RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320270.3

RRS1-201, Transcript of ribosome biogenesis regulator homolog, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene RRS1, Length 1,706 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRS1-201ENST00000320270 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
RRS1-201ENST00000320270 ATF3P18847 181 aa25.75■■□□□ 1.71
RRS1-201ENST00000320270 FAM9BQ8IZU0 186 aa25.75■■□□□ 1.71
RRS1-201ENST00000320270 MSH6P52701 1360 aa25.74■■□□□ 1.71
RRS1-201ENST00000320270 ESCO1Q5FWF5 840 aa25.73■■□□□ 1.71
RRS1-201ENST00000320270 CADPS2Q86UW7 1296 aa25.72■■□□□ 1.71
RRS1-201ENST00000320270 NME9Q86XW9 330 aa25.72■■□□□ 1.71
RRS1-201ENST00000320270 TTC21AQ8NDW8 1320 aa25.72■■□□□ 1.71
RRS1-201ENST00000320270 C1orf167Q5SNV9 1468 aa25.72■■□□□ 1.71
RRS1-201ENST00000320270 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
RRS1-201ENST00000320270 MST1RQ04912 1400 aa25.7■■□□□ 1.7
RRS1-201ENST00000320270 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
RRS1-201ENST00000320270 COG3Q96JB2 828 aa25.68■■□□□ 1.7
RRS1-201ENST00000320270 ORAI2Q96SN7 254 aa25.67■■□□□ 1.7
RRS1-201ENST00000320270 KIF1AQ12756 1690 aa25.66■■□□□ 1.7
RRS1-201ENST00000320270 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP25.65■■□□□ 1.7
RRS1-201ENST00000320270 MTHFSP49914 203 aa25.65■■□□□ 1.7
RRS1-201ENST00000320270 ZRANB1Q9UGI0 708 aa25.65■■□□□ 1.7
RRS1-201ENST00000320270 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa25.63■■□□□ 1.69
RRS1-201ENST00000320270 OVOS2Q6IE36 1432 aa25.63■■□□□ 1.69
RRS1-201ENST00000320270 PSME1Q06323 249 aa25.63■■□□□ 1.69
RRS1-201ENST00000320270 USP31Q70CQ4 1352 aa25.62■■□□□ 1.69
RRS1-201ENST00000320270 INSRP06213 1382 aa25.61■■□□□ 1.69
RRS1-201ENST00000320270 AATKQ6ZMQ8 1374 aa25.61■■□□□ 1.69
RRS1-201ENST00000320270 CFAP53Q96M91 514 aa25.61■■□□□ 1.69
RRS1-201ENST00000320270 PIK3C2AO00443 1686 aa25.6■■□□□ 1.69
RRS1-201ENST00000320270 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP25.6■■□□□ 1.69
RRS1-201ENST00000320270 FOXO3O43524 673 aa25.59■■□□□ 1.69
RRS1-201ENST00000320270 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP25.58■■□□□ 1.69
RRS1-201ENST00000320270 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
RRS1-201ENST00000320270 USP54Q70EL1 1684 aa25.56■■□□□ 1.68
RRS1-201ENST00000320270 POLKQ9UBT6 870 aa25.56■■□□□ 1.68
RRS1-201ENST00000320270 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
RRS1-201ENST00000320270 LTBP4Q8N2S1 1624 aa25.55■■□□□ 1.68
RRS1-201ENST00000320270 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
RRS1-201ENST00000320270 ABTB2Q8N961 1025 aa25.54■■□□□ 1.68
RRS1-201ENST00000320270 ADAMTS8Q9UP79 889 aa25.54■■□□□ 1.68
RRS1-201ENST00000320270 PNPLA6Q8IY17 1366 aa25.54■■□□□ 1.68
RRS1-201ENST00000320270 NLRP6P59044 892 aa25.54■■□□□ 1.68
RRS1-201ENST00000320270 KRT28Q7Z3Y7 464 aa25.53■■□□□ 1.68
RRS1-201ENST00000320270 SLAIN2Q9P270 581 aa25.53■■□□□ 1.68
RRS1-201ENST00000320270 SHPRHQ149N8 1683 aa25.53■■□□□ 1.68
RRS1-201ENST00000320270 FBLN1P23142 703 aa25.52■■□□□ 1.68
RRS1-201ENST00000320270 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
RRS1-201ENST00000320270 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
RRS1-201ENST00000320270 NPHP3Q7Z494 1330 aa25.51■■□□□ 1.67
RRS1-201ENST00000320270 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
RRS1-201ENST00000320270 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
RRS1-201ENST00000320270 BRINP3Q76B58 766 aa25.49■■□□□ 1.67
RRS1-201ENST00000320270 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa25.49■■□□□ 1.67
RRS1-201ENST00000320270 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
RRS1-201ENST00000320270 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
RRS1-201ENST00000320270 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
RRS1-201ENST00000320270 ZBED9Q6R2W3 1325 aa25.47■■□□□ 1.67
RRS1-201ENST00000320270 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
RRS1-201ENST00000320270 NUTM2GQ5VZR2 741 aa25.46■■□□□ 1.67
RRS1-201ENST00000320270 NUDCQ9Y266 331 aa25.46■■□□□ 1.67
RRS1-201ENST00000320270 SBNO1A3KN83 1393 aa25.45■■□□□ 1.67
RRS1-201ENST00000320270 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
RRS1-201ENST00000320270 PXDNQ92626 1479 aa25.44■■□□□ 1.66
RRS1-201ENST00000320270 ALS2Q96Q42 1657 aa25.43■■□□□ 1.66
RRS1-201ENST00000320270 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
RRS1-201ENST00000320270 SOX12O15370 315 aa25.41■■□□□ 1.66
RRS1-201ENST00000320270 MAP3K19Q56UN5 1328 aa25.4■■□□□ 1.66
RRS1-201ENST00000320270 KCNH5Q8NCM2 988 aa25.4■■□□□ 1.66
RRS1-201ENST00000320270 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.65
RRS1-201ENST00000320270 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP25.39■■□□□ 1.65
RRS1-201ENST00000320270 KIF24Q5T7B8 1368 aa25.39■■□□□ 1.65
RRS1-201ENST00000320270 USP19O94966 1318 aa25.38■■□□□ 1.65
RRS1-201ENST00000320270 LMOD2Q6P5Q4 547 aa25.38■■□□□ 1.65
RRS1-201ENST00000320270 PEAK1Q9H792 1746 aa25.38■■□□□ 1.65
RRS1-201ENST00000320270 TNS3Q68CZ2 1445 aa25.38■■□□□ 1.65
RRS1-201ENST00000320270 SLIT3O75094 1523 aa25.37■■□□□ 1.65
RRS1-201ENST00000320270 NFAT5O94916 1531 aa25.37■■□□□ 1.65
RRS1-201ENST00000320270 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
RRS1-201ENST00000320270 FLT4P35916 1363 aa25.37■■□□□ 1.65
RRS1-201ENST00000320270 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
RRS1-201ENST00000320270 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa25.36■■□□□ 1.65
RRS1-201ENST00000320270 IL13P35225 146 aa25.36■■□□□ 1.65
RRS1-201ENST00000320270 CCDC146Q8IYE0 955 aa25.34■■□□□ 1.65
RRS1-201ENST00000320270 NHSL1Q5SYE7 1610 aa25.34■■□□□ 1.65
RRS1-201ENST00000320270 ARHGEF10O15013 1369 aa25.34■■□□□ 1.65
RRS1-201ENST00000320270 GCP02774 474 aa25.34■■□□□ 1.65
RRS1-201ENST00000320270 AMPHP49418 695 aa25.34■■□□□ 1.65
RRS1-201ENST00000320270 RUNDC1Q96C34 613 aa25.34■■□□□ 1.65
RRS1-201ENST00000320270 RTL1A6NKG5 1358 aa25.32■■□□□ 1.64
RRS1-201ENST00000320270 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa25.32■■□□□ 1.64
RRS1-201ENST00000320270 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa25.32■■□□□ 1.64
RRS1-201ENST00000320270 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
RRS1-201ENST00000320270 NGEFQ8N5V2 710 aa25.31■■□□□ 1.64
RRS1-201ENST00000320270 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
RRS1-201ENST00000320270 LTN1O94822 1766 aa25.3■■□□□ 1.64
RRS1-201ENST00000320270 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
RRS1-201ENST00000320270 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
RRS1-201ENST00000320270 APAF1O14727 1248 aa25.29■■□□□ 1.64
RRS1-201ENST00000320270 FCHSD2O94868 740 aa25.29■■□□□ 1.64
RRS1-201ENST00000320270 HOXC9P31274 260 aa25.29■■□□□ 1.64
RRS1-201ENST00000320270 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa25.28■■□□□ 1.64
RRS1-201ENST00000320270 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
RRS1-201ENST00000320270 ARHGEF25Q86VW2 580 aa25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.3 ms