RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000254667.7

PTPRE-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type E, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRE, Length 5,331 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRE-201ENST00000254667 GNAI2P04899 355 aa22.91■■□□□ 1.26
PTPRE-201ENST00000254667 FSD1Q9BTV5 496 aa22.91■■□□□ 1.26
PTPRE-201ENST00000254667 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa22.91■■□□□ 1.26
PTPRE-201ENST00000254667 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
PTPRE-201ENST00000254667 CUL7Q14999 1698 aa22.91■■□□□ 1.26
PTPRE-201ENST00000254667 CCT4P50991 539 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
PTPRE-201ENST00000254667 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
PTPRE-201ENST00000254667 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
PTPRE-201ENST00000254667 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
PTPRE-201ENST00000254667 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa22.89■■□□□ 1.25
PTPRE-201ENST00000254667 SPG7Q9UQ90 795 aa22.89■■□□□ 1.25
PTPRE-201ENST00000254667 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
PTPRE-201ENST00000254667 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa22.89■■□□□ 1.25
PTPRE-201ENST00000254667 NAIPQ13075 1403 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPRE-201ENST00000254667 MCM2P49736 904 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPRE-201ENST00000254667 XBP1P17861 261 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPRE-201ENST00000254667 BRMS1Q9HCU9 246 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRE-201ENST00000254667 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
PTPRE-201ENST00000254667 ZNF428Q96B54 188 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRE-201ENST00000254667 SLC4A2P04920 1241 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRE-201ENST00000254667 CCDC27Q2M243 656 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRE-201ENST00000254667 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
PTPRE-201ENST00000254667 SART3Q15020 963 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
PTPRE-201ENST00000254667 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
PTPRE-201ENST00000254667 SASS6Q6UVJ0 657 aa22.85■■□□□ 1.25
PTPRE-201ENST00000254667 CCDC70Q6NSX1 233 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRE-201ENST00000254667 FCHSD2O94868 740 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRE-201ENST00000254667 CABP4P57796 275 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRE-201ENST00000254667 STRN4Q9NRL3 753 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRE-201ENST00000254667 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa22.83■■□□□ 1.25
PTPRE-201ENST00000254667 ARHGEF11O15085 1522 aa22.83■■□□□ 1.25
PTPRE-201ENST00000254667 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
PTPRE-201ENST00000254667 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
PTPRE-201ENST00000254667 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRE-201ENST00000254667 SLC26A8Q96RN1 970 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRE-201ENST00000254667 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRE-201ENST00000254667 CCDC61Q9Y6R9 512 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRE-201ENST00000254667 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRE-201ENST00000254667 CD109Q6YHK3 1445 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRE-201ENST00000254667 MAP3K1Q13233 1512 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRE-201ENST00000254667 RABEP1Q15276 862 aa22.8■■□□□ 1.24
PTPRE-201ENST00000254667 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa22.8■■□□□ 1.24
PTPRE-201ENST00000254667 CCDC158Q5M9N0 1113 aa22.8■■□□□ 1.24
PTPRE-201ENST00000254667 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
PTPRE-201ENST00000254667 KIF14Q15058 1648 aa22.79■■□□□ 1.24
PTPRE-201ENST00000254667 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
PTPRE-201ENST00000254667 PDCP20941 246 aa22.79■■□□□ 1.24
PTPRE-201ENST00000254667 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
PTPRE-201ENST00000254667 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
PTPRE-201ENST00000254667 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
PTPRE-201ENST00000254667 GRIN2AQ12879 1464 aa22.78■■□□□ 1.24
PTPRE-201ENST00000254667 PDE4CQ08493 712 aa22.77■■□□□ 1.24
PTPRE-201ENST00000254667 KCNH5Q8NCM2 988 aa22.77■■□□□ 1.24
PTPRE-201ENST00000254667 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
PTPRE-201ENST00000254667 FYB1O15117 783 aa22.77■■□□□ 1.23
PTPRE-201ENST00000254667 LRRCC1Q9C099 1032 aa22.77■■□□□ 1.23
PTPRE-201ENST00000254667 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP22.77■■□□□ 1.23
PTPRE-201ENST00000254667 NSD3Q9BZ95 1437 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRE-201ENST00000254667 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
PTPRE-201ENST00000254667 CNNM1Q9NRU3 951 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRE-201ENST00000254667 MVPQ14764 893 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
PTPRE-201ENST00000254667 ARID3AQ99856 593 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRE-201ENST00000254667 BCAR3O75815 825 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRE-201ENST00000254667 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
PTPRE-201ENST00000254667 PRDM11Q9NQV5 511 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRE-201ENST00000254667 TTC39AQ5SRH9 613 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRE-201ENST00000254667 GPS2Q13227 327 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRE-201ENST00000254667 NFE2L2Q16236 605 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRE-201ENST00000254667 ADGRL1O94910 1474 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRE-201ENST00000254667 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
PTPRE-201ENST00000254667 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRE-201ENST00000254667 C1orf115Q9H7X2 142 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRE-201ENST00000254667 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
PTPRE-201ENST00000254667 ABCC5O15440 1437 aa22.73■■□□□ 1.23
PTPRE-201ENST00000254667 NEK4P51957 841 aa22.73■■□□□ 1.23
PTPRE-201ENST00000254667 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
PTPRE-201ENST00000254667 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
PTPRE-201ENST00000254667 FAM177BA6PVY3 158 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRE-201ENST00000254667 MBD3O95983 291 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRE-201ENST00000254667 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRE-201ENST00000254667 FOSBP53539 338 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRE-201ENST00000254667 OLFM4Q6UX06 510 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRE-201ENST00000254667 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
PTPRE-201ENST00000254667 AKNAQ7Z591 1439 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRE-201ENST00000254667 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
PTPRE-201ENST00000254667 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
PTPRE-201ENST00000254667 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
PTPRE-201ENST00000254667 RSPH6AQ9H0K4 717 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRE-201ENST00000254667 ANKRD1Q15327 319 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRE-201ENST00000254667 BTBD11A6QL63 1104 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPRE-201ENST00000254667 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPRE-201ENST00000254667 SDF4Q9BRK5 362 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPRE-201ENST00000254667 PRM3Q9NNZ6 103 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPRE-201ENST00000254667 WDR97A6NE52 1622 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPRE-201ENST00000254667 HOMER1Q86YM7 354 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPRE-201ENST00000254667 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
PTPRE-201ENST00000254667 NACAP1Q9BZK3 213 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRE-201ENST00000254667 BICRAQ9NZM4 1560 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRE-201ENST00000254667 TMPOP42166 694 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
PTPRE-201ENST00000254667 PPP6R1Q9UPN7 881 aa22.68■■□□□ 1.22
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