RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588972.1

ATG4D-210, Transcript of autophagy related 4D cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4D, Length 632 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4D-210ENST00000588972 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 ARHGAP6O43182 974 aa8.36□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 THAP12O43422 761 aa8.36□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 TDP2O95551 362 aa8.36□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 MMP1P03956 469 aa8.36□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 CYP3A4P08684 503 aa8.36□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 GJB2P29033 226 aa8.36□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 HOXC8P31273 242 aa8.36□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 CTNNB1P35222 781 aa8.36□□□□□ -1.07
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ATG4D-210ENST00000588972 NOMO3P69849 1222 aa8.36□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 CTBP1Q13363 440 aa8.36□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 TRIM29Q14134 588 aa8.36□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 GALNT17Q6IS24 598 aa8.36□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 KCNV1Q6PIU1 500 aa8.36□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 METTL7BQ6UX53 244 aa8.36□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 CYP26C1Q6V0L0 522 aa8.36□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa8.36□□□□□ -1.07
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ATG4D-210ENST00000588972 PLA2G4DQ86XP0 818 aa8.36□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 NME8Q8N427 588 aa8.36□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 FAM184AQ8NB25 1140 aa8.36□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 PRSS33Q8NF86 280 aa8.36□□□□□ -1.07
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ATG4D-210ENST00000588972 MYOCQ99972 504 aa8.36□□□□□ -1.07
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ATG4D-210ENST00000588972 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa8.36□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 LMAN2LQ9H0V9 348 aa8.36□□□□□ -1.07
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ATG4D-210ENST00000588972 LRFN1Q9P244 771 aa8.36□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 SLC23A1Q9UHI7 598 aa8.36□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 KMT2EQ8IZD2 1858 aa8.36□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 DCHS1Q96JQ0 3298 aa8.35□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa8.35□□□□□ -1.07
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ATG4D-210ENST00000588972 C17orf102A2RUQ5 167 aa8.35□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 CLCA1A8K7I4 914 aa8.35□□□□□ -1.07
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ATG4D-210ENST00000588972 C5orf67F2Z3F1 127 aa8.35□□□□□ -1.07
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ATG4D-210ENST00000588972 TBX10O75333 385 aa8.35□□□□□ -1.07
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ATG4D-210ENST00000588972 NEDD9Q14511 834 aa8.35□□□□□ -1.07
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ATG4D-210ENST00000588972 UNC13DQ70J99 1090 aa8.35□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 REXO1L1PQ8IX06 675 aa8.35□□□□□ -1.07
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ATG4D-210ENST00000588972 ATP6V0A1Q93050 837 aa8.35□□□□□ -1.07
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ATG4D-210ENST00000588972 CDHR1Q96JP9 859 aa8.35□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 GPR20Q99678 358 aa8.35□□□□□ -1.07
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ATG4D-210ENST00000588972 OR10A2Q9H208 303 aa8.35□□□□□ -1.07
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ATG4D-210ENST00000588972 TMEM221A6NGB7 291 aa8.34□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 M0R296 226 aa8.34□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 ACKR2O00590 384 aa8.34□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 AREL1O15033 823 aa8.34□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 NCAM2O15394 837 aa8.34□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 SLC37A4O43826 429 aa8.34□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 CCNE2O96020 404 aa8.34□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 JUNP05412 331 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa8.34□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa8.34□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 RAP2AP10114 183 aa8.34□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 CIITAP33076 1130 aa8.34□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 SERPINF1P36955 418 aa8.34□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 ITGA8P53708 1063 aa8.34□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 RRADP55042 308 aa8.34□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 BPIFB4P59827 614 aa8.34□□□□□ -1.07
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