RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626236.2

SGMS1-211, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 1,013 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-211ENST00000626236 TDGQ13569 410 aa8.77□□□□□ -1.01
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SGMS1-211ENST00000626236 LLGL1Q15334 1064 aa8.77□□□□□ -1.01
SGMS1-211ENST00000626236 C5orf22Q49AR2 442 aa8.77□□□□□ -1.01
SGMS1-211ENST00000626236 ALFQ53S48 1182 aa8.77□□□□□ -1.01
SGMS1-211ENST00000626236 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa8.77□□□□□ -1.01
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SGMS1-211ENST00000626236 GTSE1Q9NYZ3 720 aa8.77□□□□□ -1.01
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SGMS1-211ENST00000626236 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
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SGMS1-211ENST00000626236 KCNK17Q96T54 332 aa8.76□□□□□ -1.01
SGMS1-211ENST00000626236 HEMGNQ9BXL5 484 aa8.76□□□□□ -1.01
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SGMS1-211ENST00000626236 ZNF487B1APH4 448 aa8.75□□□□□ -1.01
SGMS1-211ENST00000626236 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
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SGMS1-211ENST00000626236 DCLK1O15075 740 aa8.75□□□□□ -1.01
SGMS1-211ENST00000626236 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
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SGMS1-211ENST00000626236 RHOCP08134 193 aa8.75□□□□□ -1.01
SGMS1-211ENST00000626236 SRFP11831 508 aa8.75□□□□□ -1.01
SGMS1-211ENST00000626236 OR1E1P30953 314 aa8.75□□□□□ -1.01
SGMS1-211ENST00000626236 GJA4P35212 333 aa8.75□□□□□ -1.01
SGMS1-211ENST00000626236 SLC6A11P48066 632 aa8.75□□□□□ -1.01
SGMS1-211ENST00000626236 SOX9P48436 509 aa8.75□□□□□ -1.01
SGMS1-211ENST00000626236 COPS2P61201 443 aa8.75□□□□□ -1.01
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
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