RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000327359.7

BRF1-201, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, humanhuman

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Gene BRF1, Length 2,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1-201ENST00000327359 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
BRF1-201ENST00000327359 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
BRF1-201ENST00000327359 ARXQ96QS3 562 aa20.4■□□□□ 0.86
BRF1-201ENST00000327359 TBC1D2Q9BYX2 928 aa20.4■□□□□ 0.86
BRF1-201ENST00000327359 TNRQ92752 1358 aa20.4■□□□□ 0.86
BRF1-201ENST00000327359 TBC1D32Q96NH3 1257 aa20.39■□□□□ 0.86
BRF1-201ENST00000327359 CDK19Q9BWU1 502 aa20.38■□□□□ 0.85
BRF1-201ENST00000327359 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa20.38■□□□□ 0.85
BRF1-201ENST00000327359 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP20.37■□□□□ 0.852e-6■■□□□ 12.3
BRF1-201ENST00000327359 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP20.37■□□□□ 0.85
BRF1-201ENST00000327359 RRP9O43818 475 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
BRF1-201ENST00000327359 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
BRF1-201ENST00000327359 WWC1Q8IX03 1113 aa20.36■□□□□ 0.85
BRF1-201ENST00000327359 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa20.36■□□□□ 0.85
BRF1-201ENST00000327359 A0A1W2PP64 1363 aa20.35■□□□□ 0.85
BRF1-201ENST00000327359 FSD2A1L4K1 749 aa20.34■□□□□ 0.85
BRF1-201ENST00000327359 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa20.34■□□□□ 0.85
BRF1-201ENST00000327359 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa20.34■□□□□ 0.85
BRF1-201ENST00000327359 TNNQ9UQP3 1299 aa20.34■□□□□ 0.85
BRF1-201ENST00000327359 METP08581 1390 aa20.34■□□□□ 0.85
BRF1-201ENST00000327359 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa20.33■□□□□ 0.85
BRF1-201ENST00000327359 MTHFSP49914 203 aa20.33■□□□□ 0.85
BRF1-201ENST00000327359 TXNDC2Q86VQ3 553 aa20.33■□□□□ 0.85
BRF1-201ENST00000327359 PODXL2Q9NZ53 605 aa20.33■□□□□ 0.85
BRF1-201ENST00000327359 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa20.33■□□□□ 0.85
BRF1-201ENST00000327359 NGEFQ8N5V2 710 aa20.33■□□□□ 0.84
BRF1-201ENST00000327359 PANK2Q9BZ23 570 aa20.33■□□□□ 0.84
BRF1-201ENST00000327359 GGNBP2Q9H3C7 697 aa20.33■□□□□ 0.84
BRF1-201ENST00000327359 RLBP1P12271 317 aa20.32■□□□□ 0.84
BRF1-201ENST00000327359 HDGFP51858 240 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
BRF1-201ENST00000327359 CABP1Q9NZU7 370 aa20.32■□□□□ 0.84
BRF1-201ENST00000327359 ATAD2Q6PL18 1390 aa20.32■□□□□ 0.84
BRF1-201ENST00000327359 MCM4P33991 863 aa20.31■□□□□ 0.84
BRF1-201ENST00000327359 RARSP54136 660 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
BRF1-201ENST00000327359 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
BRF1-201ENST00000327359 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa20.31■□□□□ 0.84
BRF1-201ENST00000327359 TERF2IPQ9NYB0 399 aa20.31■□□□□ 0.84
BRF1-201ENST00000327359 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
BRF1-201ENST00000327359 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
BRF1-201ENST00000327359 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
BRF1-201ENST00000327359 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa20.29■□□□□ 0.84
BRF1-201ENST00000327359 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
BRF1-201ENST00000327359 USP32Q8NFA0 1604 aa20.28■□□□□ 0.84
BRF1-201ENST00000327359 ABCC11Q96J66 1382 aa20.28■□□□□ 0.84
BRF1-201ENST00000327359 TMEM2Q9UHN6 1383 aa20.28■□□□□ 0.84
BRF1-201ENST00000327359 NEUROD2Q15784 382 aa20.28■□□□□ 0.84
BRF1-201ENST00000327359 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
BRF1-201ENST00000327359 SHPRHQ149N8 1683 aa20.27■□□□□ 0.84
BRF1-201ENST00000327359 BCL2L13Q9BXK5 485 aa20.27■□□□□ 0.83
BRF1-201ENST00000327359 CLCN1P35523 988 aa20.26■□□□□ 0.83
BRF1-201ENST00000327359 CFAP53Q96M91 514 aa20.26■□□□□ 0.83
BRF1-201ENST00000327359 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
BRF1-201ENST00000327359 FYB1O15117 783 aa20.25■□□□□ 0.83
BRF1-201ENST00000327359 LTKP29376 864 aa20.25■□□□□ 0.83
BRF1-201ENST00000327359 AAMPQ13685 434 aa20.25■□□□□ 0.83
BRF1-201ENST00000327359 UBR1Q8IWV7 1749 aa20.25■□□□□ 0.83
BRF1-201ENST00000327359 DLC1Q96QB1 1528 aa20.25■□□□□ 0.83
BRF1-201ENST00000327359 CD163L1Q9NR16 1453 aa20.25■□□□□ 0.83
BRF1-201ENST00000327359 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
BRF1-201ENST00000327359 NSD2O96028 1365 aa20.25■□□□□ 0.83
BRF1-201ENST00000327359 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP20.24■□□□□ 0.83
BRF1-201ENST00000327359 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
BRF1-201ENST00000327359 TRAK2O60296 914 aa20.23■□□□□ 0.83
BRF1-201ENST00000327359 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
BRF1-201ENST00000327359 CHMP5Q9NZZ3 219 aa20.23■□□□□ 0.83
BRF1-201ENST00000327359 IQSEC2Q5JU85 1478 aa20.23■□□□□ 0.83
BRF1-201ENST00000327359 WASLO00401 505 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
BRF1-201ENST00000327359 SLC26A8Q96RN1 970 aa20.22■□□□□ 0.83
BRF1-201ENST00000327359 C22orf23Q9BZE7 217 aa20.22■□□□□ 0.83
BRF1-201ENST00000327359 PLEKHG5O94827 1062 aa20.21■□□□□ 0.83
BRF1-201ENST00000327359 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa20.21■□□□□ 0.83
BRF1-201ENST00000327359 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
BRF1-201ENST00000327359 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
BRF1-201ENST00000327359 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP20.2■□□□□ 0.82
BRF1-201ENST00000327359 TCP11L2Q8N4U5 519 aa20.2■□□□□ 0.82
BRF1-201ENST00000327359 RUNDC1Q96C34 613 aa20.2■□□□□ 0.82
BRF1-201ENST00000327359 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
BRF1-201ENST00000327359 MRE11P49959 708 aa20.19■□□□□ 0.82
BRF1-201ENST00000327359 C3P01024 1663 aa20.18■□□□□ 0.82
BRF1-201ENST00000327359 EID1Q9Y6B2 187 aa20.18■□□□□ 0.82
BRF1-201ENST00000327359 FBLN1P23142 703 aa20.18■□□□□ 0.82
BRF1-201ENST00000327359 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
BRF1-201ENST00000327359 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
BRF1-201ENST00000327359 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa20.17■□□□□ 0.82
BRF1-201ENST00000327359 MVPQ14764 893 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
BRF1-201ENST00000327359 WDR63Q8IWG1 891 aa20.16■□□□□ 0.82
BRF1-201ENST00000327359 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa20.16■□□□□ 0.82
BRF1-201ENST00000327359 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
BRF1-201ENST00000327359 NUTM2FA1L443 756 aa20.15■□□□□ 0.82
BRF1-201ENST00000327359 GRPEL1Q9HAV7 217 aa20.15■□□□□ 0.82
BRF1-201ENST00000327359 ROBO2Q9HCK4 1378 aa20.15■□□□□ 0.82
BRF1-201ENST00000327359 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa20.15■□□□□ 0.82
BRF1-201ENST00000327359 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa20.14■□□□□ 0.82
BRF1-201ENST00000327359 SIRT1Q96EB6 747 aa20.13■□□□□ 0.81
BRF1-201ENST00000327359 FAM135BQ49AJ0 1406 aa20.13■□□□□ 0.81
BRF1-201ENST00000327359 ERBB4Q15303 1308 aa20.13■□□□□ 0.81
BRF1-201ENST00000327359 DDX11L8A8MPP1 907 aa20.12■□□□□ 0.81
BRF1-201ENST00000327359 HSCBQ8IWL3 235 aa20.12■□□□□ 0.81
BRF1-201ENST00000327359 MYH16Q9H6N6 1097 aa20.12■□□□□ 0.81
BRF1-201ENST00000327359 ZRANB1Q9UGI0 708 aa20.12■□□□□ 0.81
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