RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640421.1

SPIN3-238, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5

Gene SPIN3, Length 1,872 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-238	ENST00000640421	C10orf88	Q9H8K7	445 aa		18.26	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	TMEM248	Q9NWD8	314 aa		18.26	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	HEPACAM2	A8MVW5	462 aa		18.25	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	WASH4P	A8MWX3	477 aa		18.25	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	LIAS	O43766	372 aa		18.25	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	PHF2	O75151	1096 aa		18.25	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	SLU7	O95391	586 aa	Known RBP	18.25	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	ZFX	P17010	805 aa	Predicted RBP	18.25	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	RABGAP1L	Q5R372	815 aa		18.25	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	ARHGAP12	Q8IWW6	846 aa		18.25	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	TDRD5	Q8NAT2	981 aa	Known RBP	18.25	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	OR52K2	Q8NGK3	314 aa		18.25	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	SLC35B2	Q8TB61	432 aa		18.25	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	MAGOHB	Q96A72	148 aa	Known RBP	18.25	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	NECTIN4	Q96NY8	510 aa		18.25	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	OLFM3	Q96PB7	478 aa		18.25	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	KRT12	Q99456	494 aa		18.25	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	PLA2G2F	Q9BZM2	168 aa		18.25	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	LRRC19	Q9H756	370 aa		18.25	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	GOLGA6L10	A0A0M3HER8	536 aa		18.24	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	MBTPS2	O43462	519 aa		18.24	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	CCNG2	Q16589	344 aa		18.24	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	FAM182A	Q5T1J6	154 aa		18.24	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	PARM1	Q6UWI2	310 aa		18.24	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	VIT	Q6UXI7	678 aa		18.24	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	TPGS1	Q6ZTW0	290 aa		18.24	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	FGF14	Q92915	247 aa		18.24	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	DDX50	Q9BQ39	737 aa	Known RBP	18.24	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	TRIO	O75962	3097 aa		18.24	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	NYNRIN	Q9P2P1	1898 aa	Known RBP	18.24	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	CCDC188	H7C350	402 aa		18.24	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	CHKA	P35790	457 aa		18.24	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	COIL	P38432	576 aa	Predicted RBP	18.24	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	OASL	Q15646	514 aa	Known RBP	18.24	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	AFMID	Q63HM1	303 aa		18.24	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		18.24	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	ZC3H18	Q86VM9	953 aa	Known RBP	18.24	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	TMEM25	Q86YD3	366 aa		18.24	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	BPIFB1	Q8TDL5	484 aa		18.24	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	TMA16	Q96EY4	203 aa	Known RBP	18.24	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	ZFYVE19	Q96K21	471 aa		18.24	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	KXD1	Q9BQD3	176 aa		18.24	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	PRDM16	Q9HAZ2	1276 aa		18.24	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	PLK2	Q9NYY3	685 aa		18.24	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	CHD5	Q8TDI0	1954 aa		18.24	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	VCAN	P13611	3396 aa		18.23	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421		A0A1B0GVM2	712 aa		18.23	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	TCAF2	A6NFQ2	919 aa		18.23	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	TBL1X	O60907	577 aa		18.23	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	HOXD9	P28356	352 aa	Predicted RBP	18.23	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	NR2C2	P49116	596 aa		18.23	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	NUMB	P49757	651 aa		18.23	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	EIF3E	P60228	445 aa	Known RBP	18.23	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	SMAD4	Q13485	552 aa	Known RBP	18.23	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	BYSL	Q13895	437 aa	Known RBP	18.23	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	FYB2	Q5VWT5	728 aa		18.23	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	CCDC137	Q6PK04	289 aa	Known RBP	18.23	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	ADGRG2	Q8IZP9	1017 aa		18.23	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	TTC13	Q8NBP0	860 aa		18.23	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	WFDC5	Q8TCV5	224 aa		18.23	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	HLA-C	Q95604	372 aa		18.23	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	RPGRIP1	Q96KN7	1286 aa		18.23	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	RPP25	Q9BUL9	199 aa	Known RBP	18.23	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	ZFP14	Q9HCL3	533 aa		18.23	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	AMACR	Q9UHK6	382 aa		18.23	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	CLEC4E	Q9ULY5	219 aa		18.23	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	OR1E1	P30953	314 aa		18.22	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	CDH4	P55283	916 aa		18.22	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	ARHGAP36	Q6ZRI8	547 aa		18.22	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	UMODL1-AS1	Q8N2C9	162 aa		18.22	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	MMGT1	Q8N4V1	131 aa		18.22	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	HJURP	Q8NCD3	748 aa	Predicted RBP	18.22	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	OSCP1	Q8WVF1	389 aa		18.22	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	NKD2	Q969F2	451 aa	Predicted RBP	18.22	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	LGMN	Q99538	433 aa		18.22	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	SLC39A8	Q9C0K1	460 aa		18.22	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	OBP2A	Q9NY56	170 aa		18.22	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	TBC1D14	Q9P2M4	693 aa		18.22	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	CLDN11	O75508	207 aa		18.22	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	RBP3	P10745	1247 aa		18.22	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	CHRNA3	P32297	505 aa		18.22	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	SERPINB6	P35237	376 aa		18.22	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	NRL	P54845	237 aa		18.22	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	EML3	Q32P44	896 aa		18.22	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	FSCB	Q5H9T9	825 aa		18.22	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	TTC39B	Q5VTQ0	682 aa	Predicted RBP	18.22	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	RNF43	Q68DV7	783 aa		18.22	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	CXorf57	Q6NSI4	855 aa	Known RBP	18.22	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	DRICH1	Q6PGQ1	229 aa	Predicted RBP	18.22	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	RHBDF2	Q6PJF5	856 aa		18.22	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	CHST9	Q7L1S5	443 aa		18.22	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	DDI1	Q8WTU0	396 aa		18.22	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	DEPDC1B	Q8WUY9	529 aa		18.22	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	TMEM121	Q9BTD3	319 aa		18.22	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	SPHK2	Q9NRA0	654 aa		18.22	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	DUS2	Q9NX74	493 aa	Known RBP	18.22	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	EPS15L1	Q9UBC2	864 aa		18.22	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	SHROOM3	Q8TF72	1996 aa		18.21	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	MCF2L	O15068	1137 aa		18.21	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	ARSA	P15289	507 aa		18.21	■□□□□ 0.51

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