q86Z20 511 aa22.85■■□□□ 1.25
SYCE1-202ENST00000343131 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa22.84■■□□□ 1.25
SYCE1-202ENST00000343131 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa22.84■■□□□ 1.25
SYCE1-202ENST00000343131 PLEKHG3A1L390 1219 aa22.84■■□□□ 1.25
SYCE1-202ENST00000343131 NEUROD1Q13562 356 aa22.84■■□□□ 1.25
SYCE1-202ENST00000343131 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
SYCE1-202ENST00000343131 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
SYCE1-202ENST00000343131 DEFB132Q7Z7B7 95 aa22.82■■□□□ 1.24
SYCE1-202ENST00000343131 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa22.81■■□□□ 1.24
SYCE1-202ENST00000343131 USP6P35125 1406 aa22.81■■□□□ 1.24
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SYCE1-202ENST00000343131 ABTB2Q8N961 1025 aa22.8■■□□□ 1.24
SYCE1-202ENST00000343131 STRN4Q9NRL3 753 aa22.8■■□□□ 1.24
SYCE1-202ENST00000343131 ZRANB1Q9UGI0 708 aa22.8■■□□□ 1.24
SYCE1-202ENST00000343131 SSH2Q76I76 1423 aa22.79■■□□□ 1.24
SYCE1-202ENST00000343131 SLIT3O75094 1523 aa22.78■■□□□ 1.24
SYCE1-202ENST00000343131 FAM182BQ5T319 152 aa22.78■■□□□ 1.24
SYCE1-202ENST00000343131 MON2Q7Z3U7 1717 aa22.77■■□□□ 1.24
SYCE1-202ENST00000343131 WNK3Q9BYP7 1800 aa22.77■■□□□ 1.24
SYCE1-202ENST00000343131 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa22.77■■□□□ 1.24
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SYCE1-202ENST00000343131 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
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SYCE1-202ENST00000343131 RGPD5Q99666 1765 aa22.73■■□□□ 1.23
SYCE1-202ENST00000343131 USP35Q9P2H5 1018 aa22.73■■□□□ 1.23
SYCE1-202ENST00000343131 EVC2Q86UK5 1308 aa22.73■■□□□ 1.23
SYCE1-202ENST00000343131 COL18A1P39060 1754 aa22.73■■□□□ 1.23
SYCE1-202ENST00000343131 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
SYCE1-202ENST00000343131 LRRC37A3O60309 1634 aa22.71■■□□□ 1.23
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SYCE1-202ENST00000343131 GCP02774 474 aa22.69■■□□□ 1.22
SYCE1-202ENST00000343131 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
SYCE1-202ENST00000343131 LRP5O75197 1615 aa22.68■■□□□ 1.22
SYCE1-202ENST00000343131 ZBTB7CA1YPR0 619 aa22.68■■□□□ 1.22
SYCE1-202ENST00000343131 BAG6P46379 1132 aa22.67■■□□□ 1.22
SYCE1-202ENST00000343131 EVA1CP58658 441 aa22.67■■□□□ 1.22
SYCE1-202ENST00000343131 RREB1Q92766 1687 aa22.67■■□□□ 1.22
SYCE1-202ENST00000343131 USP54Q70EL1 1684 aa22.66■■□□□ 1.22
SYCE1-202ENST00000343131 NLRP6P59044 892 aa22.66■■□□□ 1.22
SYCE1-202ENST00000343131 NFAT5O94916 1531 aa22.65■■□□□ 1.22
SYCE1-202ENST00000343131 DISP2A7MBM2 1401 aa22.65■■□□□ 1.22
SYCE1-202ENST00000343131 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
SYCE1-202ENST00000343131 TONSLQ96HA7 1378 aa22.64■■□□□ 1.22
SYCE1-202ENST00000343131 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa22.64■■□□□ 1.22
SYCE1-202ENST00000343131 NUP188Q5SRE5 1749 aa22.64■■□□□ 1.21
SYCE1-202ENST00000343131 PEAK1Q9H792 1746 aa22.64■■□□□ 1.21
SYCE1-202ENST00000343131 CRB1P82279 1406 aa22.64■■□□□ 1.21
SYCE1-202ENST00000343131 LTN1O94822 1766 aa22.63■■□□□ 1.21
SYCE1-202ENST00000343131 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
SYCE1-202ENST00000343131 BARGINQ6ZT62 677 aa22.62■■□□□ 1.21
SYCE1-202ENST00000343131 AATKQ6ZMQ8 1374 aa22.62■■□□□ 1.21
SYCE1-202ENST00000343131 SBF2Q86WG5 1849 aa22.61■■□□□ 1.21
SYCE1-202ENST00000343131 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa22.61■■□□□ 1.21
SYCE1-202ENST00000343131 TCP11L2Q8N4U5 519 aa22.61■■□□□ 1.21
SYCE1-202ENST00000343131 CARD11Q9BXL7 1154 aa22.61■■□□□ 1.21
SYCE1-202ENST00000343131 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
SYCE1-202ENST00000343131 CD163L1Q9NR16 1453 aa22.6■■□□□ 1.21
SYCE1-202ENST00000343131 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
SYCE1-202ENST00000343131 SOX12O15370 315 aa22.59■■□□□ 1.21
SYCE1-202ENST00000343131 TRIM37O94972 964 aa22.59■■□□□ 1.21
SYCE1-202ENST00000343131 FAM196AQ6ZSG2 479 aa22.57■■□□□ 1.2
SYCE1-202ENST00000343131 TTC21AQ8NDW8 1320 aa22.57■■□□□ 1.2
SYCE1-202ENST00000343131 PDE3BQ13370 1112 aa22.56■■□□□ 1.2
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