RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000291906.4

PKN3-201, Transcript of protein kinase N3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKN3, Length 3,375 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN3-201ENST00000291906 MSH5O43196 834 aa21.84■■□□□ 1.09
PKN3-201ENST00000291906 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa21.84■■□□□ 1.09
PKN3-201ENST00000291906 COG3Q96JB2 828 aa21.84■■□□□ 1.09
PKN3-201ENST00000291906 TMPOP42166 694 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
PKN3-201ENST00000291906 ROBO2Q9HCK4 1378 aa21.83■■□□□ 1.08
PKN3-201ENST00000291906 TNNQ9UQP3 1299 aa21.82■■□□□ 1.08
PKN3-201ENST00000291906 PRKAR2BP31323 418 aa21.82■■□□□ 1.08
PKN3-201ENST00000291906 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa21.82■■□□□ 1.08
PKN3-201ENST00000291906 RGS3P49796 1198 aa21.81■■□□□ 1.08
PKN3-201ENST00000291906 MYH16Q9H6N6 1097 aa21.81■■□□□ 1.08
PKN3-201ENST00000291906 PRR36Q9H6K5 1346 aa21.8■■□□□ 1.08
PKN3-201ENST00000291906 WDR63Q8IWG1 891 aa21.8■■□□□ 1.08
PKN3-201ENST00000291906 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
PKN3-201ENST00000291906 SHPRHQ149N8 1683 aa21.8■■□□□ 1.08
PKN3-201ENST00000291906 RARSP54136 660 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
PKN3-201ENST00000291906 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
PKN3-201ENST00000291906 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
PKN3-201ENST00000291906 PLEKHG5O94827 1062 aa21.77■■□□□ 1.08
PKN3-201ENST00000291906 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
PKN3-201ENST00000291906 USP32Q8NFA0 1604 aa21.76■■□□□ 1.07
PKN3-201ENST00000291906 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
PKN3-201ENST00000291906 PLEKHF1Q96S99 279 aa21.76■■□□□ 1.07
PKN3-201ENST00000291906 ACEP12821 1306 aa21.75■■□□□ 1.07
PKN3-201ENST00000291906 FANCIQ9NVI1 1328 aa21.75■■□□□ 1.07
PKN3-201ENST00000291906 TRIM35Q9UPQ4 493 aa21.74■■□□□ 1.07
PKN3-201ENST00000291906 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
PKN3-201ENST00000291906 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
PKN3-201ENST00000291906 PHACTR3Q96KR7 559 aa21.74■■□□□ 1.07
PKN3-201ENST00000291906 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa21.74■■□□□ 1.07
PKN3-201ENST00000291906 PDE4AP27815 886 aa21.73■■□□□ 1.07
PKN3-201ENST00000291906 NLRP1Q9C000 1473 aa21.73■■□□□ 1.07
PKN3-201ENST00000291906 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa21.73■■□□□ 1.07
PKN3-201ENST00000291906 SMC4Q9NTJ3 1288 aa21.73■■□□□ 1.07
PKN3-201ENST00000291906 DLC1Q96QB1 1528 aa21.73■■□□□ 1.07
PKN3-201ENST00000291906 NUTM2GQ5VZR2 741 aa21.72■■□□□ 1.07
PKN3-201ENST00000291906 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
PKN3-201ENST00000291906 CCDC27Q2M243 656 aa21.71■■□□□ 1.07
PKN3-201ENST00000291906 C14orf37Q86TY3 774 aa21.71■■□□□ 1.07
PKN3-201ENST00000291906 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
PKN3-201ENST00000291906 ANP32EQ9BTT0 268 aa21.71■■□□□ 1.07
PKN3-201ENST00000291906 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
PKN3-201ENST00000291906 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
PKN3-201ENST00000291906 RLBP1P12271 317 aa21.7■■□□□ 1.06
PKN3-201ENST00000291906 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
PKN3-201ENST00000291906 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
PKN3-201ENST00000291906 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
PKN3-201ENST00000291906 FCHSD2O94868 740 aa21.7■■□□□ 1.06
PKN3-201ENST00000291906 ATP7BP35670 1465 aa21.7■■□□□ 1.06
PKN3-201ENST00000291906 IQSEC2Q5JU85 1478 aa21.7■■□□□ 1.06
PKN3-201ENST00000291906 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa21.69■■□□□ 1.06
PKN3-201ENST00000291906 UBR1Q8IWV7 1749 aa21.68■■□□□ 1.06
PKN3-201ENST00000291906 RSPH6AQ9H0K4 717 aa21.68■■□□□ 1.06
PKN3-201ENST00000291906 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
PKN3-201ENST00000291906 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa21.68■■□□□ 1.06
PKN3-201ENST00000291906 FAM135BQ49AJ0 1406 aa21.68■■□□□ 1.06
PKN3-201ENST00000291906 PDE3AQ14432 1141 aa21.67■■□□□ 1.06
PKN3-201ENST00000291906 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
PKN3-201ENST00000291906 IGHDP01880 384 aa21.67■■□□□ 1.06
PKN3-201ENST00000291906 KCNA6P17658 529 aa21.67■■□□□ 1.06
PKN3-201ENST00000291906 SIRT1Q96EB6 747 aa21.67■■□□□ 1.06
PKN3-201ENST00000291906 CPS1P31327 1500 aa21.66■■□□□ 1.06
PKN3-201ENST00000291906 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
PKN3-201ENST00000291906 DCTN1Q14203 1278 aa21.66■■□□□ 1.06
PKN3-201ENST00000291906 PTPRUQ92729 1446 aa21.66■■□□□ 1.06
PKN3-201ENST00000291906 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
PKN3-201ENST00000291906 AEBP1Q8IUX7 1158 aa21.65■■□□□ 1.06
PKN3-201ENST00000291906 SSH1Q8WYL5 1049 aa21.65■■□□□ 1.06
PKN3-201ENST00000291906 IL13P35225 146 aa21.64■■□□□ 1.06
PKN3-201ENST00000291906 TBX22Q9Y458 520 aa21.64■■□□□ 1.06
PKN3-201ENST00000291906 FAM83GA6ND36 823 aa21.64■■□□□ 1.05
PKN3-201ENST00000291906 KDM2BQ8NHM5 1336 aa21.64■■□□□ 1.05
PKN3-201ENST00000291906 SULT6B1Q6IMI4 303 aa21.64■■□□□ 1.05
PKN3-201ENST00000291906 MED14O60244 1454 aa21.63■■□□□ 1.05
PKN3-201ENST00000291906 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa21.63■■□□□ 1.05
PKN3-201ENST00000291906 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa21.63■■□□□ 1.05
PKN3-201ENST00000291906 PNPLA6Q8IY17 1366 aa21.62■■□□□ 1.05
PKN3-201ENST00000291906 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
PKN3-201ENST00000291906 ZBTB7CA1YPR0 619 aa21.62■■□□□ 1.05
PKN3-201ENST00000291906 NFE2L2Q16236 605 aa21.62■■□□□ 1.05
PKN3-201ENST00000291906 BACH2Q9BYV9 841 aa21.62■■□□□ 1.05
PKN3-201ENST00000291906 ITPRIPQ8IWB1 547 aa21.61■■□□□ 1.05
PKN3-201ENST00000291906 KIF20BQ96Q89 1820 aa21.61■■□□□ 1.05
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PKN3-201ENST00000291906 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
PKN3-201ENST00000291906 MS4A1P11836 297 aa21.59■■□□□ 1.05
PKN3-201ENST00000291906 BCL11AQ9H165 835 aa21.59■■□□□ 1.05
PKN3-201ENST00000291906 C3P01024 1663 aa21.59■■□□□ 1.05
PKN3-201ENST00000291906 NLRP6P59044 892 aa21.58■■□□□ 1.05
PKN3-201ENST00000291906 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
PKN3-201ENST00000291906 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
PKN3-201ENST00000291906 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa21.58■■□□□ 1.04
PKN3-201ENST00000291906 PLEKHG3A1L390 1219 aa21.57■■□□□ 1.04
PKN3-201ENST00000291906 AMPHP49418 695 aa21.57■■□□□ 1.04
PKN3-201ENST00000291906 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
PKN3-201ENST00000291906 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
PKN3-201ENST00000291906 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa21.56■■□□□ 1.04
PKN3-201ENST00000291906 ANKLE2Q86XL3 938 aa21.56■■□□□ 1.04
PKN3-201ENST00000291906 LRRC7Q96NW7 1537 aa21.56■■□□□ 1.04
PKN3-201ENST00000291906 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa21.56■■□□□ 1.04
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