RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316436.3

LSMEM2-201, Transcript of leucine rich single-pass membrane protein 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LSMEM2, Length 1,494 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSMEM2-201ENST00000316436 PARD3Q8TEW0 1356 aa21.75■■□□□ 1.07
LSMEM2-201ENST00000316436 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
LSMEM2-201ENST00000316436 CGNL1Q0VF96 1302 aa21.73■■□□□ 1.07
LSMEM2-201ENST00000316436 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa21.73■■□□□ 1.07
LSMEM2-201ENST00000316436 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
LSMEM2-201ENST00000316436 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
LSMEM2-201ENST00000316436 NSD2O96028 1365 aa21.72■■□□□ 1.07
LSMEM2-201ENST00000316436 FOXO3O43524 673 aa21.71■■□□□ 1.07
LSMEM2-201ENST00000316436 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
LSMEM2-201ENST00000316436 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP21.71■■□□□ 1.07
LSMEM2-201ENST00000316436 MIER1Q8N108 512 aa21.71■■□□□ 1.07
LSMEM2-201ENST00000316436 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
LSMEM2-201ENST00000316436 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
LSMEM2-201ENST00000316436 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa21.7■■□□□ 1.06
LSMEM2-201ENST00000316436 OVOS2Q6IE36 1432 aa21.7■■□□□ 1.06
LSMEM2-201ENST00000316436 FYB1O15117 783 aa21.7■■□□□ 1.06
LSMEM2-201ENST00000316436 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
LSMEM2-201ENST00000316436 NME9Q86XW9 330 aa21.7■■□□□ 1.06
LSMEM2-201ENST00000316436 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
LSMEM2-201ENST00000316436 ANP32CO43423 234 aa21.68■■□□□ 1.06
LSMEM2-201ENST00000316436 ZRANB1Q9UGI0 708 aa21.68■■□□□ 1.06
LSMEM2-201ENST00000316436 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa21.67■■□□□ 1.06
LSMEM2-201ENST00000316436 GGNBP2Q9H3C7 697 aa21.67■■□□□ 1.06
LSMEM2-201ENST00000316436 TTC21AQ8NDW8 1320 aa21.67■■□□□ 1.06
LSMEM2-201ENST00000316436 NPHP3Q7Z494 1330 aa21.66■■□□□ 1.06
LSMEM2-201ENST00000316436 PSME1Q06323 249 aa21.64■■□□□ 1.06
LSMEM2-201ENST00000316436 USP31Q70CQ4 1352 aa21.64■■□□□ 1.06
LSMEM2-201ENST00000316436 KRT28Q7Z3Y7 464 aa21.64■■□□□ 1.05
LSMEM2-201ENST00000316436 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
LSMEM2-201ENST00000316436 SBNO1A3KN83 1393 aa21.63■■□□□ 1.05
LSMEM2-201ENST00000316436 TNS3Q68CZ2 1445 aa21.63■■□□□ 1.05
LSMEM2-201ENST00000316436 UBAP1LF5GYI3 381 aa21.63■■□□□ 1.05
LSMEM2-201ENST00000316436 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
LSMEM2-201ENST00000316436 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
LSMEM2-201ENST00000316436 PHLPP1O60346 1717 aa21.62■■□□□ 1.05
LSMEM2-201ENST00000316436 RALBP1Q15311 655 aa21.62■■□□□ 1.05
LSMEM2-201ENST00000316436 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
LSMEM2-201ENST00000316436 ABCA3Q99758 1704 aa21.61■■□□□ 1.05
LSMEM2-201ENST00000316436 SLIT3O75094 1523 aa21.61■■□□□ 1.05
LSMEM2-201ENST00000316436 TOM1O60784 492 aa21.6■■□□□ 1.05
LSMEM2-201ENST00000316436 NFAT5O94916 1531 aa21.59■■□□□ 1.05
LSMEM2-201ENST00000316436 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
LSMEM2-201ENST00000316436 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
LSMEM2-201ENST00000316436 MORC1Q86VD1 984 aa21.58■■□□□ 1.05
LSMEM2-201ENST00000316436 PEAK1Q9H792 1746 aa21.57■■□□□ 1.04
LSMEM2-201ENST00000316436 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa21.57■■□□□ 1.04
LSMEM2-201ENST00000316436 PPP2R1AP30153 589 aa21.57■■□□□ 1.04
LSMEM2-201ENST00000316436 CCDC184Q52MB2 194 aa21.57■■□□□ 1.04
LSMEM2-201ENST00000316436 NUTM2GQ5VZR2 741 aa21.57■■□□□ 1.04
LSMEM2-201ENST00000316436 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
LSMEM2-201ENST00000316436 PIP4K2BP78356 416 aa21.56■■□□□ 1.04
LSMEM2-201ENST00000316436 ABTB2Q8N961 1025 aa21.56■■□□□ 1.04
LSMEM2-201ENST00000316436 COG3Q96JB2 828 aa21.56■■□□□ 1.04
LSMEM2-201ENST00000316436 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
LSMEM2-201ENST00000316436 USP19O94966 1318 aa21.55■■□□□ 1.04
LSMEM2-201ENST00000316436 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
LSMEM2-201ENST00000316436 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
LSMEM2-201ENST00000316436 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
LSMEM2-201ENST00000316436 LTN1O94822 1766 aa21.54■■□□□ 1.04
LSMEM2-201ENST00000316436 FBLN1P23142 703 aa21.53■■□□□ 1.04
LSMEM2-201ENST00000316436 NLRP6P59044 892 aa21.53■■□□□ 1.04
LSMEM2-201ENST00000316436 AATKQ6ZMQ8 1374 aa21.53■■□□□ 1.04
LSMEM2-201ENST00000316436 ARHGEF10O15013 1369 aa21.52■■□□□ 1.04
LSMEM2-201ENST00000316436 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
LSMEM2-201ENST00000316436 SHPRHQ149N8 1683 aa21.52■■□□□ 1.03
LSMEM2-201ENST00000316436 CCER2I3L3R5 266 aa21.51■■□□□ 1.03
LSMEM2-201ENST00000316436 NLRP13Q86W25 1043 aa21.51■■□□□ 1.03
LSMEM2-201ENST00000316436 LMOD2Q6P5Q4 547 aa21.49■■□□□ 1.03
LSMEM2-201ENST00000316436 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
LSMEM2-201ENST00000316436 PNPLA6Q8IY17 1366 aa21.47■■□□□ 1.03
LSMEM2-201ENST00000316436 SOX12O15370 315 aa21.46■■□□□ 1.03
LSMEM2-201ENST00000316436 POLKQ9UBT6 870 aa21.46■■□□□ 1.03
LSMEM2-201ENST00000316436 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa21.46■■□□□ 1.03
LSMEM2-201ENST00000316436 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.03
LSMEM2-201ENST00000316436 MTHFSP49914 203 aa21.45■■□□□ 1.02
LSMEM2-201ENST00000316436 CABLES1Q8TDN4 633 aa21.44■■□□□ 1.02
LSMEM2-201ENST00000316436 MRS2Q9HD23 443 aa21.44■■□□□ 1.02
LSMEM2-201ENST00000316436 MAP3K19Q56UN5 1328 aa21.44■■□□□ 1.02
LSMEM2-201ENST00000316436 COL18A1P39060 1754 aa21.43■■□□□ 1.02
LSMEM2-201ENST00000316436 PLEKHG5O94827 1062 aa21.43■■□□□ 1.02
LSMEM2-201ENST00000316436 GCP02774 474 aa21.41■■□□□ 1.02
LSMEM2-201ENST00000316436 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
LSMEM2-201ENST00000316436 INSRP06213 1382 aa21.41■■□□□ 1.02
LSMEM2-201ENST00000316436 RGPD5Q99666 1765 aa21.4■■□□□ 1.02
LSMEM2-201ENST00000316436 LMO7Q8WWI1 1683 aa21.39■■□□□ 1.01
LSMEM2-201ENST00000316436 KCNH5Q8NCM2 988 aa21.39■■□□□ 1.01
LSMEM2-201ENST00000316436 RTL1A6NKG5 1358 aa21.39■■□□□ 1.01
LSMEM2-201ENST00000316436 ABCC6O95255 1503 aa21.38■■□□□ 1.01
LSMEM2-201ENST00000316436 RGPD1P0DJD0 1748 aa21.38■■□□□ 1.01
LSMEM2-201ENST00000316436 FLT4P35916 1363 aa21.38■■□□□ 1.01
LSMEM2-201ENST00000316436 CPDO75976 1380 aa21.37■■□□□ 1.01
LSMEM2-201ENST00000316436 ARHGEF25Q86VW2 580 aa21.37■■□□□ 1.01
LSMEM2-201ENST00000316436 KIF24Q5T7B8 1368 aa21.36■■□□□ 1.01
LSMEM2-201ENST00000316436 HSPA1LP34931 641 aa21.36■■□□□ 1.01
LSMEM2-201ENST00000316436 KIAA0232Q92628 1395 aa21.35■■□□□ 1.01
LSMEM2-201ENST00000316436 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
LSMEM2-201ENST00000316436 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
LSMEM2-201ENST00000316436 HOXC9P31274 260 aa21.33■■□□□ 1.01
LSMEM2-201ENST00000316436 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
LSMEM2-201ENST00000316436 JCADQ9P266 1359 aa21.33■■□□□ 1
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