RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298838.10

PACSIN3-201, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACSIN3, Length 1,843 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-201ENST00000298838 GGNBP2Q9H3C7 697 aa28.02■■■□□ 2.08
PACSIN3-201ENST00000298838 MST1RQ04912 1400 aa28.02■■■□□ 2.08
PACSIN3-201ENST00000298838 C1orf167Q5SNV9 1468 aa28.01■■■□□ 2.08
PACSIN3-201ENST00000298838 KIF1AQ12756 1690 aa28■■■□□ 2.07
PACSIN3-201ENST00000298838 SSH2Q76I76 1423 aa27.99■■■□□ 2.07
PACSIN3-201ENST00000298838 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa27.98■■■□□ 2.07
PACSIN3-201ENST00000298838 NME9Q86XW9 330 aa27.96■■■□□ 2.07
PACSIN3-201ENST00000298838 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP27.96■■■□□ 2.07
PACSIN3-201ENST00000298838 ORAI2Q96SN7 254 aa27.96■■■□□ 2.07
PACSIN3-201ENST00000298838 TTC21AQ8NDW8 1320 aa27.95■■■□□ 2.07
PACSIN3-201ENST00000298838 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP27.95■■■□□ 2.06
PACSIN3-201ENST00000298838 LTBP4Q8N2S1 1624 aa27.93■■■□□ 2.06
PACSIN3-201ENST00000298838 COG3Q96JB2 828 aa27.91■■■□□ 2.06
PACSIN3-201ENST00000298838 PIK3C2AO00443 1686 aa27.89■■■□□ 2.06
PACSIN3-201ENST00000298838 PSME1Q06323 249 aa27.89■■■□□ 2.06
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM9BQ8IZU0 186 aa27.89■■■□□ 2.06
PACSIN3-201ENST00000298838 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.05
PACSIN3-201ENST00000298838 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
PACSIN3-201ENST00000298838 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa27.88■■■□□ 2.05
PACSIN3-201ENST00000298838 OVOS2Q6IE36 1432 aa27.88■■■□□ 2.05
PACSIN3-201ENST00000298838 FOXO3O43524 673 aa27.88■■■□□ 2.05
PACSIN3-201ENST00000298838 ZRANB1Q9UGI0 708 aa27.86■■■□□ 2.05
PACSIN3-201ENST00000298838 USP54Q70EL1 1684 aa27.84■■■□□ 2.05
PACSIN3-201ENST00000298838 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP27.84■■■□□ 2.05
PACSIN3-201ENST00000298838 USP31Q70CQ4 1352 aa27.83■■■□□ 2.05
PACSIN3-201ENST00000298838 MTHFSP49914 203 aa27.83■■■□□ 2.05
PACSIN3-201ENST00000298838 SLAIN2Q9P270 581 aa27.83■■■□□ 2.05
PACSIN3-201ENST00000298838 AATKQ6ZMQ8 1374 aa27.82■■■□□ 2.04
PACSIN3-201ENST00000298838 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP27.82■■■□□ 2.04
PACSIN3-201ENST00000298838 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
PACSIN3-201ENST00000298838 ABTB2Q8N961 1025 aa27.81■■■□□ 2.04
PACSIN3-201ENST00000298838 CFAP53Q96M91 514 aa27.8■■■□□ 2.04
PACSIN3-201ENST00000298838 NPHP3Q7Z494 1330 aa27.79■■■□□ 2.04
PACSIN3-201ENST00000298838 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP27.79■■■□□ 2.04
PACSIN3-201ENST00000298838 BRINP3Q76B58 766 aa27.78■■■□□ 2.04
PACSIN3-201ENST00000298838 NLRP6P59044 892 aa27.78■■■□□ 2.04
PACSIN3-201ENST00000298838 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP27.78■■■□□ 2.04
PACSIN3-201ENST00000298838 KRT28Q7Z3Y7 464 aa27.78■■■□□ 2.04
PACSIN3-201ENST00000298838 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP27.75■■■□□ 2.03
PACSIN3-201ENST00000298838 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP27.75■■■□□ 2.03
PACSIN3-201ENST00000298838 POLKQ9UBT6 870 aa27.75■■■□□ 2.03
PACSIN3-201ENST00000298838 SHPRHQ149N8 1683 aa27.73■■■□□ 2.03
PACSIN3-201ENST00000298838 FBLN1P23142 703 aa27.73■■■□□ 2.03
PACSIN3-201ENST00000298838 NUTM2GQ5VZR2 741 aa27.73■■■□□ 2.03
PACSIN3-201ENST00000298838 ALS2Q96Q42 1657 aa27.72■■■□□ 2.03
PACSIN3-201ENST00000298838 PXDNQ92626 1479 aa27.72■■■□□ 2.03
PACSIN3-201ENST00000298838 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP27.72■■■□□ 2.03
PACSIN3-201ENST00000298838 INSRP06213 1382 aa27.71■■■□□ 2.03
PACSIN3-201ENST00000298838 SBNO1A3KN83 1393 aa27.71■■■□□ 2.03
PACSIN3-201ENST00000298838 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP27.71■■■□□ 2.03
PACSIN3-201ENST00000298838 PNPLA6Q8IY17 1366 aa27.7■■■□□ 2.02
PACSIN3-201ENST00000298838 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP27.7■■■□□ 2.02
PACSIN3-201ENST00000298838 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP27.7■■■□□ 2.02
PACSIN3-201ENST00000298838 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa27.69■■■□□ 2.02
PACSIN3-201ENST00000298838 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP27.69■■■□□ 2.02
PACSIN3-201ENST00000298838 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP27.69■■■□□ 2.02
PACSIN3-201ENST00000298838 NHSL1Q5SYE7 1610 aa27.68■■■□□ 2.02
PACSIN3-201ENST00000298838 SOX12O15370 315 aa27.67■■■□□ 2.02
PACSIN3-201ENST00000298838 TNS3Q68CZ2 1445 aa27.67■■■□□ 2.02
PACSIN3-201ENST00000298838 LMOD2Q6P5Q4 547 aa27.67■■■□□ 2.02
PACSIN3-201ENST00000298838 ADAMTS8Q9UP79 889 aa27.67■■■□□ 2.02
PACSIN3-201ENST00000298838 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP27.66■■■□□ 2.02
PACSIN3-201ENST00000298838 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP27.66■■■□□ 2.02
PACSIN3-201ENST00000298838 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa27.64■■■□□ 2.02
PACSIN3-201ENST00000298838 SLIT3O75094 1523 aa27.63■■■□□ 2.01
PACSIN3-201ENST00000298838 NUDCQ9Y266 331 aa27.63■■■□□ 2.01
PACSIN3-201ENST00000298838 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP27.63■■■□□ 2.01
PACSIN3-201ENST00000298838 PEAK1Q9H792 1746 aa27.63■■■□□ 2.01
PACSIN3-201ENST00000298838 KCNH5Q8NCM2 988 aa27.62■■■□□ 2.01
PACSIN3-201ENST00000298838 NFAT5O94916 1531 aa27.62■■■□□ 2.01
PACSIN3-201ENST00000298838 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP27.62■■■□□ 2.01
PACSIN3-201ENST00000298838 MAP3K19Q56UN5 1328 aa27.62■■■□□ 2.01
PACSIN3-201ENST00000298838 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa27.62■■■□□ 2.01
PACSIN3-201ENST00000298838 ARHGEF10O15013 1369 aa27.61■■■□□ 2.01
PACSIN3-201ENST00000298838 USP19O94966 1318 aa27.61■■■□□ 2.01
PACSIN3-201ENST00000298838 LTN1O94822 1766 aa27.6■■■□□ 2.01
PACSIN3-201ENST00000298838 KIF24Q5T7B8 1368 aa27.6■■■□□ 2.01
PACSIN3-201ENST00000298838 IQSEC2Q5JU85 1478 aa27.59■■■□□ 2.01
PACSIN3-201ENST00000298838 FLT4P35916 1363 aa27.58■■■□□ 2.01
PACSIN3-201ENST00000298838 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP27.57■■■□□ 2
PACSIN3-201ENST00000298838 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
PACSIN3-201ENST00000298838 TOM1O60784 492 aa27.56■■■□□ 2
PACSIN3-201ENST00000298838 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP27.56■■■□□ 2
PACSIN3-201ENST00000298838 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP27.56■■■□□ 2
PACSIN3-201ENST00000298838 ZBED9Q6R2W3 1325 aa27.56■■■□□ 2
PACSIN3-201ENST00000298838 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP27.56■■■□□ 2
PACSIN3-201ENST00000298838 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
PACSIN3-201ENST00000298838 GCP02774 474 aa27.55■■■□□ 2
PACSIN3-201ENST00000298838 AMPHP49418 695 aa27.55■■■□□ 2
PACSIN3-201ENST00000298838 RTL1A6NKG5 1358 aa27.55■■■□□ 2
PACSIN3-201ENST00000298838 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa27.53■■■□□ 2
PACSIN3-201ENST00000298838 PLEKHG5O94827 1062 aa27.52■■■□□ 2
PACSIN3-201ENST00000298838 IL13P35225 146 aa27.52■■■□□ 2
PACSIN3-201ENST00000298838 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa27.52■■■□□ 2
PACSIN3-201ENST00000298838 CCDC146Q8IYE0 955 aa27.5■■□□□ 1.99
PACSIN3-201ENST00000298838 HOXC9P31274 260 aa27.49■■□□□ 1.99
PACSIN3-201ENST00000298838 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP27.48■■□□□ 1.99
PACSIN3-201ENST00000298838 UBAP1LF5GYI3 381 aa27.46■■□□□ 1.99
PACSIN3-201ENST00000298838 ARHGEF25Q86VW2 580 aa27.46■■□□□ 1.99
PACSIN3-201ENST00000298838 RUNDC1Q96C34 613 aa27.46■■□□□ 1.99
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