RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000327307.11

RRN3-202, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RRN3, Length 2,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3-202ENST00000327307 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
RRN3-202ENST00000327307 E2F4Q16254 413 aa8.73□□□□□ -1.01
RRN3-202ENST00000327307 PCGF5Q86SE9 256 aa8.73□□□□□ -1.01
RRN3-202ENST00000327307 PAGR1Q9BTK6 254 aa8.73□□□□□ -1.01
RRN3-202ENST00000327307 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
RRN3-202ENST00000327307 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa8.73□□□□□ -1.01
RRN3-202ENST00000327307 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
RRN3-202ENST00000327307 VDRP11473 427 aa8.72□□□□□ -1.01
RRN3-202ENST00000327307 NEXNQ0ZGT2 675 aa8.72□□□□□ -1.01
RRN3-202ENST00000327307 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP8.72□□□□□ -1.01
RRN3-202ENST00000327307 PDILTQ8N807 584 aa8.72□□□□□ -1.01
RRN3-202ENST00000327307 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
RRN3-202ENST00000327307 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
RRN3-202ENST00000327307 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.01
RRN3-202ENST00000327307 RGL3Q3MIN7 710 aa8.71□□□□□ -1.01
RRN3-202ENST00000327307 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
RRN3-202ENST00000327307 VRTNQ9H8Y1 702 aa8.71□□□□□ -1.01
RRN3-202ENST00000327307 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
RRN3-202ENST00000327307 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
RRN3-202ENST00000327307 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
RRN3-202ENST00000327307 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
RRN3-202ENST00000327307 NLGN1Q8N2Q7 840 aa8.71□□□□□ -1.02
RRN3-202ENST00000327307 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
RRN3-202ENST00000327307 TBX22Q9Y458 520 aa8.71□□□□□ -1.02
RRN3-202ENST00000327307 PLEKHG6Q3KR16 790 aa8.7□□□□□ -1.02
RRN3-202ENST00000327307 RPAINQ86UA6 219 aa8.7□□□□□ -1.02
RRN3-202ENST00000327307 RAI14Q9P0K7 980 aa8.7□□□□□ -1.02
RRN3-202ENST00000327307 SCINQ9Y6U3 715 aa8.7□□□□□ -1.02
RRN3-202ENST00000327307 NPAS4Q8IUM7 802 aa8.7□□□□□ -1.02
RRN3-202ENST00000327307 TTC30BQ8N4P2 665 aa8.7□□□□□ -1.02
RRN3-202ENST00000327307 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
RRN3-202ENST00000327307 VAMP1P23763 118 aa8.69□□□□□ -1.02
RRN3-202ENST00000327307 CCDC144BQ3MJ40 725 aa8.69□□□□□ -1.02
RRN3-202ENST00000327307 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
RRN3-202ENST00000327307 TRIM34Q9BYJ4 488 aa8.69□□□□□ -1.02
RRN3-202ENST00000327307 SPC25Q9HBM1 224 aa8.69□□□□□ -1.02
RRN3-202ENST00000327307 ABCF2Q9UG63 623 aa8.69□□□□□ -1.02
RRN3-202ENST00000327307 BICDL2A1A5D9 508 aa8.68□□□□□ -1.02
RRN3-202ENST00000327307 CBFA2T2O43439 604 aa8.68□□□□□ -1.02
RRN3-202ENST00000327307 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
RRN3-202ENST00000327307 CEP63Q96MT8 703 aa8.68□□□□□ -1.02
RRN3-202ENST00000327307 IFT140Q96RY7 1462 aa8.68□□□□□ -1.02
RRN3-202ENST00000327307 RECKO95980 971 aa8.68□□□□□ -1.02
RRN3-202ENST00000327307 TDO2P48775 406 aa8.68□□□□□ -1.02
RRN3-202ENST00000327307 RGS3P49796 1198 aa8.68□□□□□ -1.02
RRN3-202ENST00000327307 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
RRN3-202ENST00000327307 TCEAL1Q15170 157 aa8.68□□□□□ -1.02
RRN3-202ENST00000327307 TAF3Q5VWG9 929 aa8.68□□□□□ -1.02
RRN3-202ENST00000327307 PARP9Q8IXQ6 854 aa8.68□□□□□ -1.02
RRN3-202ENST00000327307 BRINP2Q9C0B6 783 aa8.68□□□□□ -1.02
RRN3-202ENST00000327307 RFX1P22670 979 aa8.67□□□□□ -1.02
RRN3-202ENST00000327307 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
RRN3-202ENST00000327307 TANGO6Q9C0B7 1094 aa8.67□□□□□ -1.02
RRN3-202ENST00000327307 MRVI1Q9Y6F6 885 aa8.67□□□□□ -1.02
RRN3-202ENST00000327307 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
RRN3-202ENST00000327307 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
RRN3-202ENST00000327307 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
RRN3-202ENST00000327307 GLMNQ92990 594 aa8.66□□□□□ -1.02
RRN3-202ENST00000327307 CCDC88BA6NC98 1476 aa8.66□□□□□ -1.02
RRN3-202ENST00000327307 CD53P19397 219 aa8.66□□□□□ -1.02
RRN3-202ENST00000327307 UVSSAQ2YD98 709 aa8.66□□□□□ -1.02
RRN3-202ENST00000327307 FMNL3Q8IVF7 1028 aa8.66□□□□□ -1.02
RRN3-202ENST00000327307 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
RRN3-202ENST00000327307 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa8.66□□□□□ -1.02
RRN3-202ENST00000327307 KLF15Q9UIH9 416 aa8.66□□□□□ -1.02
RRN3-202ENST00000327307 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
RRN3-202ENST00000327307 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa8.66□□□□□ -1.02
RRN3-202ENST00000327307 PRDM2Q13029 1718 aa8.66□□□□□ -1.02
RRN3-202ENST00000327307 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa8.65□□□□□ -1.02
RRN3-202ENST00000327307 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
RRN3-202ENST00000327307 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
RRN3-202ENST00000327307 NT5DC4Q86YG4 428 aa8.64□□□□□ -1.03
RRN3-202ENST00000327307 IL17RAQ96F46 866 aa8.64□□□□□ -1.03
RRN3-202ENST00000327307 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
RRN3-202ENST00000327307 PIF1Q9H611 641 aa8.64□□□□□ -1.03
RRN3-202ENST00000327307 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
RRN3-202ENST00000327307 ABCC8Q09428 1581 aa8.64□□□□□ -1.03
RRN3-202ENST00000327307 PRC1O43663 620 aa8.64□□□□□ -1.03
RRN3-202ENST00000327307 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
RRN3-202ENST00000327307 ATG7O95352 703 aa8.64□□□□□ -1.03
RRN3-202ENST00000327307 MAN1A1P33908 653 aa8.64□□□□□ -1.03
RRN3-202ENST00000327307 RASSF7Q02833 373 aa8.64□□□□□ -1.03
RRN3-202ENST00000327307 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa8.64□□□□□ -1.03
RRN3-202ENST00000327307 YY1AP1Q9H869 796 aa8.64□□□□□ -1.03
RRN3-202ENST00000327307 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa8.64□□□□□ -1.03
RRN3-202ENST00000327307 TOPBP1Q92547 1522 aa8.64□□□□□ -1.03
RRN3-202ENST00000327307 S100BP04271 92 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
RRN3-202ENST00000327307 PEX19P40855 299 aa8.63□□□□□ -1.03
RRN3-202ENST00000327307 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa8.63□□□□□ -1.03
RRN3-202ENST00000327307 DRC7Q8IY82 874 aa8.63□□□□□ -1.03
RRN3-202ENST00000327307 RSPH1Q8WYR4 309 aa8.63□□□□□ -1.03
RRN3-202ENST00000327307 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
RRN3-202ENST00000327307 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
RRN3-202ENST00000327307 NEUROD6Q96NK8 337 aa8.63□□□□□ -1.03
RRN3-202ENST00000327307 EPAS1Q99814 870 aa8.63□□□□□ -1.03
RRN3-202ENST00000327307 SMAPO00193 183 aa8.63□□□□□ -1.03
RRN3-202ENST00000327307 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
RRN3-202ENST00000327307 CCDC174Q6PII3 467 aa8.63□□□□□ -1.03
RRN3-202ENST00000327307 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
RRN3-202ENST00000327307 IFT122Q9HBG6 1241 aa8.63□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.4 ms