RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261169.10

LMO3-201, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 3,810 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-201ENST00000261169 MVPQ14764 893 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
LMO3-201ENST00000261169 WASHC4Q2M389 1173 aa6.72□□□□□ -1.33
LMO3-201ENST00000261169 DCAF8Q5TAQ9 597 aa6.72□□□□□ -1.33
LMO3-201ENST00000261169 RUFY2Q8WXA3 655 aa6.72□□□□□ -1.33
LMO3-201ENST00000261169 SLC52A1Q9NWF4 448 aa6.72□□□□□ -1.33
LMO3-201ENST00000261169 NSD3Q9BZ95 1437 aa6.72□□□□□ -1.33
LMO3-201ENST00000261169 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
LMO3-201ENST00000261169 NCOA1Q15788 1441 aa6.71□□□□□ -1.33
LMO3-201ENST00000261169 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.33
LMO3-201ENST00000261169 ATP2B1P20020 1258 aa6.71□□□□□ -1.33
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LMO3-201ENST00000261169 CHMP4CQ96CF2 233 aa6.71□□□□□ -1.33
LMO3-201ENST00000261169 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.33
LMO3-201ENST00000261169 CCDC61Q9Y6R9 512 aa6.71□□□□□ -1.33
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LMO3-201ENST00000261169 FYB1O15117 783 aa6.71□□□□□ -1.34
LMO3-201ENST00000261169 ZNF592Q92610 1267 aa6.71□□□□□ -1.34
LMO3-201ENST00000261169 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
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LMO3-201ENST00000261169 PTMSP20962 102 aa6.71□□□□□ -1.34
LMO3-201ENST00000261169 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
LMO3-201ENST00000261169 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa6.71□□□□□ -1.34
LMO3-201ENST00000261169 FAM83GA6ND36 823 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-201ENST00000261169 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
LMO3-201ENST00000261169 CCDC30Q5VVM6 783 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-201ENST00000261169 FSD1Q9BTV5 496 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-201ENST00000261169 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
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LMO3-201ENST00000261169 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
LMO3-201ENST00000261169 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-201ENST00000261169 FIBPO43427 364 aa6.7□□□□□ -1.34
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LMO3-201ENST00000261169 GNAI3P08754 354 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-201ENST00000261169 VPS53Q5VIR6 699 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-201ENST00000261169 DUSP27Q5VZP5 1158 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-201ENST00000261169 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
LMO3-201ENST00000261169 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
LMO3-201ENST00000261169 TNNQ9UQP3 1299 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-201ENST00000261169 EFCAB5A4FU69 1503 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-201ENST00000261169 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-201ENST00000261169 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa6.69□□□□□ -1.34
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LMO3-201ENST00000261169 STK3Q13188 491 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-201ENST00000261169 CHD1LQ86WJ1 897 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-201ENST00000261169 WDR63Q8IWG1 891 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-201ENST00000261169 GAS2L2Q8NHY3 880 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-201ENST00000261169 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
LMO3-201ENST00000261169 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa6.69□□□□□ -1.34
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LMO3-201ENST00000261169 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
LMO3-201ENST00000261169 FAM13BQ9NYF5 915 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-201ENST00000261169 GRIN2AQ12879 1464 aa6.69□□□□□ -1.34
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LMO3-201ENST00000261169 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-201ENST00000261169 DISP3Q9P2K9 1392 aa6.69□□□□□ -1.34
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LMO3-201ENST00000261169 IGHDP01880 384 aa6.68□□□□□ -1.34
LMO3-201ENST00000261169 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa6.68□□□□□ -1.34
LMO3-201ENST00000261169 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
LMO3-201ENST00000261169 FMNL2Q96PY5 1086 aa6.68□□□□□ -1.34
LMO3-201ENST00000261169 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa6.68□□□□□ -1.34
LMO3-201ENST00000261169 PHF14O94880 888 aa6.68□□□□□ -1.34
LMO3-201ENST00000261169 NUCB2P80303 420 aa6.68□□□□□ -1.34
LMO3-201ENST00000261169 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
LMO3-201ENST00000261169 TSHZ3Q63HK5 1081 aa6.68□□□□□ -1.34
LMO3-201ENST00000261169 NFXL1Q6ZNB6 911 aa6.68□□□□□ -1.34
LMO3-201ENST00000261169 NUTM1Q86Y26 1132 aa6.68□□□□□ -1.34
LMO3-201ENST00000261169 ERC2O15083 957 aa6.68□□□□□ -1.34
LMO3-201ENST00000261169 NFE2L2Q16236 605 aa6.68□□□□□ -1.34
LMO3-201ENST00000261169 RNF20Q5VTR2 975 aa6.68□□□□□ -1.34
LMO3-201ENST00000261169 FCHSD2O94868 740 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-201ENST00000261169 TRDNQ13061 729 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-201ENST00000261169 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
LMO3-201ENST00000261169 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
LMO3-201ENST00000261169 ROCK1Q13464 1354 aa6.67□□□□□ -1.34
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LMO3-201ENST00000261169 TRIM27P14373 513 aa6.67□□□□□ -1.34
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LMO3-201ENST00000261169 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
LMO3-201ENST00000261169 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
LMO3-201ENST00000261169 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
LMO3-201ENST00000261169 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-201ENST00000261169 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
LMO3-201ENST00000261169 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
LMO3-201ENST00000261169 ZRANB1Q9UGI0 708 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-201ENST00000261169 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
LMO3-201ENST00000261169 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-201ENST00000261169 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-201ENST00000261169 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-201ENST00000261169 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-201ENST00000261169 GPRASP1Q5JY77 1395 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-201ENST00000261169 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
LMO3-201ENST00000261169 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
LMO3-201ENST00000261169 NASPP49321 788 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
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