RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590061.1

SMAD4-210, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD4, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-210ENST00000590061 CFAP69A5D8W1 941 aa7.57□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 HIDE1A8MVS5 230 aa7.57□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 DAPK3O43293 454 aa7.57□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 PRMT3O60678 531 aa7.57□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 GRAP2O75791 330 aa7.57□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 STK10O94804 968 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 MAP3K6O95382 1288 aa7.57□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 SLU7O95391 586 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 SEC24AO95486 1093 aa7.57□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 IGLV3-25P01717 112 aa7.57□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 KRT1P04264 644 aa7.57□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 MYOGP15173 224 aa7.57□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 ATF6P18850 670 aa7.57□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 HDCP19113 662 aa7.57□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 TGM2P21980 687 aa7.57□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 ACTN2P35609 894 aa7.57□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 CHKAP35790 457 aa7.57□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 FLT3P36888 993 aa7.57□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 AVPR1AP37288 418 aa7.57□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 MTHFRP42898 656 aa7.57□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 PEX5P50542 639 aa7.57□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 CACNA2D1P54289 1103 aa7.57□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 SLC7A9P82251 487 aa7.57□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF33AQ06730 810 aa7.57□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 NME3Q13232 169 aa7.57□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 LONRF2Q1L5Z9 754 aa7.57□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 C2CD6Q53TS8 623 aa7.57□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 RABGAP1LQ5R372 815 aa7.57□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 CEP128Q6ZU80 1094 aa7.57□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 BNIPLQ7Z465 357 aa7.57□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 RASGEF1CQ8N431 466 aa7.57□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 EMC1Q8N766 993 aa7.57□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 JOSD2Q8TAC2 188 aa7.57□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 FAM71BQ8TC56 605 aa7.57□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 GIPC2Q8TF65 315 aa7.57□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 EXOC4Q96A65 974 aa7.57□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 COL26A1Q96A83 441 aa7.57□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 LRRC45Q96CN5 670 aa7.57□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 CFAP57Q96MR6 1250 aa7.57□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 LPIN3Q9BQK8 851 aa7.57□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 OSBPL8Q9BZF1 889 aa7.57□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 FAM129AQ9BZQ8 928 aa7.57□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 TASP1Q9H6P5 420 aa7.57□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 GMIPQ9P107 970 aa7.57□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 TBC1D14Q9P2M4 693 aa7.57□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 TJP2Q9UDY2 1190 aa7.57□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa7.57□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 MRFAP1Q9Y605 127 aa7.57□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa7.56□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa7.56□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 E2F8A0AVK6 867 aa7.56□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 EFCAB8A8MWE9 144 aa7.56□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 KCNU1A8MYU2 1149 aa7.56□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 KRIT1O00522 736 aa7.56□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 ENC1O14682 589 aa7.56□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 VNN2O95498 520 aa7.56□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 GAS8O95995 478 aa7.56□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 CYBBP04839 570 aa7.56□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 FYNP06241 537 aa7.56□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 CKMP06732 381 aa7.56□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 TCF3P15923 654 aa7.56□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 EPB42P16452 691 aa7.56□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 KDELR1P24390 212 aa7.56□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 DNAJB1P25685 340 aa7.56□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 GABRR2P28476 465 aa7.56□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 STIP1P31948 543 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 CHRNA3P32297 505 aa7.56□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 NRIP1P48552 1158 aa7.56□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 FNTAP49354 379 aa7.56□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 CDH6P55285 790 aa7.56□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 HDAC4P56524 1084 aa7.56□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 AMPD2Q01433 879 aa7.56□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 EFEMP1Q12805 493 aa7.56□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 XRCC4Q13426 336 aa7.56□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 TAF5Q15542 800 aa7.56□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 CCNG2Q16589 344 aa7.56□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 TAZQ16635 292 aa7.56□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 CDO1Q16878 200 aa7.56□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 MPP7Q5T2T1 576 aa7.56□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 ADGRF1Q5T601 910 aa7.56□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa7.56□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 SCD5Q86SK9 330 aa7.56□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa7.56□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 AUTS2Q8WXX7 1259 aa7.56□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP7.56□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 EDEM1Q92611 657 aa7.56□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms