RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326431.3

TMIE-201, Transcript of transmembrane inner ear, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMIE, Length 1,824 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIE-201ENST00000326431 ZRANB1Q9UGI0 708 aa31.96■■■□□ 2.71
TMIE-201ENST00000326431 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP31.95■■■□□ 2.71
TMIE-201ENST00000326431 SHPRHQ149N8 1683 aa31.94■■■□□ 2.7
TMIE-201ENST00000326431 MTHFSP49914 203 aa31.94■■■□□ 2.7
TMIE-201ENST00000326431 PHF8Q9UPP1 1060 aa31.93■■■□□ 2.7
TMIE-201ENST00000326431 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP31.93■■■□□ 2.7
TMIE-201ENST00000326431 DCCP43146 1447 aa31.9■■■□□ 2.7
TMIE-201ENST00000326431 ESCO1Q5FWF5 840 aa31.89■■■□□ 2.7
TMIE-201ENST00000326431 COG3Q96JB2 828 aa31.89■■■□□ 2.7
TMIE-201ENST00000326431 LRRC7Q96NW7 1537 aa31.89■■■□□ 2.7
TMIE-201ENST00000326431 PIK3C2AO00443 1686 aa31.89■■■□□ 2.7
TMIE-201ENST00000326431 TTC21AQ8NDW8 1320 aa31.89■■■□□ 2.69
TMIE-201ENST00000326431 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP31.89■■■□□ 2.69
TMIE-201ENST00000326431 ADAMTS8Q9UP79 889 aa31.89■■■□□ 2.69
TMIE-201ENST00000326431 INSRP06213 1382 aa31.88■■■□□ 2.69
TMIE-201ENST00000326431 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP31.87■■■□□ 2.69
TMIE-201ENST00000326431 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP31.87■■■□□ 2.69
TMIE-201ENST00000326431 C1orf167Q5SNV9 1468 aa31.87■■■□□ 2.69
TMIE-201ENST00000326431 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa31.87■■■□□ 2.69
TMIE-201ENST00000326431 OVOS2Q6IE36 1432 aa31.87■■■□□ 2.69
TMIE-201ENST00000326431 DMRT2Q9Y5R5 561 aa31.86■■■□□ 2.69
TMIE-201ENST00000326431 ZBED9Q6R2W3 1325 aa31.85■■■□□ 2.69
TMIE-201ENST00000326431 ORAI2Q96SN7 254 aa31.85■■■□□ 2.69
TMIE-201ENST00000326431 KIF1AQ12756 1690 aa31.85■■■□□ 2.69
TMIE-201ENST00000326431 MST1RQ04912 1400 aa31.85■■■□□ 2.69
TMIE-201ENST00000326431 ATF3P18847 181 aa31.84■■■□□ 2.69
TMIE-201ENST00000326431 FBLN1P23142 703 aa31.84■■■□□ 2.69
TMIE-201ENST00000326431 CFAP53Q96M91 514 aa31.84■■■□□ 2.69
TMIE-201ENST00000326431 MSH6P52701 1360 aa31.83■■■□□ 2.69
TMIE-201ENST00000326431 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP31.82■■■□□ 2.69
TMIE-201ENST00000326431 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP31.82■■■□□ 2.68
TMIE-201ENST00000326431 USP54Q70EL1 1684 aa31.81■■■□□ 2.68
TMIE-201ENST00000326431 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa31.81■■■□□ 2.68
TMIE-201ENST00000326431 AATKQ6ZMQ8 1374 aa31.81■■■□□ 2.68
TMIE-201ENST00000326431 POLKQ9UBT6 870 aa31.79■■■□□ 2.68
TMIE-201ENST00000326431 CADPS2Q86UW7 1296 aa31.78■■■□□ 2.68
TMIE-201ENST00000326431 USP31Q70CQ4 1352 aa31.78■■■□□ 2.68
TMIE-201ENST00000326431 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP31.77■■■□□ 2.68
TMIE-201ENST00000326431 PNPLA6Q8IY17 1366 aa31.76■■■□□ 2.67
TMIE-201ENST00000326431 PSME1Q06323 249 aa31.75■■■□□ 2.67
TMIE-201ENST00000326431 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP31.74■■■□□ 2.67
TMIE-201ENST00000326431 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP31.74■■■□□ 2.67
TMIE-201ENST00000326431 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa31.74■■■□□ 2.67
TMIE-201ENST00000326431 FOXO3O43524 673 aa31.73■■■□□ 2.67
TMIE-201ENST00000326431 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP31.72■■■□□ 2.67
TMIE-201ENST00000326431 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP31.72■■■□□ 2.67
TMIE-201ENST00000326431 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP31.71■■■□□ 2.67
TMIE-201ENST00000326431 ABTB2Q8N961 1025 aa31.7■■■□□ 2.67
TMIE-201ENST00000326431 NLRP6P59044 892 aa31.7■■■□□ 2.66
TMIE-201ENST00000326431 CCDC146Q8IYE0 955 aa31.68■■■□□ 2.66
TMIE-201ENST00000326431 PEAK1Q9H792 1746 aa31.68■■■□□ 2.66
TMIE-201ENST00000326431 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP31.68■■■□□ 2.66
TMIE-201ENST00000326431 NUTM2GQ5VZR2 741 aa31.68■■■□□ 2.66
TMIE-201ENST00000326431 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP31.65■■■□□ 2.66
TMIE-201ENST00000326431 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP31.65■■■□□ 2.66
TMIE-201ENST00000326431 SOX12O15370 315 aa31.64■■■□□ 2.66
TMIE-201ENST00000326431 NUDCQ9Y266 331 aa31.64■■■□□ 2.66
TMIE-201ENST00000326431 KRT28Q7Z3Y7 464 aa31.63■■■□□ 2.65
TMIE-201ENST00000326431 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP31.62■■■□□ 2.65
TMIE-201ENST00000326431 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP31.62■■■□□ 2.65
TMIE-201ENST00000326431 ALS2Q96Q42 1657 aa31.62■■■□□ 2.65
TMIE-201ENST00000326431 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP31.61■■■□□ 2.65
TMIE-201ENST00000326431 LTN1O94822 1766 aa31.59■■■□□ 2.65
TMIE-201ENST00000326431 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP31.59■■■□□ 2.65
TMIE-201ENST00000326431 LTBP4Q8N2S1 1624 aa31.58■■■□□ 2.65
TMIE-201ENST00000326431 APAF1O14727 1248 aa31.57■■■□□ 2.64
TMIE-201ENST00000326431 MAP3K19Q56UN5 1328 aa31.57■■■□□ 2.64
TMIE-201ENST00000326431 BRINP3Q76B58 766 aa31.56■■■□□ 2.64
TMIE-201ENST00000326431 RUNDC1Q96C34 613 aa31.56■■■□□ 2.64
TMIE-201ENST00000326431 SLAIN2Q9P270 581 aa31.56■■■□□ 2.64
TMIE-201ENST00000326431 IL13P35225 146 aa31.55■■■□□ 2.64
TMIE-201ENST00000326431 NPHP3Q7Z494 1330 aa31.55■■■□□ 2.64
TMIE-201ENST00000326431 IQSEC2Q5JU85 1478 aa31.55■■■□□ 2.64
TMIE-201ENST00000326431 NFAT5O94916 1531 aa31.55■■■□□ 2.64
TMIE-201ENST00000326431 PXDNQ92626 1479 aa31.54■■■□□ 2.64
TMIE-201ENST00000326431 SBNO1A3KN83 1393 aa31.52■■■□□ 2.64
TMIE-201ENST00000326431 SLIT3O75094 1523 aa31.52■■■□□ 2.64
TMIE-201ENST00000326431 LMOD2Q6P5Q4 547 aa31.51■■■□□ 2.63
TMIE-201ENST00000326431 FLT4P35916 1363 aa31.5■■■□□ 2.63
TMIE-201ENST00000326431 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa31.5■■■□□ 2.63
TMIE-201ENST00000326431 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP31.48■■■□□ 2.63
TMIE-201ENST00000326431 PLEKHF1Q96S99 279 aa31.48■■■□□ 2.63
TMIE-201ENST00000326431 RGPD1P0DJD0 1748 aa31.48■■■□□ 2.63
TMIE-201ENST00000326431 AMPHP49418 695 aa31.47■■■□□ 2.63
TMIE-201ENST00000326431 PDE3BQ13370 1112 aa31.47■■■□□ 2.63
TMIE-201ENST00000326431 TCP11L2Q8N4U5 519 aa31.47■■■□□ 2.63
TMIE-201ENST00000326431 USP19O94966 1318 aa31.46■■■□□ 2.63
TMIE-201ENST00000326431 ZNF521Q96K83 1311 aa31.46■■■□□ 2.63
TMIE-201ENST00000326431 KIF24Q5T7B8 1368 aa31.46■■■□□ 2.63
TMIE-201ENST00000326431 TNS3Q68CZ2 1445 aa31.45■■■□□ 2.63
TMIE-201ENST00000326431 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP31.45■■■□□ 2.63
TMIE-201ENST00000326431 KCNH5Q8NCM2 988 aa31.45■■■□□ 2.63
TMIE-201ENST00000326431 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa31.45■■■□□ 2.63
TMIE-201ENST00000326431 NHSL1Q5SYE7 1610 aa31.45■■■□□ 2.62
TMIE-201ENST00000326431 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP31.45■■■□□ 2.62
TMIE-201ENST00000326431 FCHSD2O94868 740 aa31.44■■■□□ 2.62
TMIE-201ENST00000326431 RSPH6AQ9H0K4 717 aa31.44■■■□□ 2.62
TMIE-201ENST00000326431 NGEFQ8N5V2 710 aa31.43■■■□□ 2.62
TMIE-201ENST00000326431 CDCA7LQ96GN5 454 aa31.43■■■□□ 2.62
TMIE-201ENST00000326431 HMOX1P09601 288 aa31.42■■■□□ 2.62
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