RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000327307.11

RRN3-202, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, humanhuman

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Gene RRN3, Length 2,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3-202ENST00000327307 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
RRN3-202ENST00000327307 E2F4Q16254 413 aa8.73□□□□□ -1.01
RRN3-202ENST00000327307 PCGF5Q86SE9 256 aa8.73□□□□□ -1.01
RRN3-202ENST00000327307 PAGR1Q9BTK6 254 aa8.73□□□□□ -1.01
RRN3-202ENST00000327307 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
RRN3-202ENST00000327307 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa8.73□□□□□ -1.01
RRN3-202ENST00000327307 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
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RRN3-202ENST00000327307 NEXNQ0ZGT2 675 aa8.72□□□□□ -1.01
RRN3-202ENST00000327307 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP8.72□□□□□ -1.01
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RRN3-202ENST00000327307 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
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RRN3-202ENST00000327307 RGL3Q3MIN7 710 aa8.71□□□□□ -1.01
RRN3-202ENST00000327307 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
RRN3-202ENST00000327307 VRTNQ9H8Y1 702 aa8.71□□□□□ -1.01
RRN3-202ENST00000327307 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
RRN3-202ENST00000327307 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
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RRN3-202ENST00000327307 TTC30BQ8N4P2 665 aa8.7□□□□□ -1.02
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RRN3-202ENST00000327307 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
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RRN3-202ENST00000327307 SPC25Q9HBM1 224 aa8.69□□□□□ -1.02
RRN3-202ENST00000327307 ABCF2Q9UG63 623 aa8.69□□□□□ -1.02
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RRN3-202ENST00000327307 IFT140Q96RY7 1462 aa8.68□□□□□ -1.02
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RRN3-202ENST00000327307 TCEAL1Q15170 157 aa8.68□□□□□ -1.02
RRN3-202ENST00000327307 TAF3Q5VWG9 929 aa8.68□□□□□ -1.02
RRN3-202ENST00000327307 PARP9Q8IXQ6 854 aa8.68□□□□□ -1.02
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RRN3-202ENST00000327307 TANGO6Q9C0B7 1094 aa8.67□□□□□ -1.02
RRN3-202ENST00000327307 MRVI1Q9Y6F6 885 aa8.67□□□□□ -1.02
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RRN3-202ENST00000327307 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
RRN3-202ENST00000327307 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
RRN3-202ENST00000327307 GLMNQ92990 594 aa8.66□□□□□ -1.02
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RRN3-202ENST00000327307 FMNL3Q8IVF7 1028 aa8.66□□□□□ -1.02
RRN3-202ENST00000327307 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
RRN3-202ENST00000327307 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa8.66□□□□□ -1.02
RRN3-202ENST00000327307 KLF15Q9UIH9 416 aa8.66□□□□□ -1.02
RRN3-202ENST00000327307 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
RRN3-202ENST00000327307 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa8.66□□□□□ -1.02
RRN3-202ENST00000327307 PRDM2Q13029 1718 aa8.66□□□□□ -1.02
RRN3-202ENST00000327307 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa8.65□□□□□ -1.02
RRN3-202ENST00000327307 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
RRN3-202ENST00000327307 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
RRN3-202ENST00000327307 NT5DC4Q86YG4 428 aa8.64□□□□□ -1.03
RRN3-202ENST00000327307 IL17RAQ96F46 866 aa8.64□□□□□ -1.03
RRN3-202ENST00000327307 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
RRN3-202ENST00000327307 PIF1Q9H611 641 aa8.64□□□□□ -1.03
RRN3-202ENST00000327307 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
RRN3-202ENST00000327307 ABCC8Q09428 1581 aa8.64□□□□□ -1.03
RRN3-202ENST00000327307 PRC1O43663 620 aa8.64□□□□□ -1.03
RRN3-202ENST00000327307 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
RRN3-202ENST00000327307 ATG7O95352 703 aa8.64□□□□□ -1.03
RRN3-202ENST00000327307 MAN1A1P33908 653 aa8.64□□□□□ -1.03
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RRN3-202ENST00000327307 YY1AP1Q9H869 796 aa8.64□□□□□ -1.03
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RRN3-202ENST00000327307 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
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RRN3-202ENST00000327307 EPAS1Q99814 870 aa8.63□□□□□ -1.03
RRN3-202ENST00000327307 SMAPO00193 183 aa8.63□□□□□ -1.03
RRN3-202ENST00000327307 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
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RRN3-202ENST00000327307 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
RRN3-202ENST00000327307 IFT122Q9HBG6 1241 aa8.63□□□□□ -1.03
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